Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSB4

ATG101, Autophagy-related protein 101, humanhuman

Predictions only

Length 218 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG101Q9BSB4 SELPLG-203ENST00000550948 2256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
ATG101Q9BSB4 TAF8-203ENST00000372982 1805 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
ATG101Q9BSB4 ZPBP2-202ENST00000377940 2177 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
ATG101Q9BSB4 TUBA4B-203ENST00000490341 1380 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
ATG101Q9BSB4 GOPC-202ENST00000368498 4450 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
ATG101Q9BSB4 LIMS2-217ENST00000545738 1730 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
ATG101Q9BSB4 TNS2-219ENST00000552570 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
ATG101Q9BSB4 TPM3-208ENST00000341485 2063 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
ATG101Q9BSB4 PRKCH-201ENST00000332981 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
ATG101Q9BSB4 LGALS8-203ENST00000341872 2437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
ATG101Q9BSB4 TSPEAR-AS2-202ENST00000354333 2422 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
ATG101Q9BSB4 MBD6-201ENST00000355673 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
ATG101Q9BSB4 HLCS-201ENST00000336648 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
ATG101Q9BSB4 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
ATG101Q9BSB4 MRPL55-208ENST00000366734 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
ATG101Q9BSB4 MRPL55-217ENST00000366746 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
ATG101Q9BSB4 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
ATG101Q9BSB4 EXOSC8-202ENST00000389704 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
ATG101Q9BSB4 AC002056.1-201ENST00000395613 760 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
ATG101Q9BSB4 PP14571-201ENST00000404327 934 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
ATG101Q9BSB4 COA5-202ENST00000409997 557 ntTSL 4 BASIC11.84□□□□□ -0.51
ATG101Q9BSB4 AC211486.1-202ENST00000416371 468 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
ATG101Q9BSB4 AC013270.1-201ENST00000425578 440 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
ATG101Q9BSB4 ZNF655-216ENST00000449244 544 ntTSL 4 BASIC11.84□□□□□ -0.51
ATG101Q9BSB4 PARD6G-203ENST00000470488 596 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
ATG101Q9BSB4 GSTK1-207ENST00000479303 1185 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
ATG101Q9BSB4 AC211476.1-201ENST00000503899 468 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
ATG101Q9BSB4 AC008127.1-201ENST00000548424 499 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
ATG101Q9BSB4 AC092718.3-202ENST00000564536 1032 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
ATG101Q9BSB4 DCTPP1-203ENST00000567983 801 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
ATG101Q9BSB4 AC005829.1-201ENST00000570002 483 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
ATG101Q9BSB4 AC024592.3-202ENST00000586349 506 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
ATG101Q9BSB4 UGGT2-213ENST00000638479 1010 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
ATG101Q9BSB4 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
ATG101Q9BSB4 COPS3-201ENST00000268717 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
ATG101Q9BSB4 ZNF683-201ENST00000349618 1610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
ATG101Q9BSB4 AMT-224ENST00000635808 1610 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
ATG101Q9BSB4 SLC22A16-202ENST00000368919 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
ATG101Q9BSB4 ACTN1-204ENST00000438964 3043 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
ATG101Q9BSB4 USP2-201ENST00000260187 3732 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
ATG101Q9BSB4 RET-205ENST00000615310 4337 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
ATG101Q9BSB4 LRRC41-201ENST00000343304 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
ATG101Q9BSB4 CMPK1-203ENST00000371873 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
ATG101Q9BSB4 SPTBN2-204ENST00000529997 8085 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
ATG101Q9BSB4 LRP8-203ENST00000354412 2553 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
ATG101Q9BSB4 MPL-202ENST00000413998 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
ATG101Q9BSB4 SRPRA-206ENST00000532259 2453 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
ATG101Q9BSB4 SPATA16-201ENST00000351008 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
ATG101Q9BSB4 AC022497.1-201ENST00000624916 3691 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
ATG101Q9BSB4 FOXP1-202ENST00000318789 7114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
ATG101Q9BSB4 MSRB3-202ENST00000355192 4289 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
ATG101Q9BSB4 FOXP1-222ENST00000615603 7140 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
ATG101Q9BSB4 AC025580.3-201ENST00000617932 1424 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
ATG101Q9BSB4 MTHFR-210ENST00000641407 2387 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
ATG101Q9BSB4 MATN1-AS1-201ENST00000414532 3925 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
ATG101Q9BSB4 RIC1-204ENST00000418622 6658 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
ATG101Q9BSB4 USP9X-202ENST00000378308 8371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
ATG101Q9BSB4 NDUFC2-201ENST00000281031 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
ATG101Q9BSB4 ZFP64-203ENST00000361387 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
ATG101Q9BSB4 DPEP1-201ENST00000261615 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
ATG101Q9BSB4 SCRN1-205ENST00000425819 1552 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
ATG101Q9BSB4 AL607033.1-201ENST00000623900 1599 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
ATG101Q9BSB4 ELP4-219ENST00000639878 1583 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
ATG101Q9BSB4 ALDOA-228ENST00000627059 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
ATG101Q9BSB4 FER1L4-204ENST00000430275 3281 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
ATG101Q9BSB4 CARMIL2-202ENST00000545661 4119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
ATG101Q9BSB4 P2RX3-201ENST00000263314 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
ATG101Q9BSB4 NEAT1-201ENST00000499732 1811 ntTSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.51
ATG101Q9BSB4 CIAPIN1-207ENST00000565961 1814 ntTSL 3 BASIC11.83□□□□□ -0.51
ATG101Q9BSB4 PKM-220ENST00000568459 1806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
ATG101Q9BSB4 ITPR3-202ENST00000605930 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
ATG101Q9BSB4 MPHOSPH10-205ENST00000498451 2068 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
ATG101Q9BSB4 ZNF641-201ENST00000301042 4544 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.51
ATG101Q9BSB4 ADGRA1-201ENST00000392606 3438 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
ATG101Q9BSB4 GRN-201ENST00000053867 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
ATG101Q9BSB4 PTPRS-204ENST00000587303 6353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
ATG101Q9BSB4 ARHGAP31-201ENST00000264245 9317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
ATG101Q9BSB4 FBP1-201ENST00000375326 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
ATG101Q9BSB4 TSN-212ENST00000536142 3328 ntTSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
ATG101Q9BSB4 SP6-201ENST00000342234 3800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
ATG101Q9BSB4 GFOD2-203ENST00000602377 1991 ntTSL 4 BASIC11.83□□□□□ -0.52
ATG101Q9BSB4 DAXX-213ENST00000620164 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
ATG101Q9BSB4 FUCA2-201ENST00000002165 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
ATG101Q9BSB4 TXNDC12-201ENST00000371626 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
ATG101Q9BSB4 MKS1-202ENST00000393119 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
ATG101Q9BSB4 TATDN3-214ENST00000532324 1381 ntTSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
ATG101Q9BSB4 TMEM130-201ENST00000339375 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
ATG101Q9BSB4 MAP2K3-203ENST00000361818 2034 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
ATG101Q9BSB4 SLC4A2-201ENST00000392826 3947 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
ATG101Q9BSB4 AP001627.1-201ENST00000437426 1754 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
ATG101Q9BSB4 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
ATG101Q9BSB4 FOXO1B-201ENST00000504678 1527 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
ATG101Q9BSB4 PENK-201ENST00000314922 1199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
ATG101Q9BSB4 CRADD-201ENST00000332896 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
ATG101Q9BSB4 FAM220BP-201ENST00000377689 816 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
ATG101Q9BSB4 AMACR-202ENST00000382068 862 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
ATG101Q9BSB4 GUK1-210ENST00000391865 990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
ATG101Q9BSB4 RPSAP43-201ENST00000402237 625 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
ATG101Q9BSB4 ZGLP1-201ENST00000403352 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
ATG101Q9BSB4 MRPS12-203ENST00000407800 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.1 ms