Protein–RNA interactions for Protein: Q96TA2

YME1L1, ATP-dependent zinc metalloprotease YME1L1, humanhuman

Predictions only

Length 773 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
YME1L1Q96TA2 LRRC57-204ENST00000563454 2407 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
YME1L1Q96TA2 PRICKLE1-211ENST00000639566 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
YME1L1Q96TA2 LRRFIP2-205ENST00000421276 2522 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
YME1L1Q96TA2 GFAP-225ENST00000638281 2099 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
YME1L1Q96TA2 SPG21-203ENST00000433215 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
YME1L1Q96TA2 MAP3K8-201ENST00000263056 3096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
YME1L1Q96TA2 INTS11-247ENST00000540437 2629 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
YME1L1Q96TA2 CARD14-202ENST00000570421 2607 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
YME1L1Q96TA2 PPIE-202ENST00000356511 1079 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
YME1L1Q96TA2 IGHV3-49-201ENST00000390625 439 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
YME1L1Q96TA2 AL512430.1-201ENST00000392575 860 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
YME1L1Q96TA2 AL391119.1-201ENST00000416563 271 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
YME1L1Q96TA2 AL157407.1-201ENST00000435784 904 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
YME1L1Q96TA2 AC068134.1-201ENST00000441266 481 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
YME1L1Q96TA2 AL035414.1-201ENST00000451327 857 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
YME1L1Q96TA2 GLIS3-AS1-201ENST00000451340 734 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
YME1L1Q96TA2 ALG3P1-201ENST00000508806 1114 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
YME1L1Q96TA2 OSMR-AS1-202ENST00000512519 837 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
YME1L1Q96TA2 LINC02417-201ENST00000542449 515 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
YME1L1Q96TA2 FOS-204ENST00000554617 796 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
YME1L1Q96TA2 RPL19-207ENST00000582193 792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
YME1L1Q96TA2 SNRPD2-206ENST00000588301 702 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
YME1L1Q96TA2 AC111170.1-201ENST00000591110 1132 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
YME1L1Q96TA2 AC007881.3-201ENST00000608897 607 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
YME1L1Q96TA2 HIST1H3C-201ENST00000612966 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
YME1L1Q96TA2 LINC00391-201ENST00000433569 1844 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
YME1L1Q96TA2 PEPD-201ENST00000244137 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
YME1L1Q96TA2 AC005329.1-201ENST00000501448 3571 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
YME1L1Q96TA2 FGF4-201ENST00000168712 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
YME1L1Q96TA2 UCN2-201ENST00000273610 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
YME1L1Q96TA2 ZDHHC4-204ENST00000396709 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
YME1L1Q96TA2 AL024498.2-201ENST00000480294 1589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
YME1L1Q96TA2 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
YME1L1Q96TA2 ACSL1-202ENST00000454703 3636 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
YME1L1Q96TA2 FBXL19-204ENST00000471231 3641 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
YME1L1Q96TA2 EDN3-205ENST00000395654 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
YME1L1Q96TA2 TMEM258-207ENST00000543510 1692 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
YME1L1Q96TA2 FH-201ENST00000366560 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
YME1L1Q96TA2 ADCYAP1R1-204ENST00000409489 1761 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
YME1L1Q96TA2 SALL4P5-201ENST00000419001 1760 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
YME1L1Q96TA2 ZFP36-203ENST00000597629 1786 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
YME1L1Q96TA2 ARHGEF28-211ENST00000512883 2936 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
YME1L1Q96TA2 BCL2L11-219ENST00000619294 5132 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
YME1L1Q96TA2 MDFIC-202ENST00000393486 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
YME1L1Q96TA2 GNB2-202ENST00000393924 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
YME1L1Q96TA2 BCL11A-201ENST00000335712 5942 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
YME1L1Q96TA2 SIN3B-206ENST00000595541 2767 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
YME1L1Q96TA2 ING1-203ENST00000375774 2870 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
YME1L1Q96TA2 PAX6-203ENST00000379109 3182 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
YME1L1Q96TA2 SLC6A9-203ENST00000372306 1926 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
YME1L1Q96TA2 GTF2IRD1-205ENST00000476977 5868 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
YME1L1Q96TA2 API5-202ENST00000420461 2009 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
YME1L1Q96TA2 BID-213ENST00000615414 2236 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
YME1L1Q96TA2 NKIRAS1-201ENST00000388759 2335 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
YME1L1Q96TA2 COPS7B-224ENST00000620578 2500 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
YME1L1Q96TA2 PPP1R21-202ENST00000294952 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
YME1L1Q96TA2 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
YME1L1Q96TA2 AL589843.1-201ENST00000423924 425 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
YME1L1Q96TA2 AL606489.1-201ENST00000443515 486 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
YME1L1Q96TA2 LINC00461-207ENST00000506978 564 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
YME1L1Q96TA2 LINC02440-201ENST00000545276 680 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
YME1L1Q96TA2 TGIF1-218ENST00000551402 1089 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
YME1L1Q96TA2 FKBP11-212ENST00000552878 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
YME1L1Q96TA2 FAM104A-206ENST00000583024 417 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
YME1L1Q96TA2 AC008133.1-201ENST00000584688 557 ntTSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
YME1L1Q96TA2 PARD6G-AS1-205ENST00000589574 647 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
YME1L1Q96TA2 AC138894.2-201ENST00000602838 371 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
YME1L1Q96TA2 CR589904.1-202ENST00000611154 660 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
YME1L1Q96TA2 ITGA9-AS1-213ENST00000614028 913 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
YME1L1Q96TA2 CYP4B1-215ENST00000640628 969 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
YME1L1Q96TA2 LILRP1-201ENST00000444199 1370 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
YME1L1Q96TA2 DEF8-219ENST00000567874 1554 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
YME1L1Q96TA2 C21orf33-201ENST00000291577 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
YME1L1Q96TA2 LRP10-203ENST00000546834 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
YME1L1Q96TA2 PDE9A-208ENST00000398225 1963 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
YME1L1Q96TA2 TMC3-AS1-203ENST00000559781 2195 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
YME1L1Q96TA2 AP000704.1-201ENST00000637940 2182 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
YME1L1Q96TA2 STK17A-201ENST00000319357 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
YME1L1Q96TA2 RB1CC1-201ENST00000025008 6635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
YME1L1Q96TA2 SHTN1-201ENST00000260777 5308 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
YME1L1Q96TA2 XRCC3-209ENST00000554913 2539 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
YME1L1Q96TA2 UPB1-202ENST00000382760 1928 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
YME1L1Q96TA2 TUBB4B-201ENST00000340384 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
YME1L1Q96TA2 UBE3C-202ENST00000389103 1626 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
YME1L1Q96TA2 INHBA-203ENST00000442711 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
YME1L1Q96TA2 SERF2-201ENST00000249786 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
YME1L1Q96TA2 CYP51A1P3-201ENST00000400072 1428 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
YME1L1Q96TA2 CACFD1-202ENST00000316948 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
YME1L1Q96TA2 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
YME1L1Q96TA2 TMPO-203ENST00000343315 2465 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
YME1L1Q96TA2 LENG8-208ENST00000610347 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
YME1L1Q96TA2 CLIC5-208ENST00000544153 2051 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
YME1L1Q96TA2 ZNF425-201ENST00000378061 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
YME1L1Q96TA2 CASQ1-201ENST00000368078 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
YME1L1Q96TA2 AC008741.2-201ENST00000612792 3115 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
YME1L1Q96TA2 KAT7-210ENST00000509773 1774 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
YME1L1Q96TA2 AC015909.3-201ENST00000572855 1794 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
YME1L1Q96TA2 PTK6-202ENST00000542869 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
YME1L1Q96TA2 ZNF333-209ENST00000601134 1392 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
YME1L1Q96TA2 PSMB10-201ENST00000358514 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.2 ms