Protein–RNA interactions for Protein: Q92954

PRG4, Proteoglycan 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRG4Q92954 AP005899.1-201ENST00000579467 544 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PRG4Q92954 KCTD18-202ENST00000409157 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PRG4Q92954 SPG11-215ENST00000559193 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PRG4Q92954 COL26A1-203ENST00000613501 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PRG4Q92954 TARBP2-202ENST00000394357 1402 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PRG4Q92954 HHEX-202ENST00000472590 1605 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PRG4Q92954 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PRG4Q92954 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PRG4Q92954 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PRG4Q92954 WASH7P-201ENST00000488147 1351 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
PRG4Q92954 CIT-219ENST00000612548 1799 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PRG4Q92954 LINC00528-201ENST00000600723 2160 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
PRG4Q92954 ISLR-201ENST00000249842 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PRG4Q92954 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PRG4Q92954 C12orf65-204ENST00000429587 1326 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PRG4Q92954 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PRG4Q92954 MAGEA2B-202ENST00000370293 1714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PRG4Q92954 BTNL8-206ENST00000508408 1717 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PRG4Q92954 DRC3-202ENST00000399182 1923 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PRG4Q92954 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PRG4Q92954 CNKSR1-202ENST00000374253 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PRG4Q92954 AC082651.4-201ENST00000483023 1852 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PRG4Q92954 SERF1B-204ENST00000506542 1666 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PRG4Q92954 IFNLR1-204ENST00000374419 953 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PRG4Q92954 OR10N1P-201ENST00000392758 869 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
PRG4Q92954 AC093609.1-201ENST00000434020 952 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PRG4Q92954 AL157392.3-204ENST00000440878 397 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PRG4Q92954 RORA-AS1-201ENST00000501579 761 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PRG4Q92954 AC010285.2-201ENST00000510240 569 ntTSL 4 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PRG4Q92954 SEPHS2P1-201ENST00000511618 1162 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
PRG4Q92954 AC092612.1-201ENST00000514501 998 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
PRG4Q92954 RBM4-211ENST00000530235 1011 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PRG4Q92954 EHF-208ENST00000530286 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PRG4Q92954 NR4A1-209ENST00000548232 1101 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PRG4Q92954 AC023825.2-201ENST00000562970 672 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PRG4Q92954 AC090510.3-201ENST00000615831 821 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
PRG4Q92954 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PRG4Q92954 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PRG4Q92954 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PRG4Q92954 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PRG4Q92954 ELOF1-203ENST00000586683 2154 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PRG4Q92954 TMEM9-203ENST00000367333 1564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PRG4Q92954 AADAT-206ENST00000509167 2113 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PRG4Q92954 C11orf49-204ENST00000395460 1916 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PRG4Q92954 ACP2-212ENST00000533929 1366 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PRG4Q92954 PIGQ-201ENST00000026218 2846 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PRG4Q92954 BANP-204ENST00000393208 2283 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PRG4Q92954 LONRF3-201ENST00000304778 2989 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PRG4Q92954 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PRG4Q92954 AC006504.5-208ENST00000588784 2401 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
PRG4Q92954 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PRG4Q92954 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PRG4Q92954 THUMPD3-210ENST00000515662 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PRG4Q92954 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PRG4Q92954 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PRG4Q92954 TREM2-202ENST00000373113 1044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PRG4Q92954 HIST1H4B-201ENST00000377745 438 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PRG4Q92954 TEX33-201ENST00000381821 978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PRG4Q92954 LINC01983-201ENST00000413586 574 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PRG4Q92954 OR52M2P-201ENST00000414298 959 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
PRG4Q92954 PGAM1P11-201ENST00000416729 680 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
PRG4Q92954 AC068057.1-201ENST00000453322 709 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PRG4Q92954 BCL2L12P1-201ENST00000508390 733 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
PRG4Q92954 AL021707.6-201ENST00000609212 491 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
PRG4Q92954 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PRG4Q92954 SMG1P3-206ENST00000522841 2774 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PRG4Q92954 MKRN2-202ENST00000411987 1436 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PRG4Q92954 RTP1-201ENST00000312295 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PRG4Q92954 BID-213ENST00000615414 2236 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PRG4Q92954 SUOX-204ENST00000394115 2394 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PRG4Q92954 LIMK2-204ENST00000406516 2657 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PRG4Q92954 FKBP4P8-201ENST00000610931 1369 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
PRG4Q92954 CHEK2-204ENST00000382580 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PRG4Q92954 PMS1-212ENST00000432292 3234 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PRG4Q92954 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PRG4Q92954 ODCP-201ENST00000459650 1639 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
PRG4Q92954 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PRG4Q92954 SLC9A5-201ENST00000299798 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PRG4Q92954 FOLH1-201ENST00000256999 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PRG4Q92954 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PRG4Q92954 PRAME-206ENST00000406503 740 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PRG4Q92954 RN7SL788P-201ENST00000460504 316 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
PRG4Q92954 AL132994.1-201ENST00000554098 400 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
PRG4Q92954 NRSN2-210ENST00000621012 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PRG4Q92954 CR392039.1-201ENST00000623217 204 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
PRG4Q92954 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PRG4Q92954 ABI2-215ENST00000430418 1676 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PRG4Q92954 CCDC144A-202ENST00000340621 2214 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PRG4Q92954 TTC39A-216ENST00000530004 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PRG4Q92954 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PRG4Q92954 CLPTM1-202ENST00000541297 2732 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PRG4Q92954 STRA6-205ENST00000432245 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PRG4Q92954 AC010255.3-203ENST00000509403 1727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PRG4Q92954 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PRG4Q92954 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PRG4Q92954 HIST1H2APS2-201ENST00000454426 370 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
PRG4Q92954 AC025186.1-201ENST00000478174 870 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
PRG4Q92954 EIF5A2-205ENST00000487522 565 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PRG4Q92954 RN7SL375P-201ENST00000492442 298 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
PRG4Q92954 FBXO36P1-201ENST00000579006 471 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34 ms