Protein–RNA interactions for Protein: E9PL57

NEDD8-MDP1, NEDD8-MDP1 readthrough (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 170 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD8-MDP1E9PL57 TMEM254-204ENST00000372277 366 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NEDD8-MDP1E9PL57 NFYC-202ENST00000372651 1202 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NEDD8-MDP1E9PL57 KRTAP20-4-201ENST00000382828 224 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NEDD8-MDP1E9PL57 CRIP1-202ENST00000392531 485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NEDD8-MDP1E9PL57 SMARCE1-204ENST00000400122 1263 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NEDD8-MDP1E9PL57 SLC16A6P1-201ENST00000413214 1059 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
NEDD8-MDP1E9PL57 H2AFV-206ENST00000437072 589 ntTSL 4 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NEDD8-MDP1E9PL57 AC106786.1-201ENST00000442777 792 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NEDD8-MDP1E9PL57 CICP12-201ENST00000455801 843 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
NEDD8-MDP1E9PL57 MARK2P5-201ENST00000507649 634 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
NEDD8-MDP1E9PL57 AL135838.1-202ENST00000556411 441 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NEDD8-MDP1E9PL57 AC104758.2-201ENST00000562716 483 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NEDD8-MDP1E9PL57 ARL16-210ENST00000574938 751 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NEDD8-MDP1E9PL57 RN7SL774P-201ENST00000577467 290 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
NEDD8-MDP1E9PL57 CCDC144NL-AS1-209ENST00000577860 884 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NEDD8-MDP1E9PL57 SMARCE1-213ENST00000578044 1184 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NEDD8-MDP1E9PL57 SMARCE1-216ENST00000580419 1228 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NEDD8-MDP1E9PL57 AC005962.1-201ENST00000584100 773 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
NEDD8-MDP1E9PL57 HDDC2-204ENST00000608295 879 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NEDD8-MDP1E9PL57 BX088702.1-201ENST00000610784 235 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
NEDD8-MDP1E9PL57 MIR6720-201ENST00000611664 98 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
NEDD8-MDP1E9PL57 AC027601.3-201ENST00000622907 509 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
NEDD8-MDP1E9PL57 AC024941.2-201ENST00000625763 493 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NEDD8-MDP1E9PL57 LINC01668-201ENST00000635001 513 ntTSL 4 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NEDD8-MDP1E9PL57 AC073324.2-201ENST00000626532 2941 ntTSL 4 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NEDD8-MDP1E9PL57 DNAAF5-201ENST00000297440 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NEDD8-MDP1E9PL57 USP43-201ENST00000285199 4169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NEDD8-MDP1E9PL57 TCP10-201ENST00000366827 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NEDD8-MDP1E9PL57 MCF2L-232ENST00000535094 3752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NEDD8-MDP1E9PL57 AP000866.1-201ENST00000499143 2886 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NEDD8-MDP1E9PL57 FSD2-202ENST00000541889 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NEDD8-MDP1E9PL57 FGD4-212ENST00000534526 2977 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NEDD8-MDP1E9PL57 CPEB2-205ENST00000442003 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NEDD8-MDP1E9PL57 KCNA5-201ENST00000252321 2800 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NEDD8-MDP1E9PL57 CDH1-202ENST00000422392 2567 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NEDD8-MDP1E9PL57 SF1-209ENST00000433274 2317 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NEDD8-MDP1E9PL57 MED26-201ENST00000263390 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NEDD8-MDP1E9PL57 ETNPPL-201ENST00000296486 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NEDD8-MDP1E9PL57 MAGEA8-205ENST00000542674 2084 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NEDD8-MDP1E9PL57 YWHAE-208ENST00000571732 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NEDD8-MDP1E9PL57 FAM189A2-201ENST00000257515 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NEDD8-MDP1E9PL57 LDLR-204ENST00000545707 2429 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NEDD8-MDP1E9PL57 TMEM115-201ENST00000266025 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NEDD8-MDP1E9PL57 FLAD1-201ENST00000292180 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NEDD8-MDP1E9PL57 KLK11-207ENST00000594768 1347 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NEDD8-MDP1E9PL57 MBLAC2-202ENST00000514906 1936 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
NEDD8-MDP1E9PL57 NLGN4X-203ENST00000381093 5865 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NEDD8-MDP1E9PL57 ARHGEF3-212ENST00000495373 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NEDD8-MDP1E9PL57 PPL-205ENST00000590782 5845 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NEDD8-MDP1E9PL57 CICP23-201ENST00000605013 2741 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
NEDD8-MDP1E9PL57 PLA1A-205ENST00000494440 1775 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NEDD8-MDP1E9PL57 CALD1-206ENST00000424922 2124 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NEDD8-MDP1E9PL57 ECSIT-201ENST00000252440 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NEDD8-MDP1E9PL57 NRBF2-201ENST00000277746 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NEDD8-MDP1E9PL57 RFK-201ENST00000376736 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NEDD8-MDP1E9PL57 AL596257.1-201ENST00000641463 2694 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
NEDD8-MDP1E9PL57 M6PR-202ENST00000536844 2305 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NEDD8-MDP1E9PL57 PIGW-204ENST00000614443 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NEDD8-MDP1E9PL57 CAPN3-207ENST00000397200 1643 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NEDD8-MDP1E9PL57 RPL35-201ENST00000348462 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NEDD8-MDP1E9PL57 LINC01352-201ENST00000431347 962 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NEDD8-MDP1E9PL57 KLK11-204ENST00000453757 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NEDD8-MDP1E9PL57 RERG-205ENST00000537647 935 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NEDD8-MDP1E9PL57 AP003419.2-201ENST00000543494 711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NEDD8-MDP1E9PL57 ERICH5-202ENST00000545282 596 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NEDD8-MDP1E9PL57 CCDC86-203ENST00000545580 697 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NEDD8-MDP1E9PL57 SEC23A-204ENST00000548032 907 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NEDD8-MDP1E9PL57 SELENOW-204ENST00000595615 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NEDD8-MDP1E9PL57 AC009884.2-201ENST00000603110 324 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
NEDD8-MDP1E9PL57 SELENOW-216ENST00000612212 875 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NEDD8-MDP1E9PL57 CU633904.3-201ENST00000624042 1029 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
NEDD8-MDP1E9PL57 AC100757.4-201ENST00000626934 759 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
NEDD8-MDP1E9PL57 PLEKHB2-211ENST00000628582 1297 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NEDD8-MDP1E9PL57 RPL35-206ENST00000629845 340 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NEDD8-MDP1E9PL57 AL805961.1-203ENST00000641078 1258 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
NEDD8-MDP1E9PL57 ZMYND15-204ENST00000573751 2409 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NEDD8-MDP1E9PL57 PAM-206ENST00000438793 5432 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NEDD8-MDP1E9PL57 PDE1C-201ENST00000321453 2898 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NEDD8-MDP1E9PL57 SLC13A5-208ENST00000573648 1723 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NEDD8-MDP1E9PL57 MIR600HG-201ENST00000449175 5984 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
NEDD8-MDP1E9PL57 SLC29A1-209ENST00000427851 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NEDD8-MDP1E9PL57 AL928654.2-201ENST00000551271 2279 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NEDD8-MDP1E9PL57 GLT1D1-201ENST00000281703 2725 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NEDD8-MDP1E9PL57 UCN2-201ENST00000273610 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NEDD8-MDP1E9PL57 APBB1-217ENST00000608645 1925 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NEDD8-MDP1E9PL57 PARN-202ENST00000420015 2360 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NEDD8-MDP1E9PL57 RHOT1-203ENST00000358365 3297 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NEDD8-MDP1E9PL57 GDF6-201ENST00000287020 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NEDD8-MDP1E9PL57 LHX5-201ENST00000261731 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NEDD8-MDP1E9PL57 SMURF2-201ENST00000262435 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NEDD8-MDP1E9PL57 NR4A1-213ENST00000550082 2029 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NEDD8-MDP1E9PL57 SPPL2B-207ENST00000610743 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NEDD8-MDP1E9PL57 DUSP11-201ENST00000272444 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NEDD8-MDP1E9PL57 CCDC68-204ENST00000591504 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NEDD8-MDP1E9PL57 COL25A1-201ENST00000399126 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NEDD8-MDP1E9PL57 AC138904.3-201ENST00000635780 2681 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NEDD8-MDP1E9PL57 NRXN1-229ENST00000628515 3243 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NEDD8-MDP1E9PL57 RSPO1-202ENST00000401068 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NEDD8-MDP1E9PL57 ADORA1-204ENST00000367236 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NEDD8-MDP1E9PL57 AMZ2P1-202ENST00000430983 3425 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.8 ms