Protein–RNA interactions for Protein: Q9BT67

NDFIP1, NEDD4 family-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 221 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDFIP1Q9BT67 PLAGL1-201ENST00000354765 3663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
NDFIP1Q9BT67 TNFRSF1B-201ENST00000376259 3683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
NDFIP1Q9BT67 SAR1A-204ENST00000373241 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
NDFIP1Q9BT67 F2-201ENST00000311907 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
NDFIP1Q9BT67 MST1P2-201ENST00000457982 2291 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
NDFIP1Q9BT67 MTMR3-201ENST00000323630 5866 ntTSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
NDFIP1Q9BT67 GALC-206ENST00000544807 2528 ntTSL 2 BASIC11.53□□□□□ -0.56
NDFIP1Q9BT67 ATP6AP2-233ENST00000638153 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
NDFIP1Q9BT67 NUBPL-201ENST00000281081 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
NDFIP1Q9BT67 TMEM230-202ENST00000342308 1562 ntTSL 2 BASIC11.53□□□□□ -0.56
NDFIP1Q9BT67 AC018442.1-201ENST00000421439 2061 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
NDFIP1Q9BT67 CDH1-213ENST00000612417 2068 ntTSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
NDFIP1Q9BT67 GRN-201ENST00000053867 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
NDFIP1Q9BT67 SFXN3-202ENST00000393459 3098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
NDFIP1Q9BT67 KLHL7-202ENST00000339077 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
NDFIP1Q9BT67 SLC26A11-202ENST00000411502 2872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.53□□□□□ -0.56
NDFIP1Q9BT67 EIF2B4-205ENST00000445933 1608 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
NDFIP1Q9BT67 TMEM117-207ENST00000551577 2643 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
NDFIP1Q9BT67 YLPM1-207ENST00000552421 4899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
NDFIP1Q9BT67 FBXL16-201ENST00000324361 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
NDFIP1Q9BT67 IMPDH1-204ENST00000419067 2431 ntTSL 3 BASIC11.52□□□□□ -0.56
NDFIP1Q9BT67 LRRC41-208ENST00000617760 2158 ntTSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.56
NDFIP1Q9BT67 TPRX1-201ENST00000322175 1924 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
NDFIP1Q9BT67 RLIM-202ENST00000349225 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.52□□□□□ -0.56
NDFIP1Q9BT67 ILF2-201ENST00000361891 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
NDFIP1Q9BT67 ATG10-202ENST00000355178 1438 ntTSL 2 BASIC11.52□□□□□ -0.56
NDFIP1Q9BT67 ANAPC13-206ENST00000514612 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.52□□□□□ -0.56
NDFIP1Q9BT67 RBM6-201ENST00000266022 3750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
NDFIP1Q9BT67 KLHL25-201ENST00000337975 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
NDFIP1Q9BT67 ATP7B-202ENST00000344297 5861 ntTSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.56
NDFIP1Q9BT67 FAM219A-201ENST00000297620 3588 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.52□□□□□ -0.56
NDFIP1Q9BT67 CCDC105-201ENST00000292574 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
NDFIP1Q9BT67 ARAP3-203ENST00000508305 4927 ntTSL 2 BASIC11.52□□□□□ -0.56
NDFIP1Q9BT67 RAPGEF6-207ENST00000507093 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
NDFIP1Q9BT67 TRAK1-210ENST00000613405 4672 ntTSL 2 BASIC11.52□□□□□ -0.56
NDFIP1Q9BT67 GALNT3-201ENST00000392701 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
NDFIP1Q9BT67 RGMA-202ENST00000425933 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.56
NDFIP1Q9BT67 KCNN2-206ENST00000512097 3076 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.56
NDFIP1Q9BT67 NOX3-201ENST00000159060 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
NDFIP1Q9BT67 CGB7-203ENST00000597853 3386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.52□□□□□ -0.56
NDFIP1Q9BT67 HCFC1-202ENST00000369984 8375 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
NDFIP1Q9BT67 LMAN2L-201ENST00000264963 2397 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
NDFIP1Q9BT67 ZFAND6-201ENST00000261749 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
NDFIP1Q9BT67 ZBTB14-202ENST00000400143 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
NDFIP1Q9BT67 C14orf178-201ENST00000355883 642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
NDFIP1Q9BT67 ATP5G3-202ENST00000392541 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
NDFIP1Q9BT67 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
NDFIP1Q9BT67 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC11.52□□□□□ -0.57
NDFIP1Q9BT67 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
NDFIP1Q9BT67 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
NDFIP1Q9BT67 AKR1A1-204ENST00000471651 1018 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
NDFIP1Q9BT67 ALG1L8P-201ENST00000533887 760 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
NDFIP1Q9BT67 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC11.52□□□□□ -0.57
NDFIP1Q9BT67 AC126696.3-201ENST00000563993 575 ntTSL 4 BASIC11.52□□□□□ -0.57
NDFIP1Q9BT67 AC040169.1-201ENST00000565382 521 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
NDFIP1Q9BT67 UBL5-208ENST00000593087 320 ntTSL 3 BASIC11.52□□□□□ -0.57
NDFIP1Q9BT67 ATP2A3-202ENST00000352011 3274 ntTSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
NDFIP1Q9BT67 MARK4-201ENST00000262891 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
NDFIP1Q9BT67 CERCAM-213ENST00000612334 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
NDFIP1Q9BT67 SYNRG-231ENST00000622045 3859 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
NDFIP1Q9BT67 MFF-204ENST00000353339 2186 ntTSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
NDFIP1Q9BT67 AC092535.1-201ENST00000417557 2165 ntTSL 2 BASIC11.52□□□□□ -0.57
NDFIP1Q9BT67 ACE-201ENST00000290863 2479 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
NDFIP1Q9BT67 TTC28-AS1-212ENST00000433317 3080 ntTSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
NDFIP1Q9BT67 AC060234.2-201ENST00000428825 1610 ntTSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
NDFIP1Q9BT67 ESR2-206ENST00000553796 1634 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
NDFIP1Q9BT67 ZNF32-AS3-201ENST00000458063 1932 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
NDFIP1Q9BT67 AC089987.1-201ENST00000551654 2209 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
NDFIP1Q9BT67 NFKB2-204ENST00000428099 3416 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
NDFIP1Q9BT67 GORASP2-201ENST00000234160 3173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
NDFIP1Q9BT67 PRR22-202ENST00000419421 1392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.52□□□□□ -0.57
NDFIP1Q9BT67 KRT8P12-202ENST00000472924 1397 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
NDFIP1Q9BT67 PHYHIP-202ENST00000454243 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
NDFIP1Q9BT67 DGCR2-201ENST00000263196 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
NDFIP1Q9BT67 DGCR2-206ENST00000545799 4484 ntTSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
NDFIP1Q9BT67 KCNJ9-201ENST00000368088 4170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
NDFIP1Q9BT67 SF1-209ENST00000433274 2317 ntTSL 2 BASIC11.52□□□□□ -0.57
NDFIP1Q9BT67 MAD1L1-204ENST00000406869 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
NDFIP1Q9BT67 STK40-204ENST00000373132 3621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
NDFIP1Q9BT67 FUCA2-201ENST00000002165 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
NDFIP1Q9BT67 AC015802.1-201ENST00000588104 1449 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
NDFIP1Q9BT67 SIRPA-202ENST00000358771 3996 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
NDFIP1Q9BT67 USP10-201ENST00000219473 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
NDFIP1Q9BT67 UBFD1-207ENST00000567212 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.51□□□□□ -0.57
NDFIP1Q9BT67 PFDN4-201ENST00000371419 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
NDFIP1Q9BT67 SCAF4-202ENST00000399804 4127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
NDFIP1Q9BT67 GPR173-201ENST00000332582 4485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
NDFIP1Q9BT67 NEAT1-201ENST00000499732 1811 ntTSL 2 BASIC11.51□□□□□ -0.57
NDFIP1Q9BT67 RNF44-201ENST00000274811 4155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
NDFIP1Q9BT67 WDR26-201ENST00000414423 6872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
NDFIP1Q9BT67 CPSF7-205ENST00000439958 3524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
NDFIP1Q9BT67 ZNF655-201ENST00000252713 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
NDFIP1Q9BT67 SIGLEC16-202ENST00000602139 2510 ntTSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
NDFIP1Q9BT67 AC005622.1-202ENST00000637093 1543 ntTSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
NDFIP1Q9BT67 AC005523.2-201ENST00000601192 3568 ntTSL 4 BASIC11.51□□□□□ -0.57
NDFIP1Q9BT67 ADPRHL1-201ENST00000356501 1877 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
NDFIP1Q9BT67 HARS-205ENST00000457527 1896 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
NDFIP1Q9BT67 GOLGA8H-201ENST00000566740 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
NDFIP1Q9BT67 GOLGA8J-201ENST00000567927 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
NDFIP1Q9BT67 ZNF576-201ENST00000336564 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78.5 ms