Protein–RNA interactions for Protein: O00592

PODXL, Podocalyxin, humanhuman

Predictions only

Length 558 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PODXLO00592 TNXB-209ENST00000613214 6842 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PODXLO00592 RGPD6-202ENST00000330331 2848 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PODXLO00592 RGPD8-202ENST00000330575 2848 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PODXLO00592 LPAR1-203ENST00000374431 3637 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PODXLO00592 TMEM201-202ENST00000340381 3776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PODXLO00592 FGF1-201ENST00000337706 1469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PODXLO00592 FGFR1OP-201ENST00000349556 1484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PODXLO00592 SPATA7-203ENST00000393545 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PODXLO00592 SPG21-203ENST00000433215 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PODXLO00592 LRRTM1-201ENST00000295057 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PODXLO00592 ADORA1-201ENST00000309502 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PODXLO00592 APBB1-219ENST00000608704 2095 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PODXLO00592 AP000350.4-201ENST00000433835 788 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PODXLO00592 VGLL4-214ENST00000451674 938 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PODXLO00592 AP003171.2-201ENST00000528208 925 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
PODXLO00592 CCKBR-204ENST00000531712 463 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PODXLO00592 AC012568.1-201ENST00000558463 472 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PODXLO00592 AC106820.3-201ENST00000561653 397 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
PODXLO00592 SMIM24-203ENST00000587847 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PODXLO00592 AC138466.3-201ENST00000619983 221 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
PODXLO00592 B4GALNT3-201ENST00000266383 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PODXLO00592 PEX11B-201ENST00000369306 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PODXLO00592 MAPK7-202ENST00000308406 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PODXLO00592 CEP170B-203ENST00000453495 6813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PODXLO00592 PGBD5-201ENST00000391860 10961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PODXLO00592 AMZ1-201ENST00000312371 5516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PODXLO00592 AL162231.1-201ENST00000421828 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PODXLO00592 TEX28-203ENST00000617225 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PODXLO00592 ELFN2-201ENST00000402918 8361 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PODXLO00592 SLC43A2-202ENST00000412517 1658 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PODXLO00592 FOXRED1-213ENST00000532125 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PODXLO00592 RASA4-201ENST00000262940 5605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PODXLO00592 MCM7-202ENST00000343023 1968 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PODXLO00592 PARP10-201ENST00000313028 3497 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PODXLO00592 OPA1-208ENST00000392438 6340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PODXLO00592 RIPK1-201ENST00000259808 4160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PODXLO00592 PTBP1-203ENST00000356948 3598 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PODXLO00592 ZNF324B-201ENST00000336614 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PODXLO00592 ZNF30-202ENST00000439785 2651 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PODXLO00592 SLC52A3-205ENST00000632431 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PODXLO00592 ST3GAL3-208ENST00000361392 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PODXLO00592 TBC1D3G-201ENST00000569055 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PODXLO00592 TBC1D3H-201ENST00000610350 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PODXLO00592 TBC1D3L-202ENST00000617678 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PODXLO00592 PPM1F-202ENST00000397495 1778 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PODXLO00592 RMND1-205ENST00000622845 1484 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PODXLO00592 AFF4-201ENST00000265343 9552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PODXLO00592 SALL3-205ENST00000575389 3996 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PODXLO00592 DNM1-203ENST00000393594 3245 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PODXLO00592 HIPK4-201ENST00000291823 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PODXLO00592 TIGD4-201ENST00000304337 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PODXLO00592 RASSF5-201ENST00000577571 3496 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PODXLO00592 AC245052.4-201ENST00000452097 4158 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PODXLO00592 POU5F1-204ENST00000471529 1723 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PODXLO00592 PTK7-210ENST00000471863 2412 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PODXLO00592 PXYLP1-201ENST00000286353 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PODXLO00592 EIF3G-201ENST00000253108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PODXLO00592 BATF-201ENST00000286639 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PODXLO00592 ZNF138-201ENST00000307355 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PODXLO00592 UBE2G2-201ENST00000330942 721 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PODXLO00592 PNRC1-203ENST00000369472 816 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PODXLO00592 HIST1H2AH-201ENST00000377459 387 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PODXLO00592 MOGAT3-202ENST00000379423 933 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PODXLO00592 PEX13-202ENST00000401576 1108 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PODXLO00592 BTBD6P1-201ENST00000412176 1267 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
PODXLO00592 AL450469.1-201ENST00000418953 461 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PODXLO00592 EPDR1-203ENST00000425345 947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PODXLO00592 ADAMTSL1-210ENST00000431052 824 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PODXLO00592 MTX1P1-201ENST00000440904 838 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
PODXLO00592 TAF8-204ENST00000456846 1293 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PODXLO00592 AC022494.1-201ENST00000466044 728 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
PODXLO00592 SLC12A8-207ENST00000469902 2989 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PODXLO00592 CRYGN-205ENST00000491928 698 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PODXLO00592 CCDC153-204ENST00000503566 1295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PODXLO00592 KCNK16-205ENST00000507712 889 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PODXLO00592 AC011365.2-201ENST00000520041 810 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PODXLO00592 C11orf98-201ENST00000524958 654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PODXLO00592 FAM8A2P-201ENST00000528813 1142 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
PODXLO00592 AC005865.1-202ENST00000543036 641 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PODXLO00592 IGHV3OR16-9-202ENST00000558425 288 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PODXLO00592 AP003096.1-203ENST00000564469 563 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PODXLO00592 RN7SL713P-201ENST00000582127 302 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
PODXLO00592 PRCD-204ENST00000586148 630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PODXLO00592 CYGB-203ENST00000589145 788 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PODXLO00592 AC073413.1-201ENST00000603927 732 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
PODXLO00592 ABBA01031663.1-201ENST00000635630 790 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
PODXLO00592 PCBP2-202ENST00000359462 1814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PODXLO00592 DMTN-205ENST00000432128 2508 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PODXLO00592 CKM-201ENST00000221476 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PODXLO00592 CMPK1-203ENST00000371873 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PODXLO00592 GRK6-203ENST00000393576 2792 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PODXLO00592 PRR23C-201ENST00000413199 2791 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PODXLO00592 SEC24D-202ENST00000419654 2786 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PODXLO00592 SGCE-205ENST00000437425 1508 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PODXLO00592 IRGQ-201ENST00000422989 9685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PODXLO00592 TP53I11-208ENST00000525680 2647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PODXLO00592 PIK3IP1-201ENST00000215912 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PODXLO00592 CHL1-202ENST00000397491 5235 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PODXLO00592 PHF19-203ENST00000419155 3525 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PODXLO00592 ALAS2-201ENST00000330807 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.3 ms