Protein–RNA interactions for Protein: Q9UNY4

TTF2, Transcription termination factor 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,162 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTF2Q9UNY4 CICP12-201ENST00000455801 843 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
TTF2Q9UNY4 AC005234.1-201ENST00000457851 434 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TTF2Q9UNY4 AC009403.1-204ENST00000469539 597 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TTF2Q9UNY4 AC116345.2-201ENST00000512837 523 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
TTF2Q9UNY4 NAPSB-201ENST00000525179 678 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TTF2Q9UNY4 AL355310.3-201ENST00000526411 582 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TTF2Q9UNY4 RTN3P1-201ENST00000536295 711 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
TTF2Q9UNY4 PAM16-211ENST00000575848 518 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TTF2Q9UNY4 PAM16-214ENST00000576217 493 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TTF2Q9UNY4 AC012044.1-201ENST00000603431 297 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
TTF2Q9UNY4 AC027601.3-201ENST00000622907 509 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
TTF2Q9UNY4 ALPI-201ENST00000295463 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TTF2Q9UNY4 FAM160B1-202ENST00000369248 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TTF2Q9UNY4 CTSW-204ENST00000528419 1341 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TTF2Q9UNY4 TMEM106A-202ENST00000541594 1330 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TTF2Q9UNY4 ZNF687-201ENST00000324048 5378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TTF2Q9UNY4 CERS3-202ENST00000394113 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TTF2Q9UNY4 FOXO4-201ENST00000341558 1353 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TTF2Q9UNY4 MPZL2-202ENST00000438295 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TTF2Q9UNY4 LINC02405-201ENST00000512624 1361 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TTF2Q9UNY4 ZNF713-202ENST00000429591 4339 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TTF2Q9UNY4 ZNF7-202ENST00000446747 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TTF2Q9UNY4 AC126365.1-201ENST00000578585 1514 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
TTF2Q9UNY4 MROH4P-201ENST00000431302 1578 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
TTF2Q9UNY4 PPIL6-207ENST00000521072 4128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TTF2Q9UNY4 ABLIM2-201ENST00000341937 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TTF2Q9UNY4 RECQL5-202ENST00000340830 1749 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TTF2Q9UNY4 CACNA1A-238ENST00000637276 7135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TTF2Q9UNY4 PHTF1-201ENST00000357783 2747 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TTF2Q9UNY4 AKR1A1-202ENST00000372070 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TTF2Q9UNY4 ANKRD42-208ENST00000531895 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TTF2Q9UNY4 MSR1-201ENST00000262101 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TTF2Q9UNY4 KCNJ18-201ENST00000567955 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TTF2Q9UNY4 MSTO1-202ENST00000368341 2245 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TTF2Q9UNY4 LRFN1-201ENST00000248668 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TTF2Q9UNY4 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TTF2Q9UNY4 LYPLA1-214ENST00000618741 2526 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TTF2Q9UNY4 AC073316.1-202ENST00000402115 988 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TTF2Q9UNY4 TREML1-202ENST00000426005 981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TTF2Q9UNY4 AP000356.1-201ENST00000438893 364 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TTF2Q9UNY4 AC073150.1-201ENST00000450406 1084 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
TTF2Q9UNY4 KLF3-AS1-204ENST00000505240 567 ntTSL 4 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TTF2Q9UNY4 FADS2-212ENST00000522639 360 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TTF2Q9UNY4 NKX3-1-202ENST00000523261 713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TTF2Q9UNY4 EEF1D-218ENST00000526838 926 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TTF2Q9UNY4 AP006333.2-201ENST00000544948 732 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TTF2Q9UNY4 SLIRP-210ENST00000557431 725 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TTF2Q9UNY4 AC009065.3-201ENST00000562027 627 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TTF2Q9UNY4 FADS2-215ENST00000574708 385 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TTF2Q9UNY4 AC011825.3-201ENST00000583184 565 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TTF2Q9UNY4 AC011498.6-201ENST00000592034 510 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TTF2Q9UNY4 FAM236A-201ENST00000593662 453 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TTF2Q9UNY4 FAM236B-201ENST00000596535 465 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TTF2Q9UNY4 BX088702.1-201ENST00000610784 235 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
TTF2Q9UNY4 KLF3-AS1-207ENST00000620339 558 ntTSL 4 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TTF2Q9UNY4 AP001043.1-205ENST00000623098 1033 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TTF2Q9UNY4 OSGIN2-202ENST00000451899 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TTF2Q9UNY4 MYADM-202ENST00000391768 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TTF2Q9UNY4 SPERT-204ENST00000610924 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TTF2Q9UNY4 PSMD13-203ENST00000431206 1591 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TTF2Q9UNY4 PSMC3-213ENST00000619920 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TTF2Q9UNY4 BRF1-203ENST00000379937 3314 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TTF2Q9UNY4 ATP6V0E2-207ENST00000479613 1666 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TTF2Q9UNY4 WDR81-202ENST00000409644 6733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TTF2Q9UNY4 ZXDC-202ENST00000389709 3405 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TTF2Q9UNY4 MAGEA1-201ENST00000356661 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TTF2Q9UNY4 TNFRSF14-AS1-202ENST00000432521 3608 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TTF2Q9UNY4 FOXO3-201ENST00000343882 7308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TTF2Q9UNY4 ZNF32-AS3-201ENST00000458063 1932 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TTF2Q9UNY4 TMEM25-206ENST00000442938 2228 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TTF2Q9UNY4 TBC1D1-219ENST00000615497 2383 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TTF2Q9UNY4 HGNC:24955-201ENST00000303177 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TTF2Q9UNY4 ARHGAP9-203ENST00000424809 2569 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TTF2Q9UNY4 CNOT8-202ENST00000403027 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TTF2Q9UNY4 PPP1R16B-201ENST00000299824 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TTF2Q9UNY4 TMEM40-201ENST00000264728 984 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
TTF2Q9UNY4 UCN2-201ENST00000273610 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TTF2Q9UNY4 SLC51A-201ENST00000296327 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TTF2Q9UNY4 TMEM256-201ENST00000302422 486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TTF2Q9UNY4 MAP2K3-201ENST00000316920 1246 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
TTF2Q9UNY4 TYSND1-202ENST00000335494 3397 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TTF2Q9UNY4 ZC3H14-204ENST00000336693 2007 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TTF2Q9UNY4 MGAT4B-202ENST00000337755 3027 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
TTF2Q9UNY4 COX8C-201ENST00000342144 533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TTF2Q9UNY4 FXYD5-201ENST00000342879 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TTF2Q9UNY4 PIGC-201ENST00000344529 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TTF2Q9UNY4 SPAG11A-203ENST00000351436 534 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TTF2Q9UNY4 NUDT1-203ENST00000356714 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TTF2Q9UNY4 SPAG11B-204ENST00000361111 534 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TTF2Q9UNY4 SERTAD4-201ENST00000367012 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TTF2Q9UNY4 TCEAL6-201ENST00000372773 983 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
TTF2Q9UNY4 IGHV3-21-201ENST00000390607 430 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
TTF2Q9UNY4 RASGEF1A-204ENST00000395810 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TTF2Q9UNY4 ATP2A3-205ENST00000397041 4675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TTF2Q9UNY4 NUDT1-204ENST00000397046 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TTF2Q9UNY4 DPP6-203ENST00000404039 4798 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TTF2Q9UNY4 AC083949.1-201ENST00000422013 657 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
TTF2Q9UNY4 AL590617.2-201ENST00000432673 917 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
TTF2Q9UNY4 C7orf43-207ENST00000457641 2005 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
TTF2Q9UNY4 AC025165.3-201ENST00000471530 679 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.5 ms