Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZS1

FOXP3, Forkhead box protein P3, humanhuman

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Length 431 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXP3Q9BZS1 MST1P2-201ENST00000457982 2291 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
FOXP3Q9BZS1 SLC35C2-201ENST00000243896 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
FOXP3Q9BZS1 ITSN2-203ENST00000406921 4563 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
FOXP3Q9BZS1 VGLL4-202ENST00000413604 1554 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
FOXP3Q9BZS1 KCNT1-208ENST00000488444 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
FOXP3Q9BZS1 MYH6-202ENST00000405093 5941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
FOXP3Q9BZS1 MFNG-202ENST00000416983 2034 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
FOXP3Q9BZS1 KLK15-201ENST00000326856 1389 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
FOXP3Q9BZS1 GPRC5C-202ENST00000392627 2988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
FOXP3Q9BZS1 AL589669.1-201ENST00000639829 1506 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
FOXP3Q9BZS1 MYCN-202ENST00000638417 1693 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
FOXP3Q9BZS1 SDCBP2-AS1-201ENST00000446423 1811 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
FOXP3Q9BZS1 CUL3-202ENST00000344951 6592 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
FOXP3Q9BZS1 RUNX3-201ENST00000308873 3861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
FOXP3Q9BZS1 AL589740.1-203ENST00000433637 1984 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
FOXP3Q9BZS1 MAP3K12-201ENST00000267079 4319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
FOXP3Q9BZS1 FBLN2-203ENST00000404922 4318 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
FOXP3Q9BZS1 KLHL33-203ENST00000637228 5404 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
FOXP3Q9BZS1 SAFB2-201ENST00000252542 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
FOXP3Q9BZS1 RPS28-203ENST00000600659 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
FOXP3Q9BZS1 SCN3B-201ENST00000299333 5665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
FOXP3Q9BZS1 DMRT2-202ENST00000302441 1495 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
FOXP3Q9BZS1 TRIM13-201ENST00000356017 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
FOXP3Q9BZS1 EXOC6B-202ENST00000410104 5795 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
FOXP3Q9BZS1 SLC35E2-202ENST00000355439 2078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
FOXP3Q9BZS1 GSTCD-206ENST00000507281 2091 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
FOXP3Q9BZS1 SERINC2-206ENST00000536859 2072 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
FOXP3Q9BZS1 TBC1D17-201ENST00000221543 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
FOXP3Q9BZS1 TBC1D17-209ENST00000622860 2370 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
FOXP3Q9BZS1 TMCO3-207ENST00000474393 2843 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
FOXP3Q9BZS1 PFKFB4-201ENST00000232375 3586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
FOXP3Q9BZS1 MAPKBP1-215ENST00000514566 5394 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
FOXP3Q9BZS1 H2BFWT-201ENST00000217926 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
FOXP3Q9BZS1 AXL-201ENST00000301178 4737 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
FOXP3Q9BZS1 BANF1-201ENST00000312175 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
FOXP3Q9BZS1 CXorf40A-201ENST00000359293 974 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
FOXP3Q9BZS1 MPV17-203ENST00000380044 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
FOXP3Q9BZS1 BLCAP-205ENST00000397137 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
FOXP3Q9BZS1 MPV17-208ENST00000405076 603 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
FOXP3Q9BZS1 AL513303.2-201ENST00000413339 536 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
FOXP3Q9BZS1 AC016876.1-201ENST00000415124 352 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
FOXP3Q9BZS1 AL645941.1-201ENST00000415875 338 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
FOXP3Q9BZS1 DDX19A-202ENST00000417604 1703 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
FOXP3Q9BZS1 AC112492.5-201ENST00000421897 457 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
FOXP3Q9BZS1 MEP1AP4-201ENST00000423244 1087 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
FOXP3Q9BZS1 TTTY23B-201ENST00000442790 549 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
FOXP3Q9BZS1 VCX3B-204ENST00000453306 868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
FOXP3Q9BZS1 ACA64.2-201ENST00000459014 129 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
FOXP3Q9BZS1 AP000721.1-201ENST00000535431 559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
FOXP3Q9BZS1 KRT17P8-201ENST00000540749 863 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
FOXP3Q9BZS1 AC105339.1-202ENST00000559535 1283 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
FOXP3Q9BZS1 AC108134.3-202ENST00000571404 1207 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
FOXP3Q9BZS1 LINC01703-202ENST00000602806 595 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
FOXP3Q9BZS1 AL162274.1-201ENST00000617191 1098 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
FOXP3Q9BZS1 ZNF70-201ENST00000341976 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
FOXP3Q9BZS1 KIF1C-201ENST00000320785 7919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
FOXP3Q9BZS1 PEX26-205ENST00000610387 3924 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
FOXP3Q9BZS1 SCAP-206ENST00000428413 3749 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
FOXP3Q9BZS1 APBB3-201ENST00000354402 1810 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
FOXP3Q9BZS1 ASB10-204ENST00000420175 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
FOXP3Q9BZS1 TMEM40-204ENST00000435218 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
FOXP3Q9BZS1 MSI1-201ENST00000257552 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
FOXP3Q9BZS1 PIK3R1-211ENST00000521381 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
FOXP3Q9BZS1 DLGAP1-213ENST00000534970 2365 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
FOXP3Q9BZS1 KSR1-216ENST00000582410 2392 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
FOXP3Q9BZS1 ZNF655-212ENST00000424881 4666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
FOXP3Q9BZS1 AC007603.1-201ENST00000563124 2085 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
FOXP3Q9BZS1 LRRC20-204ENST00000373224 3095 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
FOXP3Q9BZS1 ZMYND10-202ENST00000360165 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
FOXP3Q9BZS1 CTSD-207ENST00000636571 1790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
FOXP3Q9BZS1 CCDC47-201ENST00000225726 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
FOXP3Q9BZS1 ITSN1-212ENST00000399367 5722 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
FOXP3Q9BZS1 CMBL-201ENST00000296658 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
FOXP3Q9BZS1 FES-202ENST00000394300 2302 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
FOXP3Q9BZS1 GCLM-204ENST00000615724 3008 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
FOXP3Q9BZS1 UBQLN1-202ENST00000376395 4118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
FOXP3Q9BZS1 ZBTB17-202ENST00000375743 2745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
FOXP3Q9BZS1 NYNRIN-201ENST00000382554 7857 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
FOXP3Q9BZS1 SCYL1-208ENST00000527009 2586 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
FOXP3Q9BZS1 ATP6AP2-213ENST00000636251 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
FOXP3Q9BZS1 LINC01184-204ENST00000501702 2977 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
FOXP3Q9BZS1 ARHGAP9-213ENST00000550288 2818 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
FOXP3Q9BZS1 AC023090.2-201ENST00000625182 2110 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
FOXP3Q9BZS1 RLF-201ENST00000372771 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
FOXP3Q9BZS1 IBA57-201ENST00000366711 7817 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
FOXP3Q9BZS1 DCUN1D3-201ENST00000324344 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
FOXP3Q9BZS1 TEX13C-201ENST00000632600 5095 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
FOXP3Q9BZS1 YWHAE-208ENST00000571732 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
FOXP3Q9BZS1 GTF2I-212ENST00000573035 4548 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
FOXP3Q9BZS1 SGK2-204ENST00000373100 2225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
FOXP3Q9BZS1 SCAND1-201ENST00000305978 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
FOXP3Q9BZS1 ATP1A1-AS1-202ENST00000369492 1011 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
FOXP3Q9BZS1 SZT2-AS1-201ENST00000396885 699 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
FOXP3Q9BZS1 AC079776.1-201ENST00000401540 1152 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
FOXP3Q9BZS1 MIR1909-201ENST00000411312 80 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
FOXP3Q9BZS1 KCNQ1DN-201ENST00000441418 1093 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
FOXP3Q9BZS1 AL606760.2-202ENST00000452466 524 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
FOXP3Q9BZS1 BX322559.1-201ENST00000456613 319 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
FOXP3Q9BZS1 AC008969.1-205ENST00000553254 876 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
FOXP3Q9BZS1 AC005520.2-201ENST00000556194 573 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
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