Protein–RNA interactions for Protein: Q6P9A3

ZNF549, Zinc finger protein 549, humanhuman

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Length 640 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF549Q6P9A3 GREM1-201ENST00000560677 623 ntTSL 4 BASIC14.84□□□□□ -0.03
ZNF549Q6P9A3 MIR5189-201ENST00000577370 114 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
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ZNF549Q6P9A3 OXTR-201ENST00000316793 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
ZNF549Q6P9A3 ABTB2-201ENST00000435224 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
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ZNF549Q6P9A3 AC108134.1-201ENST00000382225 3061 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
ZNF549Q6P9A3 TMEM41B-204ENST00000528080 3968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
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ZNF549Q6P9A3 FGFR3-203ENST00000352904 3733 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
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ZNF549Q6P9A3 PPIL2-212ENST00000626352 2625 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
ZNF549Q6P9A3 TRMT2B-201ENST00000372935 2921 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
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ZNF549Q6P9A3 LINC00639-201ENST00000553932 4496 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.03
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ZNF549Q6P9A3 RNF122-201ENST00000256257 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
ZNF549Q6P9A3 RMND1-202ENST00000367303 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
ZNF549Q6P9A3 PNPLA3-201ENST00000216180 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
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ZNF549Q6P9A3 GPAT3-201ENST00000264409 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
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ZNF549Q6P9A3 SAPCD2-201ENST00000409687 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
ZNF549Q6P9A3 FAM210A-202ENST00000402563 4240 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
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ZNF549Q6P9A3 KCNMA1-202ENST00000286628 6233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
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ZNF549Q6P9A3 MEN1-207ENST00000377326 3150 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
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ZNF549Q6P9A3 MAGIX-208ENST00000616266 3295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
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ZNF549Q6P9A3 SS18L2-201ENST00000011691 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
ZNF549Q6P9A3 UBXN1-201ENST00000294119 1291 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
ZNF549Q6P9A3 UBXN1-202ENST00000301935 1153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
ZNF549Q6P9A3 SFT2D1-201ENST00000361731 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
ZNF549Q6P9A3 TLE1P1-201ENST00000422965 589 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
ZNF549Q6P9A3 ADAMTSL1-210ENST00000431052 824 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
ZNF549Q6P9A3 LCN10-206ENST00000527229 615 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
ZNF549Q6P9A3 ZSCAN2-213ENST00000541040 965 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
ZNF549Q6P9A3 SNAI3-AS1-206ENST00000569786 588 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
ZNF549Q6P9A3 PRCD-204ENST00000586148 630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
ZNF549Q6P9A3 AP005482.2-201ENST00000587889 310 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
ZNF549Q6P9A3 DNAI1-209ENST00000614641 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
ZNF549Q6P9A3 HAP1-204ENST00000393939 5683 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
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