Protein–RNA interactions for Protein: Q9NX61

TMEM161A, Transmembrane protein 161A, humanhuman

Predictions only

Length 479 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM161AQ9NX61 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TMEM161AQ9NX61 NSMF-205ENST00000371474 3571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TMEM161AQ9NX61 NSMF-208ENST00000437259 3577 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TMEM161AQ9NX61 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TMEM161AQ9NX61 ASGR1-201ENST00000269299 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TMEM161AQ9NX61 BX005266.2-201ENST00000450704 1549 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TMEM161AQ9NX61 METTL17-221ENST00000556670 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TMEM161AQ9NX61 UBE3A-227ENST00000638011 8742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TMEM161AQ9NX61 NTM-205ENST00000425719 1607 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TMEM161AQ9NX61 IQCA1L-203ENST00000615129 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TMEM161AQ9NX61 FOS-201ENST00000303562 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TMEM161AQ9NX61 SLC25A36-203ENST00000446041 4638 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TMEM161AQ9NX61 ZCCHC17-204ENST00000546109 1705 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TMEM161AQ9NX61 C15orf61-201ENST00000342683 4253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TMEM161AQ9NX61 KRT71-201ENST00000267119 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TMEM161AQ9NX61 MIEF1-202ENST00000402881 2269 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TMEM161AQ9NX61 CABP1-203ENST00000351200 770 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TMEM161AQ9NX61 AC026316.1-201ENST00000398900 414 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
TMEM161AQ9NX61 COPS7B-205ENST00000409295 1009 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TMEM161AQ9NX61 GDAP1-202ENST00000434412 1228 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TMEM161AQ9NX61 AC135178.1-201ENST00000458568 537 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TMEM161AQ9NX61 PARP8-206ENST00000503665 572 ntTSL 4 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TMEM161AQ9NX61 AC084346.1-201ENST00000520962 528 ntTSL 4 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TMEM161AQ9NX61 MSRB3-206ENST00000535664 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TMEM161AQ9NX61 TGIF1-218ENST00000551402 1089 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TMEM161AQ9NX61 RBM8B-201ENST00000555532 525 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
TMEM161AQ9NX61 AC135983.1-201ENST00000562108 1097 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TMEM161AQ9NX61 AC103691.2-201ENST00000618824 433 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
TMEM161AQ9NX61 MIR6727-201ENST00000620702 65 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
TMEM161AQ9NX61 SIN3B-201ENST00000248054 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TMEM161AQ9NX61 IL1RN-203ENST00000361779 1922 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TMEM161AQ9NX61 SLC6A9-203ENST00000372306 1926 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TMEM161AQ9NX61 RUBCNL-212ENST00000631139 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TMEM161AQ9NX61 ZNF846-201ENST00000397902 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TMEM161AQ9NX61 DGKZ-201ENST00000318201 3213 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TMEM161AQ9NX61 LCK-202ENST00000336890 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TMEM161AQ9NX61 PAFAH1B1-202ENST00000397195 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TMEM161AQ9NX61 SLC8B1-202ENST00000546737 1656 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TMEM161AQ9NX61 DNM1-201ENST00000341179 3254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TMEM161AQ9NX61 PAK1-210ENST00000528203 1878 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TMEM161AQ9NX61 C6orf106-203ENST00000374026 4232 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TMEM161AQ9NX61 HYAL2-201ENST00000357750 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TMEM161AQ9NX61 TM9SF1-202ENST00000396854 2055 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TMEM161AQ9NX61 CPA5-201ENST00000393213 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TMEM161AQ9NX61 ALPI-201ENST00000295463 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TMEM161AQ9NX61 PEX11B-201ENST00000369306 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TMEM161AQ9NX61 KCTD1-203ENST00000417602 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TMEM161AQ9NX61 PDZRN3-201ENST00000263666 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TMEM161AQ9NX61 STK26-204ENST00000481105 1835 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TMEM161AQ9NX61 AC074117.1-201ENST00000447070 3060 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TMEM161AQ9NX61 NAF1-201ENST00000274054 1907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TMEM161AQ9NX61 PPP2CA-203ENST00000481195 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TMEM161AQ9NX61 KHNYN-202ENST00000553935 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TMEM161AQ9NX61 PAXBP1-202ENST00000331923 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TMEM161AQ9NX61 AC022613.1-201ENST00000536835 2530 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TMEM161AQ9NX61 LYPLA1-214ENST00000618741 2526 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TMEM161AQ9NX61 RASGEF1A-204ENST00000395810 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TMEM161AQ9NX61 DKK4-201ENST00000220812 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TMEM161AQ9NX61 RANBP1-201ENST00000331821 837 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TMEM161AQ9NX61 NCR3-202ENST00000376071 541 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TMEM161AQ9NX61 AC131097.2-203ENST00000401641 507 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TMEM161AQ9NX61 TPT1-AS1-203ENST00000412946 744 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TMEM161AQ9NX61 LINC01388-201ENST00000416242 416 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TMEM161AQ9NX61 LINC00278-201ENST00000425031 528 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TMEM161AQ9NX61 AC012360.1-201ENST00000433219 674 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TMEM161AQ9NX61 AC069218.1-201ENST00000435269 762 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
TMEM161AQ9NX61 LINC00431-201ENST00000440735 1189 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TMEM161AQ9NX61 LY6E-208ENST00000520531 490 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TMEM161AQ9NX61 LINC01475-201ENST00000548010 766 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TMEM161AQ9NX61 STUB1-204ENST00000564370 875 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TMEM161AQ9NX61 GFER-204ENST00000567719 483 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TMEM161AQ9NX61 MIR5572-201ENST00000583188 137 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
TMEM161AQ9NX61 FAAP24-204ENST00000590179 784 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TMEM161AQ9NX61 AC018635.2-201ENST00000608625 364 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
TMEM161AQ9NX61 GLIDR-205ENST00000640674 884 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TMEM161AQ9NX61 CFAP36-201ENST00000339012 1373 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TMEM161AQ9NX61 AWAT1-201ENST00000374521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TMEM161AQ9NX61 AGER-201ENST00000375055 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TMEM161AQ9NX61 RAN-210ENST00000541630 1475 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TMEM161AQ9NX61 UBXN11-202ENST00000357089 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TMEM161AQ9NX61 SLC4A2-214ENST00000485713 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TMEM161AQ9NX61 DEPDC7-201ENST00000241051 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TMEM161AQ9NX61 FH-201ENST00000366560 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TMEM161AQ9NX61 CRY2-201ENST00000417225 2053 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TMEM161AQ9NX61 MAD1L1-203ENST00000402746 2355 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TMEM161AQ9NX61 SRGAP2B-207ENST00000641863 2367 ntAPPRIS P5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TMEM161AQ9NX61 ARHGAP9-203ENST00000424809 2569 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TMEM161AQ9NX61 MAPT-204ENST00000344290 6816 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TMEM161AQ9NX61 PHKG2-204ENST00000563588 5539 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TMEM161AQ9NX61 TNN-201ENST00000239462 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TMEM161AQ9NX61 CNOT8-202ENST00000403027 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TMEM161AQ9NX61 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TMEM161AQ9NX61 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TMEM161AQ9NX61 MLPH-203ENST00000409373 2031 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TMEM161AQ9NX61 ILF2-205ENST00000615950 1906 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TMEM161AQ9NX61 ZNF568-203ENST00000427117 1827 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TMEM161AQ9NX61 TJP2-212ENST00000636438 4689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TMEM161AQ9NX61 BNIP1-201ENST00000231668 1339 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TMEM161AQ9NX61 TSPY26P-202ENST00000565928 3884 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
TMEM161AQ9NX61 SEMA3B-212ENST00000616701 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.3 ms