Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2K6

USP20, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 20, humanhuman

Predictions only

Length 914 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP20Q9Y2K6 ISPD-202ENST00000407010 5524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
USP20Q9Y2K6 RUSC1-202ENST00000368347 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
USP20Q9Y2K6 RASGRF1-202ENST00000419573 6294 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
USP20Q9Y2K6 TRAF6-201ENST00000348124 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
USP20Q9Y2K6 MTHFR-210ENST00000641407 2387 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
USP20Q9Y2K6 IDH2-201ENST00000330062 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
USP20Q9Y2K6 AC015818.8-201ENST00000587907 1519 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
USP20Q9Y2K6 PRKD2-201ENST00000291281 3070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
USP20Q9Y2K6 SYT17-201ENST00000355377 3081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
USP20Q9Y2K6 VILL-202ENST00000383759 2787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
USP20Q9Y2K6 ATP6AP2-213ENST00000636251 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
USP20Q9Y2K6 RPH3AL-201ENST00000323434 2809 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
USP20Q9Y2K6 AHRR-201ENST00000316418 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
USP20Q9Y2K6 OCEL1-201ENST00000215061 1133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
USP20Q9Y2K6 TCEAL1-203ENST00000372626 721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
USP20Q9Y2K6 TBC1D8-202ENST00000409318 3803 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
USP20Q9Y2K6 AL139289.2-201ENST00000424948 661 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
USP20Q9Y2K6 MTX1P1-201ENST00000440904 838 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
USP20Q9Y2K6 AL591846.1-201ENST00000451736 433 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
USP20Q9Y2K6 FAM25G-201ENST00000452267 345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
USP20Q9Y2K6 TAF8-204ENST00000456846 1293 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
USP20Q9Y2K6 LILRA5-204ENST00000486742 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
USP20Q9Y2K6 RPL23A-206ENST00000496182 636 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
USP20Q9Y2K6 HYAL3-206ENST00000513170 636 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
USP20Q9Y2K6 AC011365.2-201ENST00000520041 810 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
USP20Q9Y2K6 AC005730.2-201ENST00000564549 1184 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
USP20Q9Y2K6 LINC00621-201ENST00000577004 1177 ntTSL 4 BASIC16.36■□□□□ 0.21
USP20Q9Y2K6 CDC42EP4-202ENST00000439510 2879 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
USP20Q9Y2K6 TRMT2B-201ENST00000372935 2921 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
USP20Q9Y2K6 AC060234.2-201ENST00000428825 1610 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
USP20Q9Y2K6 MAGED2-201ENST00000218439 1958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
USP20Q9Y2K6 ELL-201ENST00000262809 4027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
USP20Q9Y2K6 TPGS2-201ENST00000334295 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
USP20Q9Y2K6 ITPK1-207ENST00000555495 3035 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
USP20Q9Y2K6 ZC3H14-204ENST00000336693 2007 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
USP20Q9Y2K6 DLGAP1-213ENST00000534970 2365 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
USP20Q9Y2K6 TAF6-201ENST00000344095 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
USP20Q9Y2K6 FAM180B-201ENST00000538490 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
USP20Q9Y2K6 KRT20-201ENST00000167588 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
USP20Q9Y2K6 TGFB1-201ENST00000221930 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
USP20Q9Y2K6 FECH-201ENST00000262093 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
USP20Q9Y2K6 KIAA1211L-201ENST00000397899 3907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
USP20Q9Y2K6 CRYBG2-210ENST00000527815 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
USP20Q9Y2K6 ITSN1-209ENST00000399352 5408 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
USP20Q9Y2K6 TBRG4-215ENST00000494076 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
USP20Q9Y2K6 DDX49-201ENST00000247003 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
USP20Q9Y2K6 SMYD1-203ENST00000444564 1816 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
USP20Q9Y2K6 CCDC121-202ENST00000394775 1472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
USP20Q9Y2K6 AC106881.1-201ENST00000605849 3329 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
USP20Q9Y2K6 SLC52A3-205ENST00000632431 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
USP20Q9Y2K6 ARHGAP4-202ENST00000370016 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
USP20Q9Y2K6 RASSF5-201ENST00000577571 3496 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
USP20Q9Y2K6 PDP1-201ENST00000297598 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
USP20Q9Y2K6 CCNL1-202ENST00000295926 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
USP20Q9Y2K6 UNC13A-204ENST00000550896 5200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
USP20Q9Y2K6 TIGD4-201ENST00000304337 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
USP20Q9Y2K6 LDHAL6B-201ENST00000307144 1693 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
USP20Q9Y2K6 CBY1-201ENST00000216029 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
USP20Q9Y2K6 MUC1-202ENST00000338684 1107 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
USP20Q9Y2K6 RUFY2-202ENST00000342616 983 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
USP20Q9Y2K6 TPM2-202ENST00000360958 1189 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
USP20Q9Y2K6 SMIM11A-203ENST00000399299 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
USP20Q9Y2K6 BTBD6P1-201ENST00000412176 1267 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
USP20Q9Y2K6 LINC01840-201ENST00000421870 571 ntTSL 4 BASIC16.35■□□□□ 0.21
USP20Q9Y2K6 CALD1-206ENST00000424922 2124 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
USP20Q9Y2K6 AC104306.2-201ENST00000451877 341 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
USP20Q9Y2K6 MAATS1-203ENST00000463700 939 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
USP20Q9Y2K6 MUC1-218ENST00000471283 635 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
USP20Q9Y2K6 LYRM9-204ENST00000503642 432 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
USP20Q9Y2K6 RPL28-208ENST00000559463 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
USP20Q9Y2K6 AC021594.1-201ENST00000587174 636 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
USP20Q9Y2K6 ZACNP1-201ENST00000612259 710 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
USP20Q9Y2K6 AC002472.3-201ENST00000640124 621 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
USP20Q9Y2K6 PLTP-201ENST00000354050 1731 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
USP20Q9Y2K6 AC245123.1-202ENST00000612422 1719 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
USP20Q9Y2K6 FXYD3-202ENST00000346446 1320 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
USP20Q9Y2K6 NANOS1-202ENST00000425699 4017 ntAPPRIS P2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
USP20Q9Y2K6 AL391244.1-206ENST00000447725 1843 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
USP20Q9Y2K6 SLC25A36-203ENST00000446041 4638 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
USP20Q9Y2K6 CELF2-206ENST00000608830 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
USP20Q9Y2K6 SNAP47-203ENST00000366760 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
USP20Q9Y2K6 SLC26A11-202ENST00000411502 2872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
USP20Q9Y2K6 FURIN-207ENST00000618099 4345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
USP20Q9Y2K6 STAR-201ENST00000276449 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
USP20Q9Y2K6 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
USP20Q9Y2K6 MAP1S-201ENST00000324096 3419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
USP20Q9Y2K6 ASXL1-210ENST00000613218 7038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
USP20Q9Y2K6 TMEM230-202ENST00000342308 1562 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
USP20Q9Y2K6 PAQR8-202ENST00000442253 4738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
USP20Q9Y2K6 JKAMP-207ENST00000554271 2137 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
USP20Q9Y2K6 CYP4F3-203ENST00000586182 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
USP20Q9Y2K6 AP4M1-201ENST00000359593 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
USP20Q9Y2K6 AP4M1-206ENST00000429084 1836 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
USP20Q9Y2K6 HOXB4-201ENST00000332503 3757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
USP20Q9Y2K6 CALCA-201ENST00000331587 843 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
USP20Q9Y2K6 NCR3-201ENST00000340027 1042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
USP20Q9Y2K6 APOC3-202ENST00000375345 604 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
USP20Q9Y2K6 MOGAT3-202ENST00000379423 933 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
USP20Q9Y2K6 VCX3B-201ENST00000381029 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
USP20Q9Y2K6 LINC01248-201ENST00000458264 468 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 77.4 ms