Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZT3

SLIRP, SRA stem-loop-interacting RNA-binding protein, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 109 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLIRPQ9GZT3 AL355102.3-201ENST00000554299 1678 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
SLIRPQ9GZT3 MARCH2-208ENST00000602117 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SLIRPQ9GZT3 WDR33-201ENST00000322313 9471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SLIRPQ9GZT3 DIRAS3-201ENST00000370981 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
SLIRPQ9GZT3 NGLY1-205ENST00000417874 2062 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
SLIRPQ9GZT3 ROPN1B-202ENST00000504401 2050 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SLIRPQ9GZT3 PBRM1-204ENST00000394830 5071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SLIRPQ9GZT3 RET-205ENST00000615310 4337 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
SLIRPQ9GZT3 CAMKK2-202ENST00000337174 5304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SLIRPQ9GZT3 MFSD2B-202ENST00000406420 1528 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SLIRPQ9GZT3 SMAD2-212ENST00000591214 1714 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SLIRPQ9GZT3 FAM124B-201ENST00000243806 2030 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SLIRPQ9GZT3 SIGLEC12-201ENST00000291707 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SLIRPQ9GZT3 ALPL-207ENST00000540617 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SLIRPQ9GZT3 ACSM2A-202ENST00000396104 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SLIRPQ9GZT3 SREBF1-202ENST00000355815 4253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SLIRPQ9GZT3 PRR26-202ENST00000441152 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SLIRPQ9GZT3 DNAJB13-201ENST00000339764 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SLIRPQ9GZT3 MOCS3-201ENST00000244051 5106 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SLIRPQ9GZT3 FBP1-201ENST00000375326 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SLIRPQ9GZT3 AC093627.6-201ENST00000478759 1365 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SLIRPQ9GZT3 SIRT6-214ENST00000601488 1361 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SLIRPQ9GZT3 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SLIRPQ9GZT3 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SLIRPQ9GZT3 CRYBA2-201ENST00000295728 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SLIRPQ9GZT3 LCE5A-201ENST00000334269 819 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SLIRPQ9GZT3 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SLIRPQ9GZT3 CMC4-201ENST00000369479 864 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SLIRPQ9GZT3 HLA-H-201ENST00000383620 1096 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
SLIRPQ9GZT3 DSCR3-204ENST00000399001 821 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SLIRPQ9GZT3 CBR1-202ENST00000399191 838 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SLIRPQ9GZT3 FO393414.2-201ENST00000405153 598 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
SLIRPQ9GZT3 AC074338.1-201ENST00000416825 156 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
SLIRPQ9GZT3 AL049612.1-201ENST00000427017 694 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SLIRPQ9GZT3 PIGBOS1-201ENST00000436697 866 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SLIRPQ9GZT3 AL731661.1-201ENST00000438217 758 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SLIRPQ9GZT3 HCG4B-203ENST00000450128 991 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
SLIRPQ9GZT3 AC108751.1-201ENST00000490852 363 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
SLIRPQ9GZT3 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SLIRPQ9GZT3 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SLIRPQ9GZT3 AC087276.3-201ENST00000526220 787 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SLIRPQ9GZT3 BRK1-201ENST00000530758 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SLIRPQ9GZT3 NAA60-217ENST00000572942 1089 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SLIRPQ9GZT3 TMEM220-AS1-206ENST00000583343 876 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SLIRPQ9GZT3 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SLIRPQ9GZT3 AC010503.1-201ENST00000596027 520 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SLIRPQ9GZT3 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SLIRPQ9GZT3 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
SLIRPQ9GZT3 AC007064.4-201ENST00000637740 555 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
SLIRPQ9GZT3 KCTD9-201ENST00000221200 3401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SLIRPQ9GZT3 PKD1P6-NPIPP1-202ENST00000605794 2902 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SLIRPQ9GZT3 MARK2-206ENST00000425897 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SLIRPQ9GZT3 GPR84-202ENST00000551809 2041 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SLIRPQ9GZT3 MKL1-202ENST00000396617 4505 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SLIRPQ9GZT3 CCT3-204ENST00000368259 1815 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SLIRPQ9GZT3 PGGHG-204ENST00000409655 2963 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SLIRPQ9GZT3 CCNI-201ENST00000237654 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SLIRPQ9GZT3 TJAP1-204ENST00000372449 2695 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SLIRPQ9GZT3 KRT8P14-201ENST00000414254 1442 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
SLIRPQ9GZT3 CHID1-215ENST00000528581 1431 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SLIRPQ9GZT3 NR6A1-205ENST00000487099 7031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SLIRPQ9GZT3 MSMO1-201ENST00000261507 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SLIRPQ9GZT3 MLF1-217ENST00000619577 2290 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SLIRPQ9GZT3 FBN3-205ENST00000600128 9362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SLIRPQ9GZT3 TRIP6-209ENST00000619988 1303 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SLIRPQ9GZT3 NDFIP2-205ENST00000612570 4648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SLIRPQ9GZT3 ZMYM3-206ENST00000373988 6021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
SLIRPQ9GZT3 GLB1L-201ENST00000295759 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SLIRPQ9GZT3 GRHL1-202ENST00000405379 1881 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SLIRPQ9GZT3 ADCY4-202ENST00000418030 3353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SLIRPQ9GZT3 AL137783.1-201ENST00000623494 1896 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
SLIRPQ9GZT3 DAAM2-201ENST00000274867 6194 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SLIRPQ9GZT3 FBXL7-203ENST00000510662 1758 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SLIRPQ9GZT3 WDR5-201ENST00000358625 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SLIRPQ9GZT3 OR2V1-204ENST00000641551 2423 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
SLIRPQ9GZT3 MAGEA2-202ENST00000598543 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SLIRPQ9GZT3 PAK2-201ENST00000327134 6139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
SLIRPQ9GZT3 ZBTB49-201ENST00000337872 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SLIRPQ9GZT3 UGGT2-201ENST00000376712 2240 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SLIRPQ9GZT3 PSMD13-215ENST00000621534 1572 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
SLIRPQ9GZT3 SLC35F2-203ENST00000525071 3331 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
SLIRPQ9GZT3 ABCF3-201ENST00000292808 2453 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
SLIRPQ9GZT3 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SLIRPQ9GZT3 HAP1-204ENST00000393939 5683 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SLIRPQ9GZT3 TBX6-202ENST00000395224 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SLIRPQ9GZT3 KCNMA1-287ENST00000640632 2808 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
SLIRPQ9GZT3 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
SLIRPQ9GZT3 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SLIRPQ9GZT3 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SLIRPQ9GZT3 TNNC2-202ENST00000372557 780 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
SLIRPQ9GZT3 C1QA-201ENST00000374642 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SLIRPQ9GZT3 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SLIRPQ9GZT3 PDHA1-203ENST00000379805 734 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
SLIRPQ9GZT3 SLC4A1APP2-201ENST00000424054 1259 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
SLIRPQ9GZT3 USP40-206ENST00000443711 628 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
SLIRPQ9GZT3 GSTK1-207ENST00000479303 1185 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SLIRPQ9GZT3 SLC50A1-209ENST00000484157 886 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
SLIRPQ9GZT3 TTLL12-204ENST00000494035 888 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
SLIRPQ9GZT3 FBXL21-206ENST00000495672 589 ntTSL 4 BASIC13.12□□□□□ -0.31
SLIRPQ9GZT3 AC090735.1-201ENST00000523881 488 ntTSL 4 BASIC13.12□□□□□ -0.31
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