Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXC9

BBS2, Bardet-Biedl syndrome 2 protein, humanhuman

Predictions only

Length 721 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BBS2Q9BXC9 AP001007.1-201ENST00000526796 645 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
BBS2Q9BXC9 RDH5-204ENST00000548082 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
BBS2Q9BXC9 AL133523.1-201ENST00000554537 331 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
BBS2Q9BXC9 SSTR5-AS1-201ENST00000565992 575 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
BBS2Q9BXC9 TSPO-206ENST00000583777 636 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
BBS2Q9BXC9 AL606495.2-201ENST00000605867 535 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
BBS2Q9BXC9 AL445288.1-201ENST00000610846 654 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
BBS2Q9BXC9 TNFRSF14-AS1-201ENST00000416860 3522 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
BBS2Q9BXC9 PAK6-202ENST00000455577 4215 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
BBS2Q9BXC9 TLE4-204ENST00000376537 2793 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
BBS2Q9BXC9 PCDHB13-201ENST00000341948 5061 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
BBS2Q9BXC9 HILPDA-201ENST00000257696 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
BBS2Q9BXC9 RABEPK-201ENST00000259460 1313 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
BBS2Q9BXC9 IGHA2-202ENST00000497872 1320 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
BBS2Q9BXC9 ZNF568-203ENST00000427117 1827 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
BBS2Q9BXC9 STXBP5-207ENST00000546097 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
BBS2Q9BXC9 USP36-201ENST00000312010 5234 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
BBS2Q9BXC9 AC092384.3-202ENST00000564646 2873 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
BBS2Q9BXC9 MAD1L1-203ENST00000402746 2355 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
BBS2Q9BXC9 AC091100.1-201ENST00000558424 2354 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
BBS2Q9BXC9 PAK1-210ENST00000528203 1878 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
BBS2Q9BXC9 ANKRD42-208ENST00000531895 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
BBS2Q9BXC9 ZFR2-201ENST00000262961 4756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
BBS2Q9BXC9 GINS3-203ENST00000426538 1728 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
BBS2Q9BXC9 HMBOX1-210ENST00000523613 1730 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
BBS2Q9BXC9 TLDC2-201ENST00000217320 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
BBS2Q9BXC9 ABTB1-206ENST00000468137 2065 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
BBS2Q9BXC9 MBD1-203ENST00000339998 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
BBS2Q9BXC9 MRFAP1-202ENST00000382581 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
BBS2Q9BXC9 APBA2-205ENST00000558330 3349 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
BBS2Q9BXC9 PSMC3-213ENST00000619920 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
BBS2Q9BXC9 CRK-201ENST00000300574 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
BBS2Q9BXC9 AP002360.1-202ENST00000530460 2462 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
BBS2Q9BXC9 MEIOC-201ENST00000409122 4604 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
BBS2Q9BXC9 METTL6-201ENST00000383789 1413 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
BBS2Q9BXC9 DENND4C-209ENST00000602925 6831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
BBS2Q9BXC9 LINGO1-201ENST00000355300 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
BBS2Q9BXC9 SRP14-201ENST00000267884 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
BBS2Q9BXC9 AC007952.1-202ENST00000399083 1173 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
BBS2Q9BXC9 MACROD2-AS1-202ENST00000455291 663 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
BBS2Q9BXC9 SERPINA13P-202ENST00000478994 924 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
BBS2Q9BXC9 AC044849.1-201ENST00000519737 1188 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
BBS2Q9BXC9 AC022903.1-201ENST00000579327 469 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
BBS2Q9BXC9 STPG3-204ENST00000611378 1015 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
BBS2Q9BXC9 AC106017.2-201ENST00000631194 1173 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
BBS2Q9BXC9 AL590644.3-201ENST00000635428 1228 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
BBS2Q9BXC9 CCDC121-202ENST00000394775 1472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
BBS2Q9BXC9 PPM1B-204ENST00000378551 3877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
BBS2Q9BXC9 MYLK2-201ENST00000375985 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
BBS2Q9BXC9 SSH3-203ENST00000376757 2990 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
BBS2Q9BXC9 LINC02228-204ENST00000642115 2962 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
BBS2Q9BXC9 UGT3A1-204ENST00000507113 1650 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
BBS2Q9BXC9 AL138725.1-201ENST00000407347 1314 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
BBS2Q9BXC9 PDHB-206ENST00000474765 1503 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
BBS2Q9BXC9 THEMIS2-202ENST00000373921 2687 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
BBS2Q9BXC9 SMARCD2-202ENST00000323347 1935 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
BBS2Q9BXC9 RALYL-207ENST00000521695 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
BBS2Q9BXC9 PLVAP-201ENST00000252590 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
BBS2Q9BXC9 GRM1-201ENST00000282753 6622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
BBS2Q9BXC9 OTULIN-201ENST00000284274 7800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
BBS2Q9BXC9 KRT8P29-201ENST00000420409 1371 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
BBS2Q9BXC9 OSCP1-204ENST00000433045 1381 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
BBS2Q9BXC9 GLIDR-204ENST00000638724 1765 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
BBS2Q9BXC9 TBXAS1-208ENST00000448866 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
BBS2Q9BXC9 IVL-201ENST00000368764 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
BBS2Q9BXC9 ASNS-201ENST00000175506 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
BBS2Q9BXC9 PPT1-215ENST00000641471 2368 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
BBS2Q9BXC9 RER1-209ENST00000605895 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
BBS2Q9BXC9 LDLR-204ENST00000545707 2429 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
BBS2Q9BXC9 HDHD3-201ENST00000238379 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
BBS2Q9BXC9 HNRNPR-212ENST00000606561 1837 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
BBS2Q9BXC9 ENDOD1-201ENST00000278505 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
BBS2Q9BXC9 MBTD1-201ENST00000376381 1420 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
BBS2Q9BXC9 APBA1-201ENST00000265381 6534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
BBS2Q9BXC9 MAP1LC3B-201ENST00000268607 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
BBS2Q9BXC9 GPAT2-204ENST00000453542 2466 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
BBS2Q9BXC9 KRT71-201ENST00000267119 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
BBS2Q9BXC9 SLC6A2-204ENST00000561820 2268 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
BBS2Q9BXC9 OTUD6A-201ENST00000338352 1689 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
BBS2Q9BXC9 RN7SKP230-201ENST00000365642 335 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
BBS2Q9BXC9 FAM24B-202ENST00000368898 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
BBS2Q9BXC9 ZNF248-202ENST00000374648 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
BBS2Q9BXC9 CLIC1-206ENST00000375779 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
BBS2Q9BXC9 NCR3-204ENST00000376073 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
BBS2Q9BXC9 AL021707.3-201ENST00000418803 527 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
BBS2Q9BXC9 BX284668.4-201ENST00000453917 508 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
BBS2Q9BXC9 ACTG1P17-201ENST00000558391 1119 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
BBS2Q9BXC9 PAX4-207ENST00000611453 1235 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
BBS2Q9BXC9 SFTA2-203ENST00000634371 815 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
BBS2Q9BXC9 TMEM92-201ENST00000300433 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
BBS2Q9BXC9 CD19-201ENST00000324662 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
BBS2Q9BXC9 HSPA4L-204ENST00000508776 3020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
BBS2Q9BXC9 PCDH17-201ENST00000377918 8232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
BBS2Q9BXC9 TMEM40-204ENST00000435218 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
BBS2Q9BXC9 TRIM13-204ENST00000420995 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
BBS2Q9BXC9 LONP1-213ENST00000590729 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
BBS2Q9BXC9 PSMD14-201ENST00000409682 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
BBS2Q9BXC9 RABL2A-206ENST00000409842 1979 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
BBS2Q9BXC9 CCAR2-202ENST00000389279 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
BBS2Q9BXC9 ECSIT-209ENST00000591104 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.4 ms