Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTU9

STRC, Stereocilin, humanhuman

Predictions only

Length 1,775 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STRCQ7RTU9 AC139100.2-201ENST00000616901 662 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
STRCQ7RTU9 AC012594.1-273ENST00000626618 816 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
STRCQ7RTU9 LUC7L3-202ENST00000393227 2284 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
STRCQ7RTU9 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
STRCQ7RTU9 CALCB-203ENST00000533448 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.82
STRCQ7RTU9 BCKDHA-202ENST00000457836 1745 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.82
STRCQ7RTU9 PNLIP-201ENST00000369221 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
STRCQ7RTU9 FAM83A-AS1-202ENST00000520576 1347 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
STRCQ7RTU9 LCE4A-201ENST00000335535 388 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
STRCQ7RTU9 RPL38-202ENST00000439590 431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
STRCQ7RTU9 LINC01833-204ENST00000444871 581 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
STRCQ7RTU9 RN7SL33P-201ENST00000462543 342 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
STRCQ7RTU9 AC233724.9-201ENST00000511694 407 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
STRCQ7RTU9 MAFG-AS1-202ENST00000583492 969 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
STRCQ7RTU9 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
STRCQ7RTU9 SLC37A4-201ENST00000330775 2102 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
STRCQ7RTU9 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
STRCQ7RTU9 LINC02076-201ENST00000577684 1871 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
STRCQ7RTU9 VIPAS39-208ENST00000556412 1832 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
STRCQ7RTU9 CHI3L1-201ENST00000255409 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
STRCQ7RTU9 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
STRCQ7RTU9 ALDOA-204ENST00000412304 1603 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
STRCQ7RTU9 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
STRCQ7RTU9 AC006504.5-208ENST00000588784 2401 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
STRCQ7RTU9 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
STRCQ7RTU9 DHX40-202ENST00000425628 2255 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
STRCQ7RTU9 DIAPH2-202ENST00000355827 3782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
STRCQ7RTU9 BARX1-AS1-201ENST00000453045 1445 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
STRCQ7RTU9 LCMT1-203ENST00000399069 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
STRCQ7RTU9 C7orf72-201ENST00000297001 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
STRCQ7RTU9 GZMB-201ENST00000216341 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
STRCQ7RTU9 TCEA3-201ENST00000374601 1197 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
STRCQ7RTU9 RNA5SP420-201ENST00000516997 137 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
STRCQ7RTU9 RPL10P8-201ENST00000522888 313 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
STRCQ7RTU9 AC117834.1-201ENST00000523197 602 ntTSL 4 BASIC20.13■□□□□ 0.81
STRCQ7RTU9 AC022784.6-202ENST00000523246 674 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
STRCQ7RTU9 FAM187B2P-201ENST00000577135 713 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
STRCQ7RTU9 URGCP-MRPS24-201ENST00000603700 795 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
STRCQ7RTU9 AC114296.1-202ENST00000638019 771 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
STRCQ7RTU9 TMC4-210ENST00000619895 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
STRCQ7RTU9 GOLGA8UP-201ENST00000527159 1755 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
STRCQ7RTU9 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
STRCQ7RTU9 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
STRCQ7RTU9 RAPGEFL1-202ENST00000456989 1582 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
STRCQ7RTU9 SGK3-211ENST00000522398 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
STRCQ7RTU9 CTSD-208ENST00000636843 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
STRCQ7RTU9 CTSB-201ENST00000345125 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
STRCQ7RTU9 SUOX-204ENST00000394115 2394 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
STRCQ7RTU9 MBIP-211ENST00000621657 1809 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
STRCQ7RTU9 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
STRCQ7RTU9 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
STRCQ7RTU9 HIGD2A-201ENST00000274787 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
STRCQ7RTU9 CCND3P1-201ENST00000438347 580 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
STRCQ7RTU9 HNRNPC-221ENST00000555883 1182 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
STRCQ7RTU9 PAX8-AS1-219ENST00000623306 840 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
STRCQ7RTU9 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
STRCQ7RTU9 CYP4F22-202ENST00000601005 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
STRCQ7RTU9 GMPR2-231ENST00000620807 1910 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
STRCQ7RTU9 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
STRCQ7RTU9 BTN3A1-204ENST00000425234 1882 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
STRCQ7RTU9 TAF9-202ENST00000328663 1461 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
STRCQ7RTU9 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
STRCQ7RTU9 LIPA-205ENST00000456827 2527 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
STRCQ7RTU9 AC092115.1-201ENST00000566277 1402 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
STRCQ7RTU9 SLC13A5-202ENST00000381074 1738 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
STRCQ7RTU9 PAX7-202ENST00000400661 1700 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
STRCQ7RTU9 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
STRCQ7RTU9 OXGR1-204ENST00000543457 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
STRCQ7RTU9 EPPIN-201ENST00000336443 1217 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
STRCQ7RTU9 APOBEC3B-204ENST00000407298 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
STRCQ7RTU9 PGK1P2-201ENST00000431702 1214 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
STRCQ7RTU9 HNRNPA1P73-201ENST00000446472 928 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
STRCQ7RTU9 AL450346.2-201ENST00000495602 1024 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
STRCQ7RTU9 AC009487.3-201ENST00000505579 560 ntTSL 4 BASIC20.12■□□□□ 0.81
STRCQ7RTU9 DDIAS-204ENST00000525388 961 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
STRCQ7RTU9 AC009119.3-202ENST00000566773 196 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
STRCQ7RTU9 HMOX2-213ENST00000575120 1027 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
STRCQ7RTU9 RN7SL455P-201ENST00000580629 282 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
STRCQ7RTU9 UBA52-214ENST00000599595 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
STRCQ7RTU9 CBSL-201ENST00000398168 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
STRCQ7RTU9 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
STRCQ7RTU9 GINS2-201ENST00000253462 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
STRCQ7RTU9 AC105250.1-201ENST00000509378 2057 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
STRCQ7RTU9 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
STRCQ7RTU9 SLC22A23-210ENST00000490273 2043 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
STRCQ7RTU9 RSPO1-203ENST00000612451 2463 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
STRCQ7RTU9 MYC-206ENST00000613283 1365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
STRCQ7RTU9 GPX3-201ENST00000388825 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
STRCQ7RTU9 INTS14-204ENST00000442903 1863 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
STRCQ7RTU9 SNCAIP-206ENST00000414317 1591 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
STRCQ7RTU9 PDXK-202ENST00000327574 2583 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
STRCQ7RTU9 C6orf48-202ENST00000375635 610 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
STRCQ7RTU9 REG3G-202ENST00000393897 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
STRCQ7RTU9 C6orf48-209ENST00000395789 952 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
STRCQ7RTU9 ACTBP14-201ENST00000411655 1089 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
STRCQ7RTU9 ZNF32-AS2-201ENST00000418966 905 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
STRCQ7RTU9 AL161733.1-201ENST00000421067 462 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
STRCQ7RTU9 LINC00887-204ENST00000456816 796 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
STRCQ7RTU9 ABCD1P3-201ENST00000562927 605 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
STRCQ7RTU9 AL162731.1-201ENST00000613248 876 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.5 ms