Protein–RNA interactions for Protein: Q9UFW8

CGGBP1, CGG triplet repeat-binding protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 167 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CGGBP1Q9UFW8 AL928921.2-201ENST00000641325 2442 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
CGGBP1Q9UFW8 CHRNA7-201ENST00000306901 6181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
CGGBP1Q9UFW8 MFSD11-211ENST00000588460 3612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
CGGBP1Q9UFW8 LRRC20-204ENST00000373224 3095 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
CGGBP1Q9UFW8 GTF2IRD1-205ENST00000476977 5868 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
CGGBP1Q9UFW8 OSBPL7-211ENST00000613735 2836 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
CGGBP1Q9UFW8 WSCD1-202ENST00000539421 2665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
CGGBP1Q9UFW8 CDCA7-202ENST00000347703 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
CGGBP1Q9UFW8 ZNF398-205ENST00000491174 2232 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
CGGBP1Q9UFW8 LDLRAD4-205ENST00000585931 2118 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
CGGBP1Q9UFW8 DDX20-201ENST00000369702 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
CGGBP1Q9UFW8 ZNF7-203ENST00000525266 1874 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
CGGBP1Q9UFW8 RADIL-201ENST00000399583 3689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
CGGBP1Q9UFW8 B3GNTL1-211ENST00000576599 1787 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
CGGBP1Q9UFW8 TMPRSS2-202ENST00000398585 3240 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
CGGBP1Q9UFW8 SEMA3F-202ENST00000413852 3212 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
CGGBP1Q9UFW8 NPRL3-212ENST00000620134 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
CGGBP1Q9UFW8 FOXD4L5-201ENST00000377420 3109 ntAPPRIS P1 BASIC13.25□□□□□ -0.29
CGGBP1Q9UFW8 RAB38-201ENST00000243662 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
CGGBP1Q9UFW8 NKIRAS2-201ENST00000307641 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
CGGBP1Q9UFW8 CD2BP2-203ENST00000569466 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
CGGBP1Q9UFW8 ZNF663P-201ENST00000400371 2722 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
CGGBP1Q9UFW8 PLAU-202ENST00000446342 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
CGGBP1Q9UFW8 AL669831.1-201ENST00000506640 6432 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
CGGBP1Q9UFW8 SCAND1-201ENST00000305978 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
CGGBP1Q9UFW8 MRPL55-215ENST00000366742 630 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
CGGBP1Q9UFW8 SLC18B1-202ENST00000367918 472 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
CGGBP1Q9UFW8 KIAA0907-201ENST00000368319 1155 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
CGGBP1Q9UFW8 AL035633.1-201ENST00000406139 838 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
CGGBP1Q9UFW8 THPO-202ENST00000421442 1132 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
CGGBP1Q9UFW8 TMEM176B-202ENST00000429904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
CGGBP1Q9UFW8 AC021491.2-201ENST00000513017 607 ntTSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
CGGBP1Q9UFW8 AP003068.1-201ENST00000528887 544 ntTSL 4 BASIC13.25□□□□□ -0.29
CGGBP1Q9UFW8 SPATA8-AS1-201ENST00000558722 465 ntTSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
CGGBP1Q9UFW8 AC105339.1-202ENST00000559535 1283 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
CGGBP1Q9UFW8 RPL36-203ENST00000577222 874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
CGGBP1Q9UFW8 MIF4GD-206ENST00000579119 856 ntTSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
CGGBP1Q9UFW8 AP005482.2-201ENST00000587889 310 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
CGGBP1Q9UFW8 CHCHD2P3-201ENST00000603038 451 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
CGGBP1Q9UFW8 LINC02084-201ENST00000606069 1096 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
CGGBP1Q9UFW8 AC005391.1-201ENST00000613285 341 ntTSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
CGGBP1Q9UFW8 KISS1-202ENST00000625357 435 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
CGGBP1Q9UFW8 PLAGL1-201ENST00000354765 3663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
CGGBP1Q9UFW8 TMEM209-202ENST00000462753 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
CGGBP1Q9UFW8 SIPA1-203ENST00000527525 3235 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
CGGBP1Q9UFW8 NEK10-206ENST00000429845 4250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
CGGBP1Q9UFW8 TKT-201ENST00000296289 1931 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
CGGBP1Q9UFW8 FBXL4-201ENST00000229971 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
CGGBP1Q9UFW8 FAM230B-201ENST00000415376 1859 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
CGGBP1Q9UFW8 AC008079.1-201ENST00000434390 1859 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
CGGBP1Q9UFW8 NAALADL1-204ENST00000358658 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
CGGBP1Q9UFW8 LINC00924-202ENST00000556053 2682 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
CGGBP1Q9UFW8 SP140L-204ENST00000444636 1781 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
CGGBP1Q9UFW8 SETD6-203ENST00000394266 3423 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
CGGBP1Q9UFW8 RAB43-202ENST00000393304 4230 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.24□□□□□ -0.29
CGGBP1Q9UFW8 UNC5B-202ENST00000373192 6451 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
CGGBP1Q9UFW8 KHK-201ENST00000260598 2397 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
CGGBP1Q9UFW8 CAPZB-204ENST00000375144 1568 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
CGGBP1Q9UFW8 AC007787.1-201ENST00000588095 1583 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
CGGBP1Q9UFW8 AMT-232ENST00000636199 1546 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
CGGBP1Q9UFW8 NUBPL-201ENST00000281081 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
CGGBP1Q9UFW8 ALDH4A1-206ENST00000538839 2957 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
CGGBP1Q9UFW8 APOBEC3A-202ENST00000402255 1478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
CGGBP1Q9UFW8 FBP1-203ENST00000415431 1487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
CGGBP1Q9UFW8 CYB561D1-201ENST00000310611 5009 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
CGGBP1Q9UFW8 RPS6KC1-207ENST00000543470 4227 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
CGGBP1Q9UFW8 GOLGA6L2-201ENST00000312015 1379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
CGGBP1Q9UFW8 HNRNPA1P48-201ENST00000562726 1377 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
CGGBP1Q9UFW8 UBE2D1-201ENST00000373910 2659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
CGGBP1Q9UFW8 KLRG1-201ENST00000266551 1335 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
CGGBP1Q9UFW8 ODF3-201ENST00000325113 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
CGGBP1Q9UFW8 WNT7B-201ENST00000339464 3919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
CGGBP1Q9UFW8 MIOX-201ENST00000216075 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
CGGBP1Q9UFW8 LINC01116-202ENST00000339037 838 ntTSL 3 BASIC13.24□□□□□ -0.29
CGGBP1Q9UFW8 NGF-201ENST00000369512 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
CGGBP1Q9UFW8 DERL3-204ENST00000406855 1063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
CGGBP1Q9UFW8 C9orf41-AS1-201ENST00000455609 719 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
CGGBP1Q9UFW8 RN7SL692P-201ENST00000464677 288 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
CGGBP1Q9UFW8 ELK1P1-201ENST00000485699 580 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
CGGBP1Q9UFW8 TIMM8B-201ENST00000504148 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
CGGBP1Q9UFW8 AC026410.3-201ENST00000514280 936 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
CGGBP1Q9UFW8 AC113383.1-201ENST00000514696 582 ntTSL 4 BASIC13.24□□□□□ -0.29
CGGBP1Q9UFW8 ZNF7-206ENST00000528130 1134 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
CGGBP1Q9UFW8 IL32-215ENST00000529550 772 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC13.24□□□□□ -0.29
CGGBP1Q9UFW8 ZSCAN2-213ENST00000541040 965 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
CGGBP1Q9UFW8 AC013451.1-201ENST00000554552 518 ntTSL 4 BASIC13.24□□□□□ -0.29
CGGBP1Q9UFW8 AC120045.2-201ENST00000567334 178 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
CGGBP1Q9UFW8 AC004233.1-201ENST00000570515 608 ntTSL 4 BASIC13.24□□□□□ -0.29
CGGBP1Q9UFW8 AC005262.2-201ENST00000587701 452 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
CGGBP1Q9UFW8 AC008770.3-202ENST00000591944 567 ntTSL 4 BASIC13.24□□□□□ -0.29
CGGBP1Q9UFW8 NDUFC2-201ENST00000281031 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
CGGBP1Q9UFW8 CBX3-202ENST00000396386 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
CGGBP1Q9UFW8 PADI2-202ENST00000375486 4345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
CGGBP1Q9UFW8 TJP3-207ENST00000589378 3068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
CGGBP1Q9UFW8 UBXN11-204ENST00000374217 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
CGGBP1Q9UFW8 TLL1-206ENST00000513213 1829 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
CGGBP1Q9UFW8 NADSYN1-216ENST00000530055 2416 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
CGGBP1Q9UFW8 FAM219B-201ENST00000357635 3550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
CGGBP1Q9UFW8 MFRP-201ENST00000360167 1663 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
CGGBP1Q9UFW8 C1R-201ENST00000535233 2211 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
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