Protein–RNA interactions for Protein: Q92618

ZNF516, Zinc finger protein 516, humanhuman

Predictions only

Length 1,163 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF516Q92618 NAA60-203ENST00000414063 2619 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ZNF516Q92618 HNRNPU-205ENST00000444376 6827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ZNF516Q92618 C12orf76-209ENST00000615315 1580 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
ZNF516Q92618 CHEK2-204ENST00000382580 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ZNF516Q92618 PALLD-215ENST00000512127 2958 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ZNF516Q92618 FAM135A-205ENST00000418814 6415 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
ZNF516Q92618 TEX264-205ENST00000416589 1313 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ZNF516Q92618 PLEKHG3-202ENST00000394691 4397 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
ZNF516Q92618 EIF4G1-202ENST00000346169 5516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ZNF516Q92618 BMP3-201ENST00000282701 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ZNF516Q92618 CRB2-201ENST00000359999 3659 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ZNF516Q92618 LRRC20-204ENST00000373224 3095 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ZNF516Q92618 ZNF385A-205ENST00000546970 2494 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ZNF516Q92618 GALNT16-202ENST00000448469 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ZNF516Q92618 AC025171.1-202ENST00000499871 2271 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ZNF516Q92618 PRSS8-201ENST00000317508 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ZNF516Q92618 UBA6-202ENST00000420827 1664 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ZNF516Q92618 NEU2-201ENST00000233840 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ZNF516Q92618 BST2-201ENST00000252593 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ZNF516Q92618 EIF3G-201ENST00000253108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ZNF516Q92618 NRSN2-201ENST00000382285 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ZNF516Q92618 ROPN1-202ENST00000405845 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ZNF516Q92618 TISP43-201ENST00000409793 538 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
ZNF516Q92618 AL645941.1-201ENST00000415875 338 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
ZNF516Q92618 AL450998.2-201ENST00000418525 639 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
ZNF516Q92618 NREP-204ENST00000419114 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ZNF516Q92618 TREML1-202ENST00000426005 981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ZNF516Q92618 GEMIN4-202ENST00000437269 1182 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ZNF516Q92618 YBX1P6-201ENST00000442962 1002 ntBASIC16■□□□□ 0.15
ZNF516Q92618 IQCF3-203ENST00000444293 450 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ZNF516Q92618 AL355994.2-201ENST00000447882 704 ntBASIC16■□□□□ 0.15
ZNF516Q92618 C11orf98-201ENST00000524958 654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ZNF516Q92618 AP000911.1-202ENST00000532706 543 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
ZNF516Q92618 AP003385.5-201ENST00000533876 555 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
ZNF516Q92618 RNF41-210ENST00000552244 716 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
ZNF516Q92618 AP002360.2-202ENST00000572035 738 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
ZNF516Q92618 ACAP1-208ENST00000574499 412 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ZNF516Q92618 CYGB-203ENST00000589145 788 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
ZNF516Q92618 AL121944.1-201ENST00000605945 686 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ZNF516Q92618 MLLT10-216ENST00000621220 381 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ZNF516Q92618 CARD11-203ENST00000396946 4366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ZNF516Q92618 OPN4-202ENST00000372071 2401 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ZNF516Q92618 TTC29-208ENST00000513335 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ZNF516Q92618 GPRC5C-202ENST00000392627 2988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ZNF516Q92618 MFRP-205ENST00000619721 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ZNF516Q92618 PEF1-201ENST00000373703 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ZNF516Q92618 MAGEB2-201ENST00000378988 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ZNF516Q92618 AMT-204ENST00000427987 1646 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
ZNF516Q92618 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ZNF516Q92618 MRPS7-201ENST00000245539 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ZNF516Q92618 PTOV1-214ENST00000600603 1443 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ZNF516Q92618 LINC01667-202ENST00000623919 1422 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
ZNF516Q92618 CES1-203ENST00000422046 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ZNF516Q92618 CNTLN-202ENST00000380647 5576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ZNF516Q92618 ADAD1-201ENST00000296513 1961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ZNF516Q92618 NAA60-229ENST00000575076 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ZNF516Q92618 DDX50-206ENST00000610822 2510 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
ZNF516Q92618 CIT-219ENST00000612548 1799 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ZNF516Q92618 AL590440.2-201ENST00000641973 1595 ntBASIC16■□□□□ 0.15
ZNF516Q92618 ATL3-203ENST00000538786 1920 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ZNF516Q92618 MAPK13-203ENST00000373766 6196 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ZNF516Q92618 NPAS2-201ENST00000335681 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ZNF516Q92618 PCDHGB1-202ENST00000611598 2592 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ZNF516Q92618 ZNF367-201ENST00000375256 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ZNF516Q92618 POMP-201ENST00000380842 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ZNF516Q92618 LIMS2-205ENST00000409455 2500 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ZNF516Q92618 PRNP-203ENST00000430350 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ZNF516Q92618 SEPT12-201ENST00000268231 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ZNF516Q92618 F10-203ENST00000409306 1450 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ZNF516Q92618 CYB561-203ENST00000392976 3151 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ZNF516Q92618 AC015688.4-201ENST00000580780 1647 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
ZNF516Q92618 BLVRB-201ENST00000263368 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ZNF516Q92618 ANAPC11-202ENST00000357385 881 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ZNF516Q92618 AC010141.1-201ENST00000411585 623 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
ZNF516Q92618 GLIS3-AS1-201ENST00000451340 734 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ZNF516Q92618 XRCC3-210ENST00000554974 575 ntTSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ZNF516Q92618 ZNF347-208ENST00000601804 496 ntTSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ZNF516Q92618 STXBP2-221ENST00000602355 716 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ZNF516Q92618 AL359881.2-201ENST00000602973 570 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
ZNF516Q92618 AL136301.1-201ENST00000615830 422 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
ZNF516Q92618 CALCR-203ENST00000394441 1774 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ZNF516Q92618 SIGLEC12-203ENST00000598614 1434 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ZNF516Q92618 PCDHA3-201ENST00000522353 5260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ZNF516Q92618 LGALS8-203ENST00000341872 2437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ZNF516Q92618 B4GALT3-213ENST00000622395 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ZNF516Q92618 PDE8B-203ENST00000340978 3426 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ZNF516Q92618 UBC-205ENST00000536769 3745 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ZNF516Q92618 C1orf43-206ENST00000368521 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ZNF516Q92618 CDK5RAP3-201ENST00000338399 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ZNF516Q92618 AC139712.1-201ENST00000378256 1875 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
ZNF516Q92618 TMPRSS6-204ENST00000406856 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ZNF516Q92618 E2F6-201ENST00000307236 3317 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ZNF516Q92618 WASH2P-202ENST00000538033 2800 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ZNF516Q92618 GLG1-203ENST00000447066 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ZNF516Q92618 TCP10-210ENST00000617120 2182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ZNF516Q92618 ABCB8-201ENST00000297504 2487 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ZNF516Q92618 CLCNKA-201ENST00000331433 2475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ZNF516Q92618 ATP6V1C1-202ENST00000518738 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ZNF516Q92618 SLC38A5-212ENST00000619100 2100 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ZNF516Q92618 SLC38A5-214ENST00000622196 2100 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54 ms