Protein–RNA interactions for Protein: Q6UWD8

C16orf54, Transmembrane protein C16orf54, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C16orf54Q6UWD8 SNAP91-213ENST00000521485 4521 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
C16orf54Q6UWD8 PI4K2B-201ENST00000264864 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
C16orf54Q6UWD8 MAP3K1-201ENST00000399503 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
C16orf54Q6UWD8 RSPH9-201ENST00000372163 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
C16orf54Q6UWD8 SLC4A7-207ENST00000437179 3667 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
C16orf54Q6UWD8 ATG2A-201ENST00000377264 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
C16orf54Q6UWD8 MANBAL-201ENST00000373605 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
C16orf54Q6UWD8 UPB1-202ENST00000382760 1928 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
C16orf54Q6UWD8 KCNG4-201ENST00000308251 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
C16orf54Q6UWD8 ACY3-201ENST00000255082 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
C16orf54Q6UWD8 ZFPM2-206ENST00000520492 3960 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
C16orf54Q6UWD8 RPS28-203ENST00000600659 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
C16orf54Q6UWD8 KLK8-211ENST00000600767 1324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
C16orf54Q6UWD8 SMARCA2-203ENST00000349721 5761 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
C16orf54Q6UWD8 MFRP-201ENST00000360167 1663 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
C16orf54Q6UWD8 SCLT1-209ENST00000511426 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
C16orf54Q6UWD8 MSI1-201ENST00000257552 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
C16orf54Q6UWD8 CALN1-201ENST00000329008 9243 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
C16orf54Q6UWD8 PPIL2-202ENST00000398831 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
C16orf54Q6UWD8 MYADM-205ENST00000391771 3111 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
C16orf54Q6UWD8 CCDC47-201ENST00000225726 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
C16orf54Q6UWD8 RFX5-215ENST00000452671 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
C16orf54Q6UWD8 RPS5-201ENST00000196551 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
C16orf54Q6UWD8 OSTC-201ENST00000361564 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
C16orf54Q6UWD8 S100A16-202ENST00000368704 1146 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
C16orf54Q6UWD8 LCE1E-201ENST00000368770 1180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
C16orf54Q6UWD8 MEP1AP4-201ENST00000423244 1087 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
C16orf54Q6UWD8 MOGAT3-203ENST00000440203 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
C16orf54Q6UWD8 BX322559.1-201ENST00000456613 319 ntTSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
C16orf54Q6UWD8 RN7SL399P-201ENST00000471648 279 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
C16orf54Q6UWD8 AC002310.2-201ENST00000486926 950 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
C16orf54Q6UWD8 HSPB7-207ENST00000487046 844 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
C16orf54Q6UWD8 SWI5-205ENST00000495313 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
C16orf54Q6UWD8 TPRX2P-201ENST00000535362 881 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
C16orf54Q6UWD8 RNF24-204ENST00000545616 1128 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
C16orf54Q6UWD8 AC027243.1-201ENST00000559539 758 ntTSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
C16orf54Q6UWD8 SMCO4-206ENST00000596676 180 ntAPPRIS P1 BASIC11.66□□□□□ -0.54
C16orf54Q6UWD8 RNA5-8SN1-201ENST00000610460 153 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
C16orf54Q6UWD8 RNA5-8SN5-202ENST00000612463 153 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
C16orf54Q6UWD8 RNA5-8SN4-201ENST00000613359 153 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
C16orf54Q6UWD8 RNA5-8SN5-201ENST00000619471 153 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
C16orf54Q6UWD8 PRF1-203ENST00000638674 1080 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
C16orf54Q6UWD8 MPDU1-201ENST00000250124 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
C16orf54Q6UWD8 NKIRAS1-203ENST00000415901 1644 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
C16orf54Q6UWD8 ANO7-202ENST00000402430 2652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
C16orf54Q6UWD8 DRD5P1-201ENST00000456605 1438 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
C16orf54Q6UWD8 XPO6-201ENST00000304658 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
C16orf54Q6UWD8 PCDHB13-201ENST00000341948 5061 ntAPPRIS P1 BASIC11.66□□□□□ -0.54
C16orf54Q6UWD8 MCRS1-211ENST00000550165 1936 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
C16orf54Q6UWD8 IQCE-216ENST00000611775 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
C16orf54Q6UWD8 FADS1-201ENST00000350997 4525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
C16orf54Q6UWD8 ATG16L1-202ENST00000373525 2767 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
C16orf54Q6UWD8 SLC28A1-203ENST00000394573 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
C16orf54Q6UWD8 PPFIA3-203ENST00000602351 4341 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
C16orf54Q6UWD8 DNAJC21-202ENST00000382021 6208 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
C16orf54Q6UWD8 GHRLOS-201ENST00000439539 1708 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
C16orf54Q6UWD8 SPATS1-201ENST00000288390 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
C16orf54Q6UWD8 FAM174A-201ENST00000312637 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
C16orf54Q6UWD8 STXBP6-201ENST00000323944 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
C16orf54Q6UWD8 LILRP1-201ENST00000444199 1370 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
C16orf54Q6UWD8 EEF1A1-202ENST00000316292 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
C16orf54Q6UWD8 MTHFR-210ENST00000641407 2387 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
C16orf54Q6UWD8 C12orf42-201ENST00000378113 1513 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
C16orf54Q6UWD8 NOX3-201ENST00000159060 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
C16orf54Q6UWD8 SAFB-201ENST00000292123 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
C16orf54Q6UWD8 ARHGEF7-204ENST00000375736 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
C16orf54Q6UWD8 RHPN1-201ENST00000289013 3683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
C16orf54Q6UWD8 TIFA-201ENST00000361717 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
C16orf54Q6UWD8 C9orf47-201ENST00000334490 4829 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
C16orf54Q6UWD8 LINC02396-202ENST00000550636 2324 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
C16orf54Q6UWD8 AL121757.1-201ENST00000430097 1836 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
C16orf54Q6UWD8 SAMD4A-208ENST00000555192 1337 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
C16orf54Q6UWD8 AL360270.3-201ENST00000609118 1348 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
C16orf54Q6UWD8 AGPS-201ENST00000264167 7764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
C16orf54Q6UWD8 EYA3-202ENST00000373864 2459 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
C16orf54Q6UWD8 LITAF-221ENST00000622633 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
C16orf54Q6UWD8 GPSM3-207ENST00000375043 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
C16orf54Q6UWD8 ARHGAP10-201ENST00000336498 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
C16orf54Q6UWD8 TAGLN2-202ENST00000368096 1603 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
C16orf54Q6UWD8 LHX6-207ENST00000541397 2942 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
C16orf54Q6UWD8 NDRG4-217ENST00000562999 2931 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
C16orf54Q6UWD8 AC138028.2-202ENST00000567968 4528 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
C16orf54Q6UWD8 HNRNPR-204ENST00000427764 1788 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
C16orf54Q6UWD8 AC097376.2-205ENST00000610159 5334 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
C16orf54Q6UWD8 CTSD-207ENST00000636571 1790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
C16orf54Q6UWD8 CLCNKB-202ENST00000375679 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
C16orf54Q6UWD8 CLU-202ENST00000405140 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
C16orf54Q6UWD8 SIVA1-202ENST00000347067 550 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
C16orf54Q6UWD8 ZSCAN2-205ENST00000379358 906 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
C16orf54Q6UWD8 PIR-201ENST00000380420 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
C16orf54Q6UWD8 PDGFB-202ENST00000381551 1125 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
C16orf54Q6UWD8 DSCR3-204ENST00000399001 821 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
C16orf54Q6UWD8 AL022068.1-202ENST00000432171 794 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
C16orf54Q6UWD8 AC016683.1-202ENST00000438409 583 ntTSL 4 BASIC11.65□□□□□ -0.54
C16orf54Q6UWD8 LINC00229-201ENST00000443783 500 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
C16orf54Q6UWD8 AL627443.1-201ENST00000456477 1035 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
C16orf54Q6UWD8 NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 568 ntTSL 4 BASIC11.65□□□□□ -0.54
C16orf54Q6UWD8 RPL13AP25-201ENST00000484130 612 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
C16orf54Q6UWD8 AC021491.2-201ENST00000513017 607 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
C16orf54Q6UWD8 AC026410.3-201ENST00000514280 936 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 82.6 ms