Protein–RNA interactions for Protein: B2RUZ4

SMIM1, Small integral membrane protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 78 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM1B2RUZ4 ITGB4-202ENST00000449880 5689 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
SMIM1B2RUZ4 TPM3P9-201ENST00000424846 2920 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
SMIM1B2RUZ4 PDE2A-206ENST00000444035 4193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
SMIM1B2RUZ4 PATL2-208ENST00000560780 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
SMIM1B2RUZ4 DHTKD1-201ENST00000263035 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
SMIM1B2RUZ4 ACSL1-208ENST00000507295 2490 ntTSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
SMIM1B2RUZ4 THTPA-201ENST00000288014 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
SMIM1B2RUZ4 IKZF1-205ENST00000357364 5925 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
SMIM1B2RUZ4 CAMK2B-206ENST00000353625 1624 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
SMIM1B2RUZ4 MPZ-204ENST00000491222 1824 ntTSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
SMIM1B2RUZ4 MEAF6-203ENST00000373074 2005 ntTSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
SMIM1B2RUZ4 ADAMTS10-201ENST00000270328 4194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
SMIM1B2RUZ4 SIRPA-202ENST00000358771 3996 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
SMIM1B2RUZ4 AP003555.1-202ENST00000511013 1755 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
SMIM1B2RUZ4 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
SMIM1B2RUZ4 ZFP64-203ENST00000361387 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
SMIM1B2RUZ4 TMUB2-202ENST00000357984 1921 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
SMIM1B2RUZ4 COL4A3-202ENST00000396578 8097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
SMIM1B2RUZ4 DAGLB-201ENST00000297056 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
SMIM1B2RUZ4 POM121-201ENST00000358357 5320 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
SMIM1B2RUZ4 RHD-207ENST00000454452 1303 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
SMIM1B2RUZ4 PEG13-201ENST00000631594 5667 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
SMIM1B2RUZ4 PGAP2-201ENST00000278243 2062 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
SMIM1B2RUZ4 MBD4-204ENST00000503197 2099 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
SMIM1B2RUZ4 SLC6A6P1-201ENST00000413933 1850 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
SMIM1B2RUZ4 MST1-202ENST00000449682 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
SMIM1B2RUZ4 SPIN3-207ENST00000638386 4461 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
SMIM1B2RUZ4 KIF17-203ENST00000400463 3731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
SMIM1B2RUZ4 C2-205ENST00000418949 1658 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
SMIM1B2RUZ4 ESPN-201ENST00000377828 3531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
SMIM1B2RUZ4 FBXO5-202ENST00000367241 2221 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
SMIM1B2RUZ4 PRKY-203ENST00000528056 7218 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
SMIM1B2RUZ4 PSMC1-201ENST00000261303 4448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
SMIM1B2RUZ4 ZKSCAN2-201ENST00000328086 7523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
SMIM1B2RUZ4 AP5Z1-201ENST00000348624 2901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
SMIM1B2RUZ4 FAM90A12P-201ENST00000519497 2375 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
SMIM1B2RUZ4 FAM90A24P-201ENST00000520792 2369 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
SMIM1B2RUZ4 ELOF1-201ENST00000252445 1019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
SMIM1B2RUZ4 FKBP2-201ENST00000309366 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
SMIM1B2RUZ4 HIST1H2BD-202ENST00000377777 496 ntAPPRIS P1 BASIC10.13□□□□□ -0.79
SMIM1B2RUZ4 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
SMIM1B2RUZ4 AL627223.1-201ENST00000416693 442 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
SMIM1B2RUZ4 AC004945.1-201ENST00000416738 983 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
SMIM1B2RUZ4 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
SMIM1B2RUZ4 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
SMIM1B2RUZ4 RPP21-221ENST00000428040 594 ntTSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
SMIM1B2RUZ4 AL121753.1-201ENST00000444717 529 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
SMIM1B2RUZ4 BX322559.1-201ENST00000456613 319 ntTSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
SMIM1B2RUZ4 ARHGEF26-AS1-201ENST00000467912 628 ntTSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
SMIM1B2RUZ4 FAM153C-206ENST00000507848 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
SMIM1B2RUZ4 AL161781.2-201ENST00000509911 739 ntTSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
SMIM1B2RUZ4 ZNF576-206ENST00000533118 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
SMIM1B2RUZ4 RHBDL2-203ENST00000540558 697 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
SMIM1B2RUZ4 AL137786.1-202ENST00000555496 789 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
SMIM1B2RUZ4 AC040169.1-201ENST00000565382 521 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
SMIM1B2RUZ4 SECTM1-202ENST00000580437 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
SMIM1B2RUZ4 AC010503.2-201ENST00000599292 296 ntTSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
SMIM1B2RUZ4 AL512343.2-201ENST00000609423 490 ntTSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
SMIM1B2RUZ4 AC092506.1-204ENST00000634888 1066 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
SMIM1B2RUZ4 AC105339.1-204ENST00000636249 355 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
SMIM1B2RUZ4 CDC37-201ENST00000222005 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
SMIM1B2RUZ4 RPS9-205ENST00000402367 1617 ntTSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
SMIM1B2RUZ4 TGIF2-201ENST00000373872 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
SMIM1B2RUZ4 PCM1-201ENST00000325083 6820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
SMIM1B2RUZ4 CAMK2B-217ENST00000457475 4142 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
SMIM1B2RUZ4 USP48-213ENST00000529637 3228 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
SMIM1B2RUZ4 AC005562.1-201ENST00000583030 3219 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
SMIM1B2RUZ4 PSEN2-202ENST00000366783 2306 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
SMIM1B2RUZ4 NR3C1-201ENST00000231509 3556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
SMIM1B2RUZ4 SERTAD2-201ENST00000313349 5549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
SMIM1B2RUZ4 DMPK-219ENST00000600757 3357 ntTSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
SMIM1B2RUZ4 SLC1A5-201ENST00000412532 1750 ntTSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
SMIM1B2RUZ4 AC093520.1-201ENST00000567545 1767 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
SMIM1B2RUZ4 STAG3L2-201ENST00000426587 2130 ntTSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
SMIM1B2RUZ4 ARHGEF9-230ENST00000637178 2145 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
SMIM1B2RUZ4 TGFBRAP1-201ENST00000258449 2827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
SMIM1B2RUZ4 L3MBTL1-206ENST00000427442 3157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
SMIM1B2RUZ4 SYT1-204ENST00000457153 4592 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
SMIM1B2RUZ4 PRDM10-204ENST00000423662 5998 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
SMIM1B2RUZ4 ATG14-201ENST00000247178 4742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
SMIM1B2RUZ4 WNT7A-201ENST00000285018 4041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
SMIM1B2RUZ4 CYP20A1-201ENST00000356079 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
SMIM1B2RUZ4 CROT-203ENST00000419147 2959 ntTSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
SMIM1B2RUZ4 CCDC180-210ENST00000529487 5242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
SMIM1B2RUZ4 SCD5-202ENST00000319540 3101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
SMIM1B2RUZ4 MCRIP1-207ENST00000574190 2775 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
SMIM1B2RUZ4 WASHC2C-201ENST00000336378 4669 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
SMIM1B2RUZ4 AC026790.1-201ENST00000399760 2941 ntTSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
SMIM1B2RUZ4 PPIC-201ENST00000306442 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
SMIM1B2RUZ4 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
SMIM1B2RUZ4 STYXL1-203ENST00000359697 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
SMIM1B2RUZ4 SLC4A7-214ENST00000455077 3775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
SMIM1B2RUZ4 MSRB3-202ENST00000355192 4289 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
SMIM1B2RUZ4 WDR17-205ENST00000508596 4294 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
SMIM1B2RUZ4 AL591122.2-201ENST00000624125 1853 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
SMIM1B2RUZ4 EML4-203ENST00000402711 3568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
SMIM1B2RUZ4 PCDHA11-201ENST00000398640 6115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
SMIM1B2RUZ4 ARHGAP4-201ENST00000350060 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
SMIM1B2RUZ4 INTS14-201ENST00000313182 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
SMIM1B2RUZ4 KSR1-216ENST00000582410 2392 ntTSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.8 ms