Protein–RNA interactions for Protein: Q9HCM3

KIAA1549, UPF0606 protein KIAA1549, humanhuman

Predictions only

Length 1,950 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KIAA1549Q9HCM3 NRN1L-202ENST00000576147 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
KIAA1549Q9HCM3 AC015688.4-201ENST00000580780 1647 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
KIAA1549Q9HCM3 NAT9-212ENST00000581136 1011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
KIAA1549Q9HCM3 MRPL37P1-201ENST00000592451 1337 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
KIAA1549Q9HCM3 CYP4F23P-201ENST00000593402 1579 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
KIAA1549Q9HCM3 HIST2H2AA4-201ENST00000607355 564 ntAPPRIS P1 BASIC13.17□□□□□ -0.3
KIAA1549Q9HCM3 TCP10-210ENST00000617120 2182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
KIAA1549Q9HCM3 COG3-206ENST00000617493 1809 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
KIAA1549Q9HCM3 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
KIAA1549Q9HCM3 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
KIAA1549Q9HCM3 FKBP5-201ENST00000357266 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
KIAA1549Q9HCM3 DDX1-201ENST00000233084 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
KIAA1549Q9HCM3 LIMK2-204ENST00000406516 2657 ntTSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
KIAA1549Q9HCM3 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
KIAA1549Q9HCM3 PIK3IP1-201ENST00000215912 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
KIAA1549Q9HCM3 ZPBP2-202ENST00000377940 2177 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
KIAA1549Q9HCM3 AC136759.1-202ENST00000530858 2194 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
KIAA1549Q9HCM3 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
KIAA1549Q9HCM3 ZNF84-215ENST00000543758 3501 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
KIAA1549Q9HCM3 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
KIAA1549Q9HCM3 NFYA-202ENST00000353205 1660 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
KIAA1549Q9HCM3 SELPLG-202ENST00000388962 1613 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
KIAA1549Q9HCM3 SLC39A8-202ENST00000394833 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
KIAA1549Q9HCM3 CTCFL-210ENST00000481655 1512 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
KIAA1549Q9HCM3 INPP5K-201ENST00000320345 2880 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
KIAA1549Q9HCM3 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
KIAA1549Q9HCM3 AC010547.4-201ENST00000561754 1378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
KIAA1549Q9HCM3 LINC00884-202ENST00000448892 2680 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
KIAA1549Q9HCM3 GLIDR-202ENST00000625350 2588 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
KIAA1549Q9HCM3 SYCE2-201ENST00000293695 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
KIAA1549Q9HCM3 RPL13A-201ENST00000391857 1181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
KIAA1549Q9HCM3 OGFR-AS1-201ENST00000431361 668 ntTSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
KIAA1549Q9HCM3 AL157392.3-216ENST00000437446 462 ntTSL 3 BASIC13.16□□□□□ -0.3
KIAA1549Q9HCM3 RASA3-IT1-201ENST00000454005 380 ntTSL 3 BASIC13.16□□□□□ -0.3
KIAA1549Q9HCM3 RN7SL11P-201ENST00000471305 293 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
KIAA1549Q9HCM3 AC074194.1-201ENST00000505025 622 ntTSL 4 BASIC13.16□□□□□ -0.3
KIAA1549Q9HCM3 FGFR3P5-201ENST00000564496 886 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
KIAA1549Q9HCM3 LINC01229-204ENST00000568751 720 ntTSL 3 BASIC13.16□□□□□ -0.3
KIAA1549Q9HCM3 ELOA3C-201ENST00000620688 1218 ntAPPRIS P1 BASIC13.16□□□□□ -0.3
KIAA1549Q9HCM3 GDI2-203ENST00000380191 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
KIAA1549Q9HCM3 PTBP1-203ENST00000356948 3598 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
KIAA1549Q9HCM3 MKS1-202ENST00000393119 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
KIAA1549Q9HCM3 MKRN3-201ENST00000314520 2337 ntAPPRIS P1 BASIC13.16□□□□□ -0.3
KIAA1549Q9HCM3 FAM131B-206ENST00000443739 4382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
KIAA1549Q9HCM3 TNFRSF13C-201ENST00000291232 3944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
KIAA1549Q9HCM3 AC113367.3-201ENST00000508316 1912 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
KIAA1549Q9HCM3 AC082651.4-201ENST00000483023 1852 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
KIAA1549Q9HCM3 AKR1A1-202ENST00000372070 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
KIAA1549Q9HCM3 CDK2AP1-205ENST00000542174 1812 ntTSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
KIAA1549Q9HCM3 PHACTR3-204ENST00000371015 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
KIAA1549Q9HCM3 ALAS2-202ENST00000335854 1795 ntTSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
KIAA1549Q9HCM3 UBE3A-207ENST00000614096 8741 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
KIAA1549Q9HCM3 PCOLCE-201ENST00000223061 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
KIAA1549Q9HCM3 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
KIAA1549Q9HCM3 PDZD4-202ENST00000393758 3763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
KIAA1549Q9HCM3 TGM6-202ENST00000381423 2158 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
KIAA1549Q9HCM3 CSDC2-201ENST00000306149 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
KIAA1549Q9HCM3 MAPK14-204ENST00000468133 1376 ntTSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
KIAA1549Q9HCM3 COL25A1-203ENST00000399132 2724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
KIAA1549Q9HCM3 MAGEA2-203ENST00000611557 2024 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
KIAA1549Q9HCM3 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
KIAA1549Q9HCM3 STIP1-207ENST00000538945 1900 ntTSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
KIAA1549Q9HCM3 LINC01352-201ENST00000431347 962 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
KIAA1549Q9HCM3 LINC01006-204ENST00000435354 545 ntTSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
KIAA1549Q9HCM3 AL139246.4-201ENST00000442305 514 ntTSL 3 BASIC13.16□□□□□ -0.3
KIAA1549Q9HCM3 PRSS30P-202ENST00000475030 752 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
KIAA1549Q9HCM3 PRSS30P-205ENST00000506153 699 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
KIAA1549Q9HCM3 AC106794.1-201ENST00000506935 792 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
KIAA1549Q9HCM3 MFSD11-218ENST00000591864 446 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
KIAA1549Q9HCM3 IFITM3-204ENST00000602735 713 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
KIAA1549Q9HCM3 AC018629.1-201ENST00000623381 1736 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
KIAA1549Q9HCM3 SEPT9-228ENST00000590294 2816 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
KIAA1549Q9HCM3 ABLIM2-209ENST00000505872 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
KIAA1549Q9HCM3 DMTN-202ENST00000358242 2772 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
KIAA1549Q9HCM3 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
KIAA1549Q9HCM3 PVR-202ENST00000344956 3166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
KIAA1549Q9HCM3 RCC1-201ENST00000373831 1577 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
KIAA1549Q9HCM3 WNT16-201ENST00000222462 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
KIAA1549Q9HCM3 ENO2-211ENST00000541477 2549 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
KIAA1549Q9HCM3 CD8A-203ENST00000409511 3048 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
KIAA1549Q9HCM3 RABIF-201ENST00000367262 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
KIAA1549Q9HCM3 DLX4-202ENST00000411890 1404 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
KIAA1549Q9HCM3 PCCB-215ENST00000482086 1436 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
KIAA1549Q9HCM3 UGDH-201ENST00000316423 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
KIAA1549Q9HCM3 AC090505.1-201ENST00000430515 1834 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
KIAA1549Q9HCM3 AC025171.1-202ENST00000499871 2271 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
KIAA1549Q9HCM3 COCH-203ENST00000460581 2688 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
KIAA1549Q9HCM3 NUDT1-201ENST00000339737 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
KIAA1549Q9HCM3 NUDT1-202ENST00000343985 771 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
KIAA1549Q9HCM3 NUDT1-203ENST00000356714 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
KIAA1549Q9HCM3 NUDT1-204ENST00000397046 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
KIAA1549Q9HCM3 R3HDM2P2-201ENST00000401880 2116 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
KIAA1549Q9HCM3 KRTAP19-9P-201ENST00000421795 191 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
KIAA1549Q9HCM3 FOXP4-AS1-203ENST00000439386 404 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
KIAA1549Q9HCM3 IMP3P2-201ENST00000489760 475 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
KIAA1549Q9HCM3 PMP22-206ENST00000494511 872 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
KIAA1549Q9HCM3 HHIP-AS1-201ENST00000503066 897 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
KIAA1549Q9HCM3 AC008438.1-201ENST00000507521 549 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
KIAA1549Q9HCM3 HNRNPA1P36-201ENST00000521313 955 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
KIAA1549Q9HCM3 IGHVIII-5-2-201ENST00000522505 261 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.9 ms