Protein–RNA interactions for Protein: A4FU01

MTMR11, Myotubularin-related protein 11, humanhuman

Predictions only

Length 709 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTMR11A4FU01 SSFA2-205ENST00000431877 5150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
MTMR11A4FU01 CTPS2-201ENST00000359276 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
MTMR11A4FU01 LRRFIP1-201ENST00000244815 4370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
MTMR11A4FU01 SERTM1-201ENST00000315190 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
MTMR11A4FU01 INHBE-201ENST00000266646 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
MTMR11A4FU01 AKAP1-201ENST00000314126 2380 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
MTMR11A4FU01 BORCS5-201ENST00000298571 549 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
MTMR11A4FU01 GSTK1-202ENST00000409500 888 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
MTMR11A4FU01 SHANK2-210ENST00000449116 939 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
MTMR11A4FU01 LEF1-AS1-204ENST00000508266 559 ntTSL 4 BASIC15.52■□□□□ 0.08
MTMR11A4FU01 MRPL48-210ENST00000542303 661 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
MTMR11A4FU01 AC015660.1-201ENST00000560103 395 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
MTMR11A4FU01 GFER-204ENST00000567719 483 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
MTMR11A4FU01 AC068152.1-201ENST00000575930 685 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
MTMR11A4FU01 AF254983.2-201ENST00000612331 135 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
MTMR11A4FU01 AC133540.1-201ENST00000620845 1019 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
MTMR11A4FU01 ARL16-215ENST00000622299 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
MTMR11A4FU01 KIAA1217-206ENST00000376462 6123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
MTMR11A4FU01 TJAP1-207ENST00000436109 2572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
MTMR11A4FU01 AC126177.1-201ENST00000547829 2218 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
MTMR11A4FU01 MVB12B-201ENST00000361171 4819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
MTMR11A4FU01 R3HDM2P2-201ENST00000401880 2116 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
MTMR11A4FU01 MBD1-217ENST00000588937 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
MTMR11A4FU01 KHK-201ENST00000260598 2397 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
MTMR11A4FU01 ASIC4-201ENST00000347842 2684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
MTMR11A4FU01 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
MTMR11A4FU01 SMURF2-201ENST00000262435 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
MTMR11A4FU01 AC073324.2-201ENST00000626532 2941 ntTSL 4 BASIC15.51■□□□□ 0.07
MTMR11A4FU01 RNF32-202ENST00000317955 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
MTMR11A4FU01 ABHD14B-201ENST00000315877 2236 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
MTMR11A4FU01 AP002360.1-202ENST00000530460 2462 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
MTMR11A4FU01 AJ011931.1-201ENST00000618749 2492 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
MTMR11A4FU01 CBLN4-201ENST00000064571 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
MTMR11A4FU01 CLIC6-202ENST00000360731 3860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
MTMR11A4FU01 MSTO1-201ENST00000245564 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
MTMR11A4FU01 MAP2K3-201ENST00000316920 1246 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
MTMR11A4FU01 NAALADL1-203ENST00000356632 2118 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
MTMR11A4FU01 TAF8-202ENST00000372978 794 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
MTMR11A4FU01 AC079807.2-203ENST00000417692 656 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
MTMR11A4FU01 AL354893.2-201ENST00000423075 529 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
MTMR11A4FU01 AL160290.2-202ENST00000448671 574 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
MTMR11A4FU01 MSC-AS1-204ENST00000518916 864 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
MTMR11A4FU01 AC090857.1-201ENST00000527400 390 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
MTMR11A4FU01 TGIF1-218ENST00000551402 1089 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
MTMR11A4FU01 FAM236A-201ENST00000593662 453 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
MTMR11A4FU01 FAM236B-201ENST00000596535 465 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
MTMR11A4FU01 AL157813.1-201ENST00000612996 587 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
MTMR11A4FU01 AC079325.2-202ENST00000641031 462 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
MTMR11A4FU01 STUM-201ENST00000366788 7705 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
MTMR11A4FU01 JAKMIP1-204ENST00000409831 2371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
MTMR11A4FU01 FAM53B-202ENST00000337318 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
MTMR11A4FU01 TRIM13-204ENST00000420995 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
MTMR11A4FU01 CREB3L3-201ENST00000078445 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
MTMR11A4FU01 FH-201ENST00000366560 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
MTMR11A4FU01 TSC2-202ENST00000350773 5532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
MTMR11A4FU01 KNSTRN-201ENST00000249776 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
MTMR11A4FU01 ZC3H7B-201ENST00000352645 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
MTMR11A4FU01 SYNCRIP-202ENST00000369622 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
MTMR11A4FU01 MIR762HG-203ENST00000570025 1429 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
MTMR11A4FU01 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
MTMR11A4FU01 NRXN1-229ENST00000628515 3243 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
MTMR11A4FU01 CDKN2B-AS1-208ENST00000580576 2175 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
MTMR11A4FU01 TMEM50A-201ENST00000374358 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
MTMR11A4FU01 SHROOM1-201ENST00000319854 3190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
MTMR11A4FU01 FOXO4-201ENST00000341558 1353 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
MTMR11A4FU01 NEK2-201ENST00000366998 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
MTMR11A4FU01 CHIA-204ENST00000369740 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
MTMR11A4FU01 RANBP1-208ENST00000430524 1389 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
MTMR11A4FU01 FAM189B-202ENST00000361361 3082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
MTMR11A4FU01 AC018442.1-201ENST00000421439 2061 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
MTMR11A4FU01 SPO11-203ENST00000371263 1834 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
MTMR11A4FU01 ZCCHC4-201ENST00000302874 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
MTMR11A4FU01 DUSP13-208ENST00000478873 1335 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
MTMR11A4FU01 KLK3-216ENST00000617027 1341 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
MTMR11A4FU01 MBP-204ENST00000382582 2281 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
MTMR11A4FU01 PCSK2-205ENST00000536609 2275 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
MTMR11A4FU01 SLC39A8-202ENST00000394833 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
MTMR11A4FU01 STOML1-204ENST00000541638 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
MTMR11A4FU01 ATP6V0E2-AS1-201ENST00000461019 2973 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
MTMR11A4FU01 XKR9-203ENST00000520030 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
MTMR11A4FU01 SLC1A7-204ENST00000611397 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
MTMR11A4FU01 ASGR1-201ENST00000269299 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
MTMR11A4FU01 BX005266.2-201ENST00000450704 1549 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
MTMR11A4FU01 LMBRD1-202ENST00000370577 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
MTMR11A4FU01 THOC6-201ENST00000253952 1246 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
MTMR11A4FU01 OR1J1-201ENST00000259357 969 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
MTMR11A4FU01 IER3-201ENST00000259874 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
MTMR11A4FU01 UBE4B-203ENST00000377153 1273 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
MTMR11A4FU01 AC083949.1-202ENST00000458490 552 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
MTMR11A4FU01 SUPT4H1P2-201ENST00000501248 353 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
MTMR11A4FU01 AC011773.1-201ENST00000520129 468 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
MTMR11A4FU01 GATD1-205ENST00000524550 995 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
MTMR11A4FU01 NDUFC2-204ENST00000528164 561 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
MTMR11A4FU01 AC079328.1-201ENST00000560358 952 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
MTMR11A4FU01 AC103988.2-201ENST00000561804 725 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
MTMR11A4FU01 CYB5D1-202ENST00000570446 570 ntTSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
MTMR11A4FU01 NFIC-204ENST00000586919 1221 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
MTMR11A4FU01 AC015967.2-201ENST00000624092 234 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
MTMR11A4FU01 AC006435.4-201ENST00000625037 234 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
MTMR11A4FU01 AL356737.1-201ENST00000634391 234 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.8 ms