Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSV6

TSEN34, tRNA-splicing endonuclease subunit Sen34, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 310 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSEN34Q9BSV6 FAM168A-204ENST00000450446 1364 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TSEN34Q9BSV6 TK2-207ENST00000544898 3441 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TSEN34Q9BSV6 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TSEN34Q9BSV6 IL12RB2-201ENST00000262345 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TSEN34Q9BSV6 GRSF1-208ENST00000545193 2682 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
TSEN34Q9BSV6 HMGXB3-202ENST00000503427 5275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
TSEN34Q9BSV6 ZNF134-201ENST00000396161 4914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TSEN34Q9BSV6 CDKN1A-203ENST00000405375 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TSEN34Q9BSV6 NOX5-209ENST00000530406 2289 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TSEN34Q9BSV6 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TSEN34Q9BSV6 SREBF1-201ENST00000261646 4178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TSEN34Q9BSV6 ING1-203ENST00000375774 2870 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TSEN34Q9BSV6 AL009181.1-201ENST00000418471 1085 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
TSEN34Q9BSV6 AC092265.1-201ENST00000422638 498 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
TSEN34Q9BSV6 NUBP1-202ENST00000433392 1185 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TSEN34Q9BSV6 ZAP70-202ENST00000451498 1085 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TSEN34Q9BSV6 AC027237.1-201ENST00000560942 655 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
TSEN34Q9BSV6 AC141586.1-203ENST00000567242 366 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
TSEN34Q9BSV6 RN7SL470P-201ENST00000583069 259 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
TSEN34Q9BSV6 AC008687.1-201ENST00000591656 786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
TSEN34Q9BSV6 FBXO5-202ENST00000367241 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TSEN34Q9BSV6 CPEB2-209ENST00000538197 6878 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
TSEN34Q9BSV6 ADORA1-204ENST00000367236 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TSEN34Q9BSV6 AL121757.1-201ENST00000430097 1836 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TSEN34Q9BSV6 SLC25A45-214ENST00000534028 2432 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TSEN34Q9BSV6 MYB-209ENST00000442647 3304 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TSEN34Q9BSV6 FOLH1-202ENST00000340334 2697 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TSEN34Q9BSV6 RASGEF1B-202ENST00000335927 1756 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TSEN34Q9BSV6 HHIP-202ENST00000434550 1770 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TSEN34Q9BSV6 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TSEN34Q9BSV6 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
TSEN34Q9BSV6 AP2A2-201ENST00000332231 4656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
TSEN34Q9BSV6 RASSF6-202ENST00000335049 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
TSEN34Q9BSV6 PCNA-202ENST00000379160 1359 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
TSEN34Q9BSV6 CEP128-201ENST00000216517 1606 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
TSEN34Q9BSV6 PSMC3-213ENST00000619920 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
TSEN34Q9BSV6 CBWD5-204ENST00000377392 2863 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
TSEN34Q9BSV6 CCDC169-SOHLH2-201ENST00000511166 2051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
TSEN34Q9BSV6 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
TSEN34Q9BSV6 AURKB-201ENST00000316199 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
TSEN34Q9BSV6 PDCD5-202ENST00000379316 154 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
TSEN34Q9BSV6 DCAF7-201ENST00000415273 1220 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
TSEN34Q9BSV6 TNNT2-214ENST00000458432 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
TSEN34Q9BSV6 ALG1L13P-202ENST00000519320 584 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
TSEN34Q9BSV6 TCL1A-205ENST00000555202 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
TSEN34Q9BSV6 AC068397.2-201ENST00000558742 341 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
TSEN34Q9BSV6 AC012379.2-201ENST00000560237 765 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
TSEN34Q9BSV6 MAFTRR-203ENST00000567993 685 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
TSEN34Q9BSV6 TMEM220-AS1-207ENST00000584714 541 ntTSL 4 BASIC16.27■□□□□ 0.2
TSEN34Q9BSV6 PDCD5-208ENST00000592786 468 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
TSEN34Q9BSV6 AC011500.3-201ENST00000594676 647 ntTSL 4 BASIC16.27■□□□□ 0.2
TSEN34Q9BSV6 AL022334.2-201ENST00000610000 484 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
TSEN34Q9BSV6 DEPDC7-201ENST00000241051 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
TSEN34Q9BSV6 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
TSEN34Q9BSV6 SPIN3-224ENST00000639583 2245 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
TSEN34Q9BSV6 CCDC90B-213ENST00000529611 1986 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
TSEN34Q9BSV6 GLG1-201ENST00000205061 8261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
TSEN34Q9BSV6 ARL6IP1-201ENST00000304414 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
TSEN34Q9BSV6 SEMA4F-201ENST00000339773 2177 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
TSEN34Q9BSV6 SLIT1-204ENST00000371070 4564 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
TSEN34Q9BSV6 ACTL6A-202ENST00000429709 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
TSEN34Q9BSV6 SLC44A3-209ENST00000532427 1912 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
TSEN34Q9BSV6 RUBCNL-212ENST00000631139 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
TSEN34Q9BSV6 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
TSEN34Q9BSV6 ADD1-201ENST00000264758 4045 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
TSEN34Q9BSV6 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
TSEN34Q9BSV6 MPPE1-211ENST00000588072 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
TSEN34Q9BSV6 EDN3-205ENST00000395654 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
TSEN34Q9BSV6 RSPO1-202ENST00000401068 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
TSEN34Q9BSV6 KCTD11-201ENST00000333751 2783 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TSEN34Q9BSV6 CCNH-201ENST00000256897 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TSEN34Q9BSV6 ELP5-203ENST00000396627 1389 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TSEN34Q9BSV6 KCNQ2-236ENST00000637193 2983 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TSEN34Q9BSV6 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TSEN34Q9BSV6 AKAP12-201ENST00000253332 6597 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TSEN34Q9BSV6 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TSEN34Q9BSV6 MROH4P-201ENST00000431302 1578 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
TSEN34Q9BSV6 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TSEN34Q9BSV6 ARHGEF25-202ENST00000333972 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TSEN34Q9BSV6 MSTO1-202ENST00000368341 2245 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TSEN34Q9BSV6 NDRG1-202ENST00000414097 3755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TSEN34Q9BSV6 LRRC57-204ENST00000563454 2407 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TSEN34Q9BSV6 CSGALNACT1-211ENST00000522854 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TSEN34Q9BSV6 TMC3-AS1-203ENST00000559781 2195 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TSEN34Q9BSV6 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TSEN34Q9BSV6 C8G-201ENST00000224181 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TSEN34Q9BSV6 CALR3-201ENST00000269881 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TSEN34Q9BSV6 FERD3L-201ENST00000275461 640 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TSEN34Q9BSV6 AMN1-201ENST00000281471 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TSEN34Q9BSV6 DEFB123-201ENST00000376309 467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TSEN34Q9BSV6 ADARB2-AS1-201ENST00000381301 625 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TSEN34Q9BSV6 TRBJ2-6-201ENST00000390418 53 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TSEN34Q9BSV6 SAPCD1-208ENST00000415669 916 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TSEN34Q9BSV6 AC096649.1-201ENST00000449168 497 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TSEN34Q9BSV6 AC233724.6-201ENST00000503184 1088 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TSEN34Q9BSV6 RPS25-202ENST00000527673 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TSEN34Q9BSV6 AP002387.1-201ENST00000529369 680 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TSEN34Q9BSV6 AC020659.1-202ENST00000564432 531 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TSEN34Q9BSV6 TMEM98-205ENST00000578289 806 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TSEN34Q9BSV6 PGPEP1-206ENST00000597431 545 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.6 ms