Protein–RNA interactions for Protein: Q9UGL1

KDM5B, Lysine-specific demethylase 5B, humanhuman

Predictions only

Length 1,544 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDM5BQ9UGL1 PDK2-201ENST00000007708 2384 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
KDM5BQ9UGL1 SLC22A23-210ENST00000490273 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
KDM5BQ9UGL1 ARHGEF3-212ENST00000495373 2024 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
KDM5BQ9UGL1 ZCCHC3-201ENST00000500893 3354 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
KDM5BQ9UGL1 PPT1-205ENST00000449045 1957 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
KDM5BQ9UGL1 LSP1-204ENST00000406638 2640 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
KDM5BQ9UGL1 HHEX-202ENST00000472590 1605 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
KDM5BQ9UGL1 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
KDM5BQ9UGL1 ZNF32-AS3-201ENST00000458063 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
KDM5BQ9UGL1 VPS25-201ENST00000253794 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
KDM5BQ9UGL1 PROK2-201ENST00000295619 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
KDM5BQ9UGL1 AP002856.2-201ENST00000416553 584 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
KDM5BQ9UGL1 AP000769.1-203ENST00000637245 208 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
KDM5BQ9UGL1 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
KDM5BQ9UGL1 AC005906.2-205ENST00000640862 1522 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
KDM5BQ9UGL1 AC092135.3-201ENST00000624151 1846 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
KDM5BQ9UGL1 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
KDM5BQ9UGL1 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
KDM5BQ9UGL1 RBP1-205ENST00000492918 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
KDM5BQ9UGL1 FUT7-201ENST00000314412 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
KDM5BQ9UGL1 RAB37-216ENST00000613645 1653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
KDM5BQ9UGL1 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
KDM5BQ9UGL1 HOXD3-202ENST00000410016 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
KDM5BQ9UGL1 HNRNPA3-201ENST00000392524 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
KDM5BQ9UGL1 PRELID3B-202ENST00000371033 943 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
KDM5BQ9UGL1 GEMIN8P4-201ENST00000380526 729 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
KDM5BQ9UGL1 LINC01278-201ENST00000433061 529 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
KDM5BQ9UGL1 HDAC2-AS2-203ENST00000436876 591 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
KDM5BQ9UGL1 AL583839.1-201ENST00000445280 691 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
KDM5BQ9UGL1 TAGLN3-203ENST00000455401 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
KDM5BQ9UGL1 RN7SL767P-201ENST00000493013 295 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
KDM5BQ9UGL1 IGHEP1-201ENST00000521393 651 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
KDM5BQ9UGL1 WDYHV1-206ENST00000523356 869 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
KDM5BQ9UGL1 GOLGA2P7-209ENST00000560408 745 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
KDM5BQ9UGL1 AC018846.1-201ENST00000568231 183 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
KDM5BQ9UGL1 ANAPC11-206ENST00000571874 636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
KDM5BQ9UGL1 NMRK2-202ENST00000593949 869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
KDM5BQ9UGL1 NMRK2-204ENST00000599576 691 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
KDM5BQ9UGL1 PTOV1-AS2-203ENST00000601893 719 ntTSL 4 BASIC22.56■■□□□ 1.2
KDM5BQ9UGL1 LINC01278-206ENST00000610088 554 ntTSL 4 BASIC22.56■■□□□ 1.2
KDM5BQ9UGL1 TMEM9-202ENST00000367332 1544 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
KDM5BQ9UGL1 FYN-205ENST00000368682 3234 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
KDM5BQ9UGL1 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
KDM5BQ9UGL1 FDFT1-223ENST00000615631 2462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
KDM5BQ9UGL1 TOB1-202ENST00000499247 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
KDM5BQ9UGL1 ZMYND15-201ENST00000269289 2448 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
KDM5BQ9UGL1 RTN1-209ENST00000611068 2647 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
KDM5BQ9UGL1 A1BG-AS1-204ENST00000595302 2130 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
KDM5BQ9UGL1 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
KDM5BQ9UGL1 NAP1L1-202ENST00000393263 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
KDM5BQ9UGL1 DGKZ-201ENST00000318201 3213 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
KDM5BQ9UGL1 ZNF628-201ENST00000391718 3177 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
KDM5BQ9UGL1 ARFGAP1-210ENST00000519273 3176 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
KDM5BQ9UGL1 ARPC1A-201ENST00000262942 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
KDM5BQ9UGL1 GRSF1-208ENST00000545193 2682 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
KDM5BQ9UGL1 AC013268.4-201ENST00000637413 2228 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
KDM5BQ9UGL1 MC5R-201ENST00000324750 1319 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
KDM5BQ9UGL1 NIFK-AS1-203ENST00000419902 1316 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
KDM5BQ9UGL1 DHRS7-209ENST00000557185 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
KDM5BQ9UGL1 TSPAN3-205ENST00000558745 1340 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
KDM5BQ9UGL1 MGEA5-201ENST00000357797 3263 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
KDM5BQ9UGL1 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
KDM5BQ9UGL1 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
KDM5BQ9UGL1 PLEKHN1-201ENST00000379407 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
KDM5BQ9UGL1 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
KDM5BQ9UGL1 HLA-DRB5-201ENST00000374975 1260 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
KDM5BQ9UGL1 LINC02435-201ENST00000508291 584 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
KDM5BQ9UGL1 NT5C-204ENST00000578337 582 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
KDM5BQ9UGL1 AL591471.1-201ENST00000621855 229 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
KDM5BQ9UGL1 GLS2-217ENST00000623608 2518 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
KDM5BQ9UGL1 ARMC8-213ENST00000470821 1656 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
KDM5BQ9UGL1 SURF4-208ENST00000613129 3148 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
KDM5BQ9UGL1 LINC01101-201ENST00000622953 1884 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
KDM5BQ9UGL1 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
KDM5BQ9UGL1 ING1-203ENST00000375774 2870 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
KDM5BQ9UGL1 ALOX15-205ENST00000574640 2422 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
KDM5BQ9UGL1 EPN1-203ENST00000411543 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
KDM5BQ9UGL1 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
KDM5BQ9UGL1 HYOU1-218ENST00000614668 1569 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
KDM5BQ9UGL1 AC005064.1-201ENST00000422488 2725 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
KDM5BQ9UGL1 ADAM15-208ENST00000447332 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
KDM5BQ9UGL1 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
KDM5BQ9UGL1 BTNL8-203ENST00000400707 1512 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
KDM5BQ9UGL1 AC132872.4-202ENST00000622924 2756 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
KDM5BQ9UGL1 PDYN-AS1-201ENST00000446562 1802 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
KDM5BQ9UGL1 IL17B-201ENST00000261796 696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
KDM5BQ9UGL1 TMEM95-201ENST00000330767 1169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
KDM5BQ9UGL1 TRAPPC3-201ENST00000373159 590 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
KDM5BQ9UGL1 TMEM216-202ENST00000398979 908 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
KDM5BQ9UGL1 WASIR1-201ENST00000399966 1054 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
KDM5BQ9UGL1 CFAP36-203ENST00000403007 759 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
KDM5BQ9UGL1 AL391839.2-201ENST00000412085 383 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
KDM5BQ9UGL1 HTATIP2-202ENST00000421577 886 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
KDM5BQ9UGL1 LINC00892-203ENST00000454385 686 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
KDM5BQ9UGL1 KRT18P37-201ENST00000520711 1282 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
KDM5BQ9UGL1 AC136601.1-201ENST00000521803 666 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
KDM5BQ9UGL1 AC079949.1-201ENST00000541419 505 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
KDM5BQ9UGL1 PLA2G15-209ENST00000566188 1203 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
KDM5BQ9UGL1 AC009065.6-201ENST00000568795 456 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
KDM5BQ9UGL1 NAV1-210ENST00000593583 726 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.5 ms