Protein–RNA interactions for Protein: Q9NT22

EMILIN3, EMILIN-3, humanhuman

Predictions only

Length 766 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EMILIN3Q9NT22 AL139412.1-202ENST00000452465 675 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
EMILIN3Q9NT22 AC012507.1-201ENST00000454890 600 ntTSL 4 BASIC17.3■□□□□ 0.36
EMILIN3Q9NT22 RPS2P36-201ENST00000456516 831 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
EMILIN3Q9NT22 ATP6V1G2-210ENST00000483251 662 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
EMILIN3Q9NT22 AC010973.2-201ENST00000485974 1230 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
EMILIN3Q9NT22 LIMS3-205ENST00000487150 782 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
EMILIN3Q9NT22 RCC2P8-201ENST00000502779 1035 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
EMILIN3Q9NT22 AC008443.1-201ENST00000511331 1000 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
EMILIN3Q9NT22 TP53AIP1-204ENST00000530777 363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
EMILIN3Q9NT22 ERICH5-202ENST00000545282 596 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
EMILIN3Q9NT22 C14orf132-204ENST00000556728 774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
EMILIN3Q9NT22 COMMD4-211ENST00000564815 639 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
EMILIN3Q9NT22 LINC01229-204ENST00000568751 720 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
EMILIN3Q9NT22 AC005962.1-201ENST00000584100 773 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
EMILIN3Q9NT22 CENPX-208ENST00000584347 799 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
EMILIN3Q9NT22 AC090386.1-202ENST00000586610 469 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
EMILIN3Q9NT22 SPCS2P2-201ENST00000603270 608 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
EMILIN3Q9NT22 ALG1L-202ENST00000611639 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
EMILIN3Q9NT22 Metazoa_SRP.69-201ENST00000615730 281 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
EMILIN3Q9NT22 LINC01517-203ENST00000616194 908 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
EMILIN3Q9NT22 SNX1-214ENST00000625244 324 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
EMILIN3Q9NT22 CNOT8-201ENST00000285896 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
EMILIN3Q9NT22 SHANK1-204ENST00000391814 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
EMILIN3Q9NT22 ANKRD42-208ENST00000531895 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
EMILIN3Q9NT22 NAA30-204ENST00000556492 7644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
EMILIN3Q9NT22 AL513477.1-201ENST00000602865 2407 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
EMILIN3Q9NT22 PABPC4-201ENST00000372856 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
EMILIN3Q9NT22 THUMPD3-210ENST00000515662 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
EMILIN3Q9NT22 CACNA2D2-203ENST00000423994 5329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
EMILIN3Q9NT22 TLE3-215ENST00000559048 2918 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
EMILIN3Q9NT22 GINS3-203ENST00000426538 1728 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
EMILIN3Q9NT22 CSGALNACT1-211ENST00000522854 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
EMILIN3Q9NT22 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
EMILIN3Q9NT22 TSC22D3-201ENST00000315660 2213 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
EMILIN3Q9NT22 ARF6-201ENST00000298316 3865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
EMILIN3Q9NT22 ACTL6A-202ENST00000429709 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
EMILIN3Q9NT22 NPHP4-211ENST00000622020 3004 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
EMILIN3Q9NT22 CRHR2-202ENST00000348438 1600 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
EMILIN3Q9NT22 FAM45A-201ENST00000361432 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
EMILIN3Q9NT22 INHBA-203ENST00000442711 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
EMILIN3Q9NT22 INPP5K-204ENST00000421807 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
EMILIN3Q9NT22 UROD-201ENST00000246337 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
EMILIN3Q9NT22 MVK-214ENST00000629016 1591 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
EMILIN3Q9NT22 STX1A-201ENST00000222812 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
EMILIN3Q9NT22 STX1A-204ENST00000395156 2050 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
EMILIN3Q9NT22 M6PR-202ENST00000536844 2305 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
EMILIN3Q9NT22 AC073264.3-201ENST00000636941 2577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
EMILIN3Q9NT22 GRAMD4-203ENST00000408031 2834 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
EMILIN3Q9NT22 NRM-202ENST00000376420 1228 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
EMILIN3Q9NT22 ETV2-201ENST00000379023 926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
EMILIN3Q9NT22 AC245369.1-201ENST00000390634 434 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
EMILIN3Q9NT22 AC131097.3-203ENST00000420272 1193 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
EMILIN3Q9NT22 TLE1P1-201ENST00000422965 589 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
EMILIN3Q9NT22 GLIS3-AS1-201ENST00000451340 734 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
EMILIN3Q9NT22 ALG3P1-201ENST00000508806 1114 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
EMILIN3Q9NT22 EEF1D-218ENST00000526838 926 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
EMILIN3Q9NT22 PSORS1C1-206ENST00000547221 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
EMILIN3Q9NT22 CROCCP3-204ENST00000590118 574 ntTSL 4 BASIC17.29■□□□□ 0.36
EMILIN3Q9NT22 AC011498.6-201ENST00000592034 510 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
EMILIN3Q9NT22 BX088702.1-201ENST00000610784 235 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
EMILIN3Q9NT22 CDK7-214ENST00000626796 358 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
EMILIN3Q9NT22 COL17A1-202ENST00000369733 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
EMILIN3Q9NT22 CENPT-202ENST00000440851 2200 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
EMILIN3Q9NT22 TDRD6-203ENST00000544460 8887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
EMILIN3Q9NT22 LRRC6-205ENST00000519595 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
EMILIN3Q9NT22 PELP1-208ENST00000572293 5272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
EMILIN3Q9NT22 JAKMIP1-204ENST00000409831 2371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
EMILIN3Q9NT22 FBN2-205ENST00000508989 4987 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
EMILIN3Q9NT22 NRXN1-204ENST00000401669 5870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
EMILIN3Q9NT22 CNPPD1-202ENST00000409789 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
EMILIN3Q9NT22 TBC1D3P5-202ENST00000581469 2513 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
EMILIN3Q9NT22 SSH3-203ENST00000376757 2990 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
EMILIN3Q9NT22 RUFY2-204ENST00000399200 2685 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
EMILIN3Q9NT22 ACTL6A-203ENST00000450518 1750 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
EMILIN3Q9NT22 RAB5B-202ENST00000448789 1530 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
EMILIN3Q9NT22 SLC13A5-208ENST00000573648 1723 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
EMILIN3Q9NT22 C6orf52-201ENST00000259983 619 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
EMILIN3Q9NT22 RPL35-201ENST00000348462 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
EMILIN3Q9NT22 SPAG11A-203ENST00000351436 534 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
EMILIN3Q9NT22 SPAG11B-204ENST00000361111 534 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
EMILIN3Q9NT22 IGHV3-21-201ENST00000390607 430 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
EMILIN3Q9NT22 AL391832.2-201ENST00000418557 889 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
EMILIN3Q9NT22 AL591684.1-201ENST00000434533 234 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
EMILIN3Q9NT22 LINC01088-201ENST00000437737 973 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
EMILIN3Q9NT22 AL136982.2-201ENST00000451760 234 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
EMILIN3Q9NT22 CICP12-201ENST00000455801 843 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
EMILIN3Q9NT22 NAPSB-201ENST00000525179 678 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
EMILIN3Q9NT22 RN7SL440P-201ENST00000577855 343 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
EMILIN3Q9NT22 ARL8B-208ENST00000611208 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
EMILIN3Q9NT22 NPIPB11-202ENST00000614927 1216 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
EMILIN3Q9NT22 AP001043.1-205ENST00000623098 1033 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
EMILIN3Q9NT22 CBR3-AS1-213ENST00000623647 815 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
EMILIN3Q9NT22 RPL35-206ENST00000629845 340 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
EMILIN3Q9NT22 GPBAR1-203ENST00000521462 1465 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
EMILIN3Q9NT22 MVB12B-201ENST00000361171 4819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
EMILIN3Q9NT22 SCLT1-209ENST00000511426 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
EMILIN3Q9NT22 CLIC5-208ENST00000544153 2051 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
EMILIN3Q9NT22 RNF182-206ENST00000537388 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
EMILIN3Q9NT22 ATP2A3-205ENST00000397041 4675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
EMILIN3Q9NT22 ACSL3-201ENST00000357430 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.5 ms