Protein–RNA interactions for Protein: Q8IWD4

CCDC117, Coiled-coil domain-containing protein 117, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 279 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC117Q8IWD4 AC078785.1-201ENST00000496389 734 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCDC117Q8IWD4 OSGIN2-203ENST00000520659 801 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCDC117Q8IWD4 AC100818.1-201ENST00000524167 563 ntTSL 4 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCDC117Q8IWD4 VASH1-AS1-201ENST00000554058 871 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCDC117Q8IWD4 XRCC3-210ENST00000554974 575 ntTSL 4 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCDC117Q8IWD4 AC091891.1-201ENST00000560688 688 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCDC117Q8IWD4 YIF1B-216ENST00000592694 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCDC117Q8IWD4 ANKRD30BP2-201ENST00000435744 1610 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
CCDC117Q8IWD4 AC004223.3-201ENST00000593039 1638 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCDC117Q8IWD4 OAS1-202ENST00000445409 1684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCDC117Q8IWD4 GPKOW-201ENST00000156109 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCDC117Q8IWD4 TGFB1I1-202ENST00000394858 1803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCDC117Q8IWD4 ACE3P-201ENST00000423435 1973 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
CCDC117Q8IWD4 AP000845.1-201ENST00000581677 2131 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
CCDC117Q8IWD4 NEK5-204ENST00000617045 2127 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCDC117Q8IWD4 KCNG4-202ENST00000568181 2199 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCDC117Q8IWD4 LINC00528-201ENST00000600723 2160 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
CCDC117Q8IWD4 ZNF586-201ENST00000391702 2265 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCDC117Q8IWD4 EDN3-201ENST00000311585 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCDC117Q8IWD4 NRCAM-217ENST00000613830 3025 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCDC117Q8IWD4 FHOD3-201ENST00000257209 4967 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCDC117Q8IWD4 NUP210-201ENST00000254508 7193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCDC117Q8IWD4 SERTAD2-201ENST00000313349 5549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCDC117Q8IWD4 GSG1L-203ENST00000447459 4916 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCDC117Q8IWD4 MYB-242ENST00000618728 3545 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCDC117Q8IWD4 DGKZ-205ENST00000456247 3482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCDC117Q8IWD4 CHAF1A-201ENST00000301280 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCDC117Q8IWD4 INPP5K-204ENST00000421807 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCDC117Q8IWD4 HNF1A-211ENST00000543427 2819 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCDC117Q8IWD4 OSBP2-209ENST00000438716 2747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCDC117Q8IWD4 LAT2-202ENST00000344995 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCDC117Q8IWD4 RSPH3-201ENST00000252655 2175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCDC117Q8IWD4 ZBTB32-202ENST00000392197 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCDC117Q8IWD4 MAGEA8-205ENST00000542674 2084 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCDC117Q8IWD4 TBPL2-201ENST00000247219 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCDC117Q8IWD4 DRC3-216ENST00000584166 1953 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCDC117Q8IWD4 MUC20-201ENST00000320736 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCDC117Q8IWD4 TGFB1I1-201ENST00000361773 1773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCDC117Q8IWD4 TC2N-206ENST00000556018 1770 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCDC117Q8IWD4 ATP6V0D1-201ENST00000290949 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCDC117Q8IWD4 PRR19-201ENST00000341747 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCDC117Q8IWD4 MYOZ1-201ENST00000359322 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCDC117Q8IWD4 LINC00593-202ENST00000560853 1483 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCDC117Q8IWD4 KCNC1-201ENST00000265969 4295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCDC117Q8IWD4 MS4A13-201ENST00000378185 808 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCDC117Q8IWD4 AL365277.1-206ENST00000417869 487 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCDC117Q8IWD4 AL355483.2-201ENST00000421637 675 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCDC117Q8IWD4 SGK2-207ENST00000426287 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCDC117Q8IWD4 HLA-K-203ENST00000430151 1046 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
CCDC117Q8IWD4 HIST2H2BA-202ENST00000430394 752 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCDC117Q8IWD4 AL365277.1-204ENST00000450157 599 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCDC117Q8IWD4 SYNPR-202ENST00000450542 1004 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCDC117Q8IWD4 AL365277.1-203ENST00000458207 693 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCDC117Q8IWD4 STAG3L5P-205ENST00000473757 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCDC117Q8IWD4 RPARP-AS1-201ENST00000473970 1297 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCDC117Q8IWD4 ROPN1-207ENST00000484329 566 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCDC117Q8IWD4 AP001790.1-201ENST00000511947 570 ntTSL 4 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCDC117Q8IWD4 FKBP5-203ENST00000539068 3827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCDC117Q8IWD4 SPECC1-223ENST00000584527 940 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCDC117Q8IWD4 CPT2-201ENST00000371486 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCDC117Q8IWD4 PCDHB16-201ENST00000609684 5001 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCDC117Q8IWD4 SSH3-203ENST00000376757 2990 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCDC117Q8IWD4 AC004943.2-201ENST00000563328 4842 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCDC117Q8IWD4 DDX55-201ENST00000238146 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCDC117Q8IWD4 YY1AP1-201ENST00000295566 2626 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCDC117Q8IWD4 ALPI-201ENST00000295463 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCDC117Q8IWD4 SIDT1-202ENST00000393830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCDC117Q8IWD4 KIAA1211L-201ENST00000397899 3907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCDC117Q8IWD4 RSPH6A-202ENST00000597055 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCDC117Q8IWD4 TNPO2-202ENST00000425528 5122 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCDC117Q8IWD4 PLEKHN1-201ENST00000379407 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCDC117Q8IWD4 AC073082.1-201ENST00000602369 2103 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCDC117Q8IWD4 AXL-201ENST00000301178 4737 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCDC117Q8IWD4 PIMREG-205ENST00000572447 1948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCDC117Q8IWD4 BTBD10-208ENST00000528120 1662 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCDC117Q8IWD4 KIFC3-205ENST00000540079 2781 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCDC117Q8IWD4 RASA4B-207ENST00000541662 2794 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCDC117Q8IWD4 HCRTR1-202ENST00000373706 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCDC117Q8IWD4 OIT3-202ENST00000622652 1602 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCDC117Q8IWD4 MCF2L-232ENST00000535094 3752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCDC117Q8IWD4 LMF2-201ENST00000216080 2658 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCDC117Q8IWD4 CLDN22-201ENST00000323319 2581 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCDC117Q8IWD4 ANO6-202ENST00000423947 5504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCDC117Q8IWD4 ASCL1-201ENST00000266744 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCDC117Q8IWD4 FAM32A-201ENST00000263384 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCDC117Q8IWD4 IPO8-201ENST00000256079 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCDC117Q8IWD4 SLC35D1-201ENST00000235345 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCDC117Q8IWD4 ASTN2-201ENST00000288520 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCDC117Q8IWD4 SLC26A10-201ENST00000320442 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCDC117Q8IWD4 NAXD-202ENST00000424185 2311 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCDC117Q8IWD4 SEMA6D-208ENST00000558014 6028 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCDC117Q8IWD4 AP003392.4-202ENST00000526453 1359 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCDC117Q8IWD4 KCNQ4-201ENST00000347132 4099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCDC117Q8IWD4 AQP6-204ENST00000615425 2245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCDC117Q8IWD4 SPAG11B-203ENST00000359758 612 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCDC117Q8IWD4 EDN2-201ENST00000372587 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCDC117Q8IWD4 COL20A1-203ENST00000422202 8097 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCDC117Q8IWD4 AC128709.2-201ENST00000438408 558 ntTSL 4 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCDC117Q8IWD4 LYRM9-204ENST00000503642 432 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCDC117Q8IWD4 AC109479.1-201ENST00000519603 624 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.7 ms