Protein–RNA interactions for Protein: O14595

CTDSP2, Carboxy-terminal domain RNA polymerase II polypeptide A small phosphatase 2, humanhuman

Predictions only

Length 271 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDSP2O14595 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
CTDSP2O14595 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CTDSP2O14595 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CTDSP2O14595 AL049612.1-201ENST00000427017 694 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
CTDSP2O14595 AL049569.1-201ENST00000446261 636 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
CTDSP2O14595 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
CTDSP2O14595 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
CTDSP2O14595 FBXL21-206ENST00000495672 589 ntTSL 4 BASIC13.14□□□□□ -0.31
CTDSP2O14595 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CTDSP2O14595 DYNLL1-204ENST00000548214 616 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
CTDSP2O14595 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC13.14□□□□□ -0.31
CTDSP2O14595 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
CTDSP2O14595 TICRR-202ENST00000560985 6656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CTDSP2O14595 PUDP-202ENST00000412827 1376 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
CTDSP2O14595 OCRL-202ENST00000371113 5162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CTDSP2O14595 AC138969.2-201ENST00000532739 9932 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
CTDSP2O14595 FBP1-201ENST00000375326 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CTDSP2O14595 CD209-207ENST00000593660 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CTDSP2O14595 TCEAL4-209ENST00000472745 1571 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
CTDSP2O14595 PUF60-209ENST00000527197 1559 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
CTDSP2O14595 RNF43-205ENST00000581868 2610 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
CTDSP2O14595 DUSP14-204ENST00000613659 1559 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
CTDSP2O14595 ADGRG3-201ENST00000333493 2728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CTDSP2O14595 PI4KA-201ENST00000255882 6752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CTDSP2O14595 SGCE-202ENST00000415788 1871 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
CTDSP2O14595 CSGALNACT1-211ENST00000522854 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CTDSP2O14595 DOCK4-206ENST00000437633 6212 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CTDSP2O14595 HSPA8P5-201ENST00000456928 2069 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
CTDSP2O14595 C16orf82-201ENST00000418886 2268 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
CTDSP2O14595 TARDBP-201ENST00000240185 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CTDSP2O14595 SC5D-201ENST00000264027 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CTDSP2O14595 GPAT4-201ENST00000396987 6298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CTDSP2O14595 P2RY1-201ENST00000305097 6747 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CTDSP2O14595 FOS-202ENST00000535987 1402 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CTDSP2O14595 AC025580.3-201ENST00000617932 1424 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
CTDSP2O14595 SLC22A6-204ENST00000458333 1521 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CTDSP2O14595 OIT3-202ENST00000622652 1602 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CTDSP2O14595 GINS3-203ENST00000426538 1728 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CTDSP2O14595 EVA1A-202ENST00000393913 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CTDSP2O14595 ZBTB14-202ENST00000400143 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CTDSP2O14595 TCN2-202ENST00000405742 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CTDSP2O14595 LINC00926-202ENST00000502027 2141 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CTDSP2O14595 GPA33-201ENST00000367868 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CTDSP2O14595 PLPP6-201ENST00000381883 2944 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CTDSP2O14595 NGEF-201ENST00000264051 3215 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CTDSP2O14595 KLHL8-201ENST00000273963 5621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CTDSP2O14595 ZFAND3-201ENST00000287218 3366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CTDSP2O14595 TRIM46-205ENST00000392451 3195 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CTDSP2O14595 EBF3-201ENST00000355311 2993 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CTDSP2O14595 NEK4-202ENST00000383721 2576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CTDSP2O14595 RHOH-220ENST00000615083 2156 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CTDSP2O14595 NCLP1-201ENST00000445357 1963 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
CTDSP2O14595 PPP2R1B-204ENST00000426998 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CTDSP2O14595 KHSRPP1-201ENST00000427983 1768 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
CTDSP2O14595 SHROOM1-203ENST00000378679 4019 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CTDSP2O14595 GPHB5-201ENST00000314140 393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CTDSP2O14595 TNNC2-202ENST00000372557 780 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CTDSP2O14595 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CTDSP2O14595 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CTDSP2O14595 FAM19A5-204ENST00000406880 833 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CTDSP2O14595 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CTDSP2O14595 SNHG11-207ENST00000434729 1058 ntTSL 4 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CTDSP2O14595 HIST3H2BA-201ENST00000436555 524 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
CTDSP2O14595 AC099552.3-201ENST00000454149 367 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CTDSP2O14595 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CTDSP2O14595 AC087276.3-201ENST00000526220 787 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CTDSP2O14595 AC004803.1-204ENST00000543290 512 ntTSL 4 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CTDSP2O14595 CSRP2-202ENST00000546966 754 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CTDSP2O14595 CD63-210ENST00000550776 870 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CTDSP2O14595 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
CTDSP2O14595 GIPC1-213ENST00000591349 1068 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CTDSP2O14595 AC074044.1-201ENST00000609673 707 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
CTDSP2O14595 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CTDSP2O14595 APBA2-212ENST00000561069 3138 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CTDSP2O14595 AGFG1-204ENST00000409315 2912 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CTDSP2O14595 CICP1-201ENST00000416803 2410 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
CTDSP2O14595 EWSAT1-201ENST00000415504 2214 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CTDSP2O14595 AP001999.1-201ENST00000513405 3684 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CTDSP2O14595 KY-202ENST00000503669 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CTDSP2O14595 PHLDB2-203ENST00000412622 5996 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CTDSP2O14595 RNF167-201ENST00000262482 1915 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CTDSP2O14595 DPP10-201ENST00000310323 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CTDSP2O14595 SPG11-210ENST00000558319 6426 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CTDSP2O14595 NCLN-201ENST00000246117 4005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CTDSP2O14595 BAIAP2-202ENST00000321300 2879 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CTDSP2O14595 ST7L-207ENST00000369669 1743 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CTDSP2O14595 GPR35-205ENST00000438013 3821 ntAPPRIS P3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CTDSP2O14595 MYOM3-202ENST00000374434 5804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CTDSP2O14595 CDPF1-204ENST00000404744 1541 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CTDSP2O14595 GUCY1B3-205ENST00000505764 2456 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CTDSP2O14595 CCDC142-202ENST00000393965 3406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CTDSP2O14595 CHID1-215ENST00000528581 1431 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CTDSP2O14595 MED15-204ENST00000406969 3210 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CTDSP2O14595 MYO1C-218ENST00000575158 4804 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CTDSP2O14595 PIK3R6-204ENST00000619866 3041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CTDSP2O14595 CC2D1A-201ENST00000318003 3581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CTDSP2O14595 SUN2-201ENST00000405018 4022 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CTDSP2O14595 TCHH-201ENST00000368804 6900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
CTDSP2O14595 KRT32-201ENST00000225899 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CTDSP2O14595 GTF2IRD1P1-202ENST00000457166 2426 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.5 ms