Protein–RNA interactions for Protein: O14813

PHOX2A, Paired mesoderm homeobox protein 2A, humanhuman

Predictions only

Length 284 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHOX2AO14813 PKD1P6-NPIPP1-202ENST00000605794 2902 ntTSL 2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
PHOX2AO14813 SIX1-203ENST00000554986 1959 ntTSL 3 BASIC11.57□□□□□ -0.56
PHOX2AO14813 CERNA1-202ENST00000560518 1972 ntTSL 2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
PHOX2AO14813 EIF1B-AS1-201ENST00000625390 1958 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
PHOX2AO14813 DTX1-201ENST00000257600 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
PHOX2AO14813 AL445209.1-201ENST00000607269 3491 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
PHOX2AO14813 GRIN1-205ENST00000371555 4003 ntTSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
PHOX2AO14813 CCDC90B-202ENST00000455220 1550 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
PHOX2AO14813 MPP2-214ENST00000523501 2121 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
PHOX2AO14813 SEZ6L-201ENST00000248933 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
PHOX2AO14813 SEZ6L-210ENST00000629590 3215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
PHOX2AO14813 TPGS2-202ENST00000383056 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
PHOX2AO14813 SAP30BP-202ENST00000355423 2439 ntTSL 2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
PHOX2AO14813 DNMT1-203ENST00000540357 4916 ntTSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
PHOX2AO14813 AFF2-204ENST00000370458 1488 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
PHOX2AO14813 KIF17-203ENST00000400463 3731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
PHOX2AO14813 EBF1-201ENST00000313708 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
PHOX2AO14813 ATE1-208ENST00000540606 5165 ntTSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
PHOX2AO14813 DUSP13-203ENST00000372702 1778 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
PHOX2AO14813 ZNF32-AS3-201ENST00000458063 1932 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
PHOX2AO14813 VENTX-201ENST00000325980 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
PHOX2AO14813 CAD-202ENST00000403525 6900 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
PHOX2AO14813 NOS3-201ENST00000297494 4388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
PHOX2AO14813 DYNC1LI1-201ENST00000273130 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
PHOX2AO14813 FLT4-212ENST00000619105 3806 ntTSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
PHOX2AO14813 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
PHOX2AO14813 TMEM136-202ENST00000375095 4143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
PHOX2AO14813 PLA2G4B-201ENST00000452633 2985 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
PHOX2AO14813 SLC52A1-203ENST00000512825 2989 ntTSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
PHOX2AO14813 PRR15-201ENST00000319694 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
PHOX2AO14813 PDZD4-209ENST00000544474 3418 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
PHOX2AO14813 APBB3-202ENST00000356738 1804 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
PHOX2AO14813 FAM237B-201ENST00000637645 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
PHOX2AO14813 GSTM3-201ENST00000256594 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
PHOX2AO14813 PTK7-205ENST00000352931 4023 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
PHOX2AO14813 MON1B-201ENST00000248248 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
PHOX2AO14813 MLXIP-208ENST00000538698 5097 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
PHOX2AO14813 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
PHOX2AO14813 F2-201ENST00000311907 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
PHOX2AO14813 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC11.56□□□□□ -0.56
PHOX2AO14813 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
PHOX2AO14813 KIF12-201ENST00000374118 2001 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
PHOX2AO14813 SMAGP-202ENST00000398453 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
PHOX2AO14813 RPL5P21-201ENST00000404620 815 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
PHOX2AO14813 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
PHOX2AO14813 THRB-AS1-202ENST00000438096 702 ntTSL 3 BASIC11.56□□□□□ -0.56
PHOX2AO14813 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
PHOX2AO14813 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
PHOX2AO14813 USP17L7-201ENST00000530447 2022 ntAPPRIS P1 BASIC11.56□□□□□ -0.56
PHOX2AO14813 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC11.56□□□□□ -0.56
PHOX2AO14813 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC11.56□□□□□ -0.56
PHOX2AO14813 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
PHOX2AO14813 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.56□□□□□ -0.56
PHOX2AO14813 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC11.56□□□□□ -0.56
PHOX2AO14813 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
PHOX2AO14813 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
PHOX2AO14813 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
PHOX2AO14813 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
PHOX2AO14813 TCOF1-207ENST00000504761 4467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
PHOX2AO14813 SPIN3-207ENST00000638386 4461 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
PHOX2AO14813 ENO2-205ENST00000535366 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
PHOX2AO14813 AC107375.1-201ENST00000564464 2231 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
PHOX2AO14813 ARMCX3-203ENST00000471229 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
PHOX2AO14813 EPN3-201ENST00000268933 4071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
PHOX2AO14813 BBS1-202ENST00000393994 1790 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
PHOX2AO14813 HERC6-202ENST00000273960 3473 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
PHOX2AO14813 MSI2-206ENST00000579180 1635 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
PHOX2AO14813 AC006262.1-203ENST00000598170 1634 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
PHOX2AO14813 LENG8-201ENST00000326764 3991 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
PHOX2AO14813 ZDHHC4-206ENST00000405731 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
PHOX2AO14813 NEK4-202ENST00000383721 2576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
PHOX2AO14813 MYO1D-206ENST00000579584 3500 ntTSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
PHOX2AO14813 TRMT61A-202ENST00000389749 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
PHOX2AO14813 CCDC13-201ENST00000310232 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
PHOX2AO14813 MVP-202ENST00000395353 2925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
PHOX2AO14813 SLC11A1-201ENST00000233202 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
PHOX2AO14813 GATAD2A-203ENST00000404158 5776 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
PHOX2AO14813 CCT6B-201ENST00000314144 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
PHOX2AO14813 DHX58-201ENST00000251642 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
PHOX2AO14813 IGHG1-202ENST00000390548 2619 ntAPPRIS P5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
PHOX2AO14813 ACTL8-202ENST00000617065 1670 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
PHOX2AO14813 CHRNA2-207ENST00000520933 2497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
PHOX2AO14813 COPS7B-223ENST00000611614 2468 ntTSL 3 BASIC11.55□□□□□ -0.56
PHOX2AO14813 TPO-202ENST00000345913 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
PHOX2AO14813 RPS5-202ENST00000596046 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
PHOX2AO14813 STRA6-222ENST00000616000 2843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
PHOX2AO14813 KLHL13-209ENST00000545703 3322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
PHOX2AO14813 CALB1-201ENST00000265431 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
PHOX2AO14813 TLX1NB-202ENST00000445873 1862 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
PHOX2AO14813 KAT5-216ENST00000534650 1875 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
PHOX2AO14813 INCENP-201ENST00000278849 3698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
PHOX2AO14813 ABCA17P-202ENST00000469908 4188 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
PHOX2AO14813 HRC-201ENST00000252825 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
PHOX2AO14813 PLTP-201ENST00000354050 1731 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
PHOX2AO14813 HCG27-201ENST00000383331 1720 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
PHOX2AO14813 RAB3IP-202ENST00000362025 2055 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
PHOX2AO14813 CLCNKB-202ENST00000375679 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
PHOX2AO14813 RBM14-202ENST00000393979 1426 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
PHOX2AO14813 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
PHOX2AO14813 CELF4-218ENST00000591287 3757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.6 ms