Protein–RNA interactions for Protein: V9GYD0

ARL2-SNX15, ARL2-SNX15 readthrough (NMD candidate), humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARL2-SNX15V9GYD0 ADNP-203ENST00000396029 6261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
ARL2-SNX15V9GYD0 NAXD-201ENST00000309957 2659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
ARL2-SNX15V9GYD0 EXO5-201ENST00000296380 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
ARL2-SNX15V9GYD0 AL034550.2-201ENST00000620523 1771 ntTSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
ARL2-SNX15V9GYD0 WRAP53-210ENST00000534050 1736 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
ARL2-SNX15V9GYD0 GPHB5-201ENST00000314140 393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
ARL2-SNX15V9GYD0 CRADD-201ENST00000332896 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
ARL2-SNX15V9GYD0 ABCA2-202ENST00000341511 8063 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
ARL2-SNX15V9GYD0 MIR346-201ENST00000362234 95 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
ARL2-SNX15V9GYD0 CD99-204ENST00000381187 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
ARL2-SNX15V9GYD0 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
ARL2-SNX15V9GYD0 AP001056.1-201ENST00000411956 821 ntTSL 3 BASIC11.7□□□□□ -0.54
ARL2-SNX15V9GYD0 SPDYE17-201ENST00000412399 783 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
ARL2-SNX15V9GYD0 TARDBPP1-201ENST00000442013 1203 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
ARL2-SNX15V9GYD0 LRRC74B-201ENST00000442047 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
ARL2-SNX15V9GYD0 AC012184.2-203ENST00000443119 2110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
ARL2-SNX15V9GYD0 USP40-206ENST00000443711 628 ntTSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
ARL2-SNX15V9GYD0 CNOT8-225ENST00000524105 904 ntTSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
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ARL2-SNX15V9GYD0 SLC1A4-205ENST00000531327 1217 ntTSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
ARL2-SNX15V9GYD0 BCAR3-210ENST00000539242 2114 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
ARL2-SNX15V9GYD0 BLOC1S1-201ENST00000547076 837 ntTSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
ARL2-SNX15V9GYD0 AP002472.1-201ENST00000577490 586 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
ARL2-SNX15V9GYD0 CDC42EP4-206ENST00000581014 737 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
ARL2-SNX15V9GYD0 CD300LG-205ENST00000586233 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
ARL2-SNX15V9GYD0 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
ARL2-SNX15V9GYD0 AC010326.2-201ENST00000602124 1020 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.7□□□□□ -0.54
ARL2-SNX15V9GYD0 AC098484.3-202ENST00000603943 1011 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
ARL2-SNX15V9GYD0 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
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ARL2-SNX15V9GYD0 TRPV6-201ENST00000359396 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
ARL2-SNX15V9GYD0 TMEM231-207ENST00000568377 2920 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
ARL2-SNX15V9GYD0 BCAP29-201ENST00000005259 4572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
ARL2-SNX15V9GYD0 GORASP1-201ENST00000319283 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
ARL2-SNX15V9GYD0 PSEN2-201ENST00000366782 2465 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
ARL2-SNX15V9GYD0 C6orf62-202ENST00000378119 4134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
ARL2-SNX15V9GYD0 MAGI3-202ENST00000369611 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
ARL2-SNX15V9GYD0 CIAPIN1-213ENST00000569370 1559 ntTSL 3 BASIC11.7□□□□□ -0.54
ARL2-SNX15V9GYD0 HYOU1-218ENST00000614668 1569 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
ARL2-SNX15V9GYD0 ARFGAP1-202ENST00000370275 3467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
ARL2-SNX15V9GYD0 C7orf57-204ENST00000435376 1925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
ARL2-SNX15V9GYD0 C7orf57-206ENST00000539619 1927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
ARL2-SNX15V9GYD0 C15orf39-207ENST00000567617 4249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
ARL2-SNX15V9GYD0 TIGD1-201ENST00000408957 2625 ntAPPRIS P1 BASIC11.7□□□□□ -0.54
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ARL2-SNX15V9GYD0 PIGT-202ENST00000279036 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
ARL2-SNX15V9GYD0 RTP1-201ENST00000312295 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
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ARL2-SNX15V9GYD0 BORCS8-203ENST00000477565 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
ARL2-SNX15V9GYD0 SCOC-210ENST00000608372 5129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
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ARL2-SNX15V9GYD0 ANO9-201ENST00000332826 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
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ARL2-SNX15V9GYD0 AP1B1-201ENST00000317368 3903 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
ARL2-SNX15V9GYD0 MAPRE2-201ENST00000300249 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
ARL2-SNX15V9GYD0 CCDC88C-204ENST00000389857 7474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
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ARL2-SNX15V9GYD0 SEMA6D-202ENST00000354744 5931 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
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ARL2-SNX15V9GYD0 GP6-201ENST00000310373 2268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
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ARL2-SNX15V9GYD0 MRPL13-201ENST00000306185 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
ARL2-SNX15V9GYD0 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
ARL2-SNX15V9GYD0 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
ARL2-SNX15V9GYD0 TNNT3-203ENST00000381557 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
ARL2-SNX15V9GYD0 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
ARL2-SNX15V9GYD0 TTC31-205ENST00000442235 958 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
ARL2-SNX15V9GYD0 BARX1-AS1-202ENST00000454594 307 ntTSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
ARL2-SNX15V9GYD0 AC074386.1-202ENST00000463561 864 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
ARL2-SNX15V9GYD0 AC093909.1-201ENST00000504731 1122 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
ARL2-SNX15V9GYD0 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
ARL2-SNX15V9GYD0 LINC01184-209ENST00000514573 609 ntTSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
ARL2-SNX15V9GYD0 RPL8-207ENST00000528957 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
ARL2-SNX15V9GYD0 AC007406.4-201ENST00000539568 765 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
ARL2-SNX15V9GYD0 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
ARL2-SNX15V9GYD0 AL135744.1-201ENST00000565098 629 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
ARL2-SNX15V9GYD0 AC106730.1-201ENST00000566722 1090 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
ARL2-SNX15V9GYD0 AP000842.3-202ENST00000569238 1080 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
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