Protein–RNA interactions for Protein: Q96DB2

HDAC11, Histone deacetylase 11, humanhuman

Predictions only

Length 347 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC11Q96DB2 LINC00473-201ENST00000444465 798 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HDAC11Q96DB2 RAD51D-205ENST00000460118 1064 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HDAC11Q96DB2 RN7SL752P-201ENST00000463779 287 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
HDAC11Q96DB2 RN7SL692P-201ENST00000464677 288 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
HDAC11Q96DB2 POLE2-203ENST00000553805 496 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HDAC11Q96DB2 AC105339.1-202ENST00000559535 1283 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HDAC11Q96DB2 AC011489.1-202ENST00000586556 618 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HDAC11Q96DB2 SYTL3-205ENST00000611299 2896 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HDAC11Q96DB2 ARHGEF3-212ENST00000495373 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HDAC11Q96DB2 SEC24D-202ENST00000419654 2786 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HDAC11Q96DB2 GPANK1-203ENST00000375896 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HDAC11Q96DB2 ITFG1-201ENST00000320640 3400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HDAC11Q96DB2 MAP7D1-203ENST00000373150 3238 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HDAC11Q96DB2 FCHO1-206ENST00000594202 3214 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HDAC11Q96DB2 PML-201ENST00000268058 4508 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HDAC11Q96DB2 KRT20-201ENST00000167588 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HDAC11Q96DB2 ADD1-204ENST00000398123 2361 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HDAC11Q96DB2 CAMK2B-206ENST00000353625 1624 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HDAC11Q96DB2 SLC29A1-204ENST00000371731 2258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HDAC11Q96DB2 MOCS1-201ENST00000340692 2747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HDAC11Q96DB2 SNX11-202ENST00000393405 2733 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HDAC11Q96DB2 SPATA20-201ENST00000006658 2719 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HDAC11Q96DB2 PPIL2-212ENST00000626352 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HDAC11Q96DB2 MSI2-202ENST00000322684 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HDAC11Q96DB2 KAT5-216ENST00000534650 1875 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HDAC11Q96DB2 FAM118B-210ENST00000627851 1862 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HDAC11Q96DB2 SNRNP27-202ENST00000409116 1339 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HDAC11Q96DB2 MOCS3-201ENST00000244051 5106 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HDAC11Q96DB2 LYSMD4-204ENST00000409796 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HDAC11Q96DB2 PEX26-205ENST00000610387 3924 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HDAC11Q96DB2 PPARGC1B-203ENST00000394320 4803 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HDAC11Q96DB2 EDIL3-201ENST00000296591 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HDAC11Q96DB2 FAM103A1-201ENST00000304191 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HDAC11Q96DB2 ZC3H14-204ENST00000336693 2007 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HDAC11Q96DB2 TMEM139-201ENST00000359333 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HDAC11Q96DB2 NUP50-201ENST00000347635 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HDAC11Q96DB2 ALDOA-228ENST00000627059 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HDAC11Q96DB2 SETD1A-201ENST00000262519 6451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HDAC11Q96DB2 ZNRD1-201ENST00000332435 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HDAC11Q96DB2 LINC01116-202ENST00000339037 838 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HDAC11Q96DB2 CALY-203ENST00000368558 825 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HDAC11Q96DB2 IFI27L1-201ENST00000393115 674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HDAC11Q96DB2 TMEM247-204ENST00000434431 680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HDAC11Q96DB2 AC007389.4-201ENST00000454674 793 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
HDAC11Q96DB2 LHX6-205ENST00000464484 666 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HDAC11Q96DB2 AC139713.2-206ENST00000499587 566 ntTSL 4 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HDAC11Q96DB2 SLC8B1-206ENST00000549069 1058 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HDAC11Q96DB2 BX927359.1-201ENST00000556073 543 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HDAC11Q96DB2 TMEM205-208ENST00000587948 688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HDAC11Q96DB2 TMEM205-211ENST00000589555 788 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HDAC11Q96DB2 TUBB6-213ENST00000591909 1017 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HDAC11Q96DB2 AL157392.3-207ENST00000601758 744 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HDAC11Q96DB2 INHBA-203ENST00000442711 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HDAC11Q96DB2 AL589740.1-203ENST00000433637 1984 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HDAC11Q96DB2 MPI-203ENST00000535694 1523 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HDAC11Q96DB2 LATS1-207ENST00000543571 7517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HDAC11Q96DB2 TCOF1-201ENST00000323668 4832 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HDAC11Q96DB2 FKBP5-201ENST00000357266 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HDAC11Q96DB2 SLC25A2-201ENST00000239451 1417 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HDAC11Q96DB2 ZC3HAV1-203ENST00000464606 4776 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HDAC11Q96DB2 VSIR-201ENST00000394957 4689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HDAC11Q96DB2 SLC35G5-201ENST00000382435 1321 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HDAC11Q96DB2 AURKC-203ENST00000448930 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HDAC11Q96DB2 HEATR3-201ENST00000299192 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HDAC11Q96DB2 CAVIN1-201ENST00000357037 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HDAC11Q96DB2 SLC12A5-211ENST00000616933 6166 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HDAC11Q96DB2 FBXO5-202ENST00000367241 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HDAC11Q96DB2 SLC35C2-204ENST00000372230 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HDAC11Q96DB2 CCDC183-AS1-201ENST00000414656 2386 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HDAC11Q96DB2 PWP2-201ENST00000291576 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HDAC11Q96DB2 ZNF324-201ENST00000196482 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HDAC11Q96DB2 CTBP1-AS2-206ENST00000581398 5652 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
HDAC11Q96DB2 CCT4-201ENST00000394440 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HDAC11Q96DB2 ZNF557-201ENST00000252840 2268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HDAC11Q96DB2 UBXN1-201ENST00000294119 1291 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HDAC11Q96DB2 UBXN1-202ENST00000301935 1153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HDAC11Q96DB2 IFT20-202ENST00000357896 974 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HDAC11Q96DB2 MGST3-203ENST00000367885 680 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HDAC11Q96DB2 CPLX2-202ENST00000393745 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HDAC11Q96DB2 AL035633.1-201ENST00000406139 838 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
HDAC11Q96DB2 SERF2-209ENST00000409646 559 ntTSL 4 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HDAC11Q96DB2 TLE1P1-201ENST00000422965 589 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
HDAC11Q96DB2 AL157832.1-201ENST00000428273 495 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HDAC11Q96DB2 AC099754.1-201ENST00000435884 454 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HDAC11Q96DB2 SNHG11-209ENST00000440918 556 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HDAC11Q96DB2 SNHG11-212ENST00000449351 954 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HDAC11Q96DB2 GNG4-205ENST00000484517 684 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HDAC11Q96DB2 S100A6-205ENST00000496817 673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HDAC11Q96DB2 IL32-222ENST00000533097 814 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HDAC11Q96DB2 AL596325.1-201ENST00000563991 1082 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
HDAC11Q96DB2 AC015936.2-201ENST00000593177 259 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
HDAC11Q96DB2 AC145423.3-201ENST00000615987 467 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
HDAC11Q96DB2 AL358472.5-202ENST00000641448 1267 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
HDAC11Q96DB2 IL32-201ENST00000008180 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HDAC11Q96DB2 RABIF-201ENST00000367262 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HDAC11Q96DB2 ABHD16A-202ENST00000440843 1906 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HDAC11Q96DB2 MFRP-201ENST00000360167 1663 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HDAC11Q96DB2 GTF2I-212ENST00000573035 4548 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HDAC11Q96DB2 FOXP1-202ENST00000318789 7114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HDAC11Q96DB2 FOXP1-222ENST00000615603 7140 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.9 ms