Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBR4

LHX3, LIM/homeobox protein Lhx3, humanhuman

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Length 397 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LHX3Q9UBR4 AC027601.3-201ENST00000622907 509 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
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LHX3Q9UBR4 TMEM106C-201ENST00000256686 1394 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
LHX3Q9UBR4 HSFX2-201ENST00000598963 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
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LHX3Q9UBR4 SLC25A33-201ENST00000302692 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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LHX3Q9UBR4 POLR1E-202ENST00000377798 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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LHX3Q9UBR4 ARHGAP26-202ENST00000378004 9200 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
LHX3Q9UBR4 LINC02228-204ENST00000642115 2962 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
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LHX3Q9UBR4 PSD-201ENST00000020673 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
LHX3Q9UBR4 BCL11B-202ENST00000357195 7559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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LHX3Q9UBR4 AKIP1-201ENST00000299576 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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LHX3Q9UBR4 ZNF846-201ENST00000397902 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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LHX3Q9UBR4 UBXN1-218ENST00000616865 1002 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
LHX3Q9UBR4 AL008638.5-201ENST00000623814 1298 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
LHX3Q9UBR4 CDK5RAP3-201ENST00000338399 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
LHX3Q9UBR4 PRF1-201ENST00000373209 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
LHX3Q9UBR4 AC015688.4-201ENST00000580780 1647 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
LHX3Q9UBR4 AC006262.1-203ENST00000598170 1634 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
LHX3Q9UBR4 DNAI1-209ENST00000614641 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
LHX3Q9UBR4 IL1RAP-209ENST00000422940 1957 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
LHX3Q9UBR4 PBX3-203ENST00000373487 2902 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
LHX3Q9UBR4 RCHY1-202ENST00000380840 1735 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
LHX3Q9UBR4 PAK1-201ENST00000278568 2543 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
LHX3Q9UBR4 PLIN1-201ENST00000300055 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
LHX3Q9UBR4 AC113367.3-201ENST00000508316 1912 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
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