Protein–RNA interactions for Protein: Q8IXW5

RPAP2, Putative RNA polymerase II subunit B1 CTD phosphatase RPAP2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 612 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPAP2Q8IXW5 ATP6AP2-213ENST00000636251 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
RPAP2Q8IXW5 VIPAS39-202ENST00000343765 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
RPAP2Q8IXW5 NDNF-201ENST00000379692 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
RPAP2Q8IXW5 TPGS2-202ENST00000383056 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
RPAP2Q8IXW5 CD27-201ENST00000266557 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RPAP2Q8IXW5 FP565260.2-201ENST00000623476 1599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
RPAP2Q8IXW5 STAR-201ENST00000276449 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RPAP2Q8IXW5 MFNG-202ENST00000416983 2034 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
RPAP2Q8IXW5 FBXO8-202ENST00000503293 1546 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RPAP2Q8IXW5 CLCN6-207ENST00000376497 814 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
RPAP2Q8IXW5 STAM-202ENST00000377524 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RPAP2Q8IXW5 AL136309.1-201ENST00000403917 691 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
RPAP2Q8IXW5 PFN2-215ENST00000497148 743 ntTSL 4 BASIC18.51■□□□□ 0.55
RPAP2Q8IXW5 AP006333.2-201ENST00000544948 732 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
RPAP2Q8IXW5 C1RL-212ENST00000545337 813 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RPAP2Q8IXW5 AC093525.1-201ENST00000569317 596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
RPAP2Q8IXW5 GADD45B-204ENST00000587345 765 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
RPAP2Q8IXW5 PIH1D1-209ENST00000596049 992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
RPAP2Q8IXW5 AC008825.2-201ENST00000603374 718 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
RPAP2Q8IXW5 PFKFB4-201ENST00000232375 3586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RPAP2Q8IXW5 COL18A1-203ENST00000359759 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
RPAP2Q8IXW5 USP28-214ENST00000545540 3431 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
RPAP2Q8IXW5 STXBP6-201ENST00000323944 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RPAP2Q8IXW5 DDHD2-201ENST00000397166 4921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
RPAP2Q8IXW5 FARP1-214ENST00000595437 4926 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RPAP2Q8IXW5 ASXL1-210ENST00000613218 7038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
RPAP2Q8IXW5 PCK2-203ENST00000545054 2505 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
RPAP2Q8IXW5 PPP1R26-204ENST00000604351 4640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
RPAP2Q8IXW5 FANCG-201ENST00000378643 2631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RPAP2Q8IXW5 LINC00839-202ENST00000429940 2253 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
RPAP2Q8IXW5 RWDD1-202ENST00000466444 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RPAP2Q8IXW5 CYP4X1-201ENST00000371901 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RPAP2Q8IXW5 MAP7-207ENST00000616617 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
RPAP2Q8IXW5 GPSM1-205ENST00000440944 3633 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
RPAP2Q8IXW5 KHSRPP1-201ENST00000427983 1768 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
RPAP2Q8IXW5 DEF8-210ENST00000563594 4450 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RPAP2Q8IXW5 CRB2-201ENST00000359999 3659 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
RPAP2Q8IXW5 BIRC2-214ENST00000621637 3331 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
RPAP2Q8IXW5 EIF4G1-209ENST00000414031 5569 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RPAP2Q8IXW5 PDE1B-207ENST00000550620 2150 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RPAP2Q8IXW5 SEPT8-206ENST00000378706 4168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
RPAP2Q8IXW5 AL365199.1-201ENST00000421320 1714 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
RPAP2Q8IXW5 ACSF2-202ENST00000427954 2251 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
RPAP2Q8IXW5 MAPK15-203ENST00000395108 765 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RPAP2Q8IXW5 AL450469.1-201ENST00000418953 461 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
RPAP2Q8IXW5 U82695.1-202ENST00000428676 700 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
RPAP2Q8IXW5 CHMP1AP1-201ENST00000445563 662 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
RPAP2Q8IXW5 GLIS3-AS1-201ENST00000451340 734 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RPAP2Q8IXW5 KLF2P4-201ENST00000451959 1225 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
RPAP2Q8IXW5 ZFPL1-207ENST00000526791 384 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
RPAP2Q8IXW5 ORAOV1-211ENST00000542341 775 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
RPAP2Q8IXW5 ATP6V0A2-207ENST00000544833 1013 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
RPAP2Q8IXW5 AC079316.1-201ENST00000548397 411 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
RPAP2Q8IXW5 RAB43P1-201ENST00000561790 589 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
RPAP2Q8IXW5 MIR4683-201ENST00000579659 81 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
RPAP2Q8IXW5 AC011510.1-201ENST00000598541 286 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
RPAP2Q8IXW5 MIR6074-201ENST00000612054 107 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
RPAP2Q8IXW5 ZACNP1-201ENST00000612259 710 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
RPAP2Q8IXW5 MLLT10-216ENST00000621220 381 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RPAP2Q8IXW5 LINC01002-220ENST00000632790 449 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
RPAP2Q8IXW5 SAFB2-201ENST00000252542 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RPAP2Q8IXW5 AQP1-201ENST00000311813 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RPAP2Q8IXW5 LDHA-203ENST00000379412 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
RPAP2Q8IXW5 DFNA5-201ENST00000342947 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RPAP2Q8IXW5 MAGEA2-203ENST00000611557 2024 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
RPAP2Q8IXW5 LEF1-216ENST00000510624 1472 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
RPAP2Q8IXW5 CRAMP1-201ENST00000293925 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
RPAP2Q8IXW5 ZNF367-201ENST00000375256 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RPAP2Q8IXW5 FANCA-213ENST00000563673 1694 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RPAP2Q8IXW5 OPN4-202ENST00000372071 2401 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RPAP2Q8IXW5 CIT-219ENST00000612548 1799 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RPAP2Q8IXW5 RNF122-201ENST00000256257 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RPAP2Q8IXW5 CDK5RAP3-201ENST00000338399 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RPAP2Q8IXW5 AL109910.1-201ENST00000452071 1330 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
RPAP2Q8IXW5 CENPBD1P1-204ENST00000487264 1308 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RPAP2Q8IXW5 AC092506.1-201ENST00000634580 2275 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
RPAP2Q8IXW5 ITGBL1-207ENST00000622834 2369 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
RPAP2Q8IXW5 LINC01667-202ENST00000623919 1422 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
RPAP2Q8IXW5 AL162231.1-201ENST00000421828 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RPAP2Q8IXW5 AIFM2-202ENST00000373248 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RPAP2Q8IXW5 TSPOAP1-202ENST00000343736 5947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RPAP2Q8IXW5 ST7L-207ENST00000369669 1743 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
RPAP2Q8IXW5 GTF2H2C-210ENST00000510979 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RPAP2Q8IXW5 AC027601.1-201ENST00000575922 4506 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
RPAP2Q8IXW5 ADGRA1-AS1-202ENST00000444433 2646 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
RPAP2Q8IXW5 ZNF219-203ENST00000451119 2918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
RPAP2Q8IXW5 TNXB-208ENST00000611016 6083 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
RPAP2Q8IXW5 LCN9-201ENST00000277526 531 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
RPAP2Q8IXW5 PEMT-203ENST00000395782 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RPAP2Q8IXW5 SELENOM-201ENST00000400299 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RPAP2Q8IXW5 TBC1D8-202ENST00000409318 3803 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
RPAP2Q8IXW5 LARGE-AS1-202ENST00000424291 1065 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RPAP2Q8IXW5 AL807752.4-201ENST00000439076 580 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
RPAP2Q8IXW5 CTBP2P5-201ENST00000454986 1264 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
RPAP2Q8IXW5 AC106047.1-202ENST00000467484 482 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
RPAP2Q8IXW5 CEP57L1-208ENST00000519095 908 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
RPAP2Q8IXW5 AP002992.1-201ENST00000527519 491 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
RPAP2Q8IXW5 NDUFC1-210ENST00000539387 725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
RPAP2Q8IXW5 DIO3OS-203ENST00000554441 1068 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RPAP2Q8IXW5 DMAC2-208ENST00000589970 979 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74.6 ms