Protein–RNA interactions for Protein: Q53RT3

ASPRV1, Retroviral-like aspartic protease 1, humanhuman

Predictions only

Length 343 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ASPRV1Q53RT3 RGS6-217ENST00000555571 1764 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ASPRV1Q53RT3 HTR3A-202ENST00000355556 2331 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ASPRV1Q53RT3 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ASPRV1Q53RT3 GARS-201ENST00000389266 2634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ASPRV1Q53RT3 ZHX1-201ENST00000297857 5200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ASPRV1Q53RT3 EIF4EBP3-201ENST00000310331 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ASPRV1Q53RT3 TSPO-201ENST00000329563 955 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ASPRV1Q53RT3 CSH2-201ENST00000336844 1173 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ASPRV1Q53RT3 CSH2-202ENST00000345366 598 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ASPRV1Q53RT3 CLIC1-206ENST00000375779 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ASPRV1Q53RT3 FGF13-204ENST00000436198 1165 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ASPRV1Q53RT3 KLF2P1-201ENST00000447438 1042 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
ASPRV1Q53RT3 AC105362.1-201ENST00000511234 564 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ASPRV1Q53RT3 ANO1-AS1-201ENST00000524987 646 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ASPRV1Q53RT3 AP000438.1-201ENST00000543624 749 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ASPRV1Q53RT3 MIR3615-201ENST00000581999 87 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
ASPRV1Q53RT3 TSPO-206ENST00000583777 636 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ASPRV1Q53RT3 Z98259.2-201ENST00000641583 609 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
ASPRV1Q53RT3 C12orf76-209ENST00000615315 1580 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ASPRV1Q53RT3 AC139712.1-201ENST00000378256 1875 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
ASPRV1Q53RT3 LINC02076-201ENST00000577684 1871 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ASPRV1Q53RT3 LINGO1-201ENST00000355300 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ASPRV1Q53RT3 BICDL1-201ENST00000397558 3055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ASPRV1Q53RT3 EVPL-201ENST00000301607 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ASPRV1Q53RT3 AL008718.2-201ENST00000609206 1313 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
ASPRV1Q53RT3 NR1H3-211ENST00000441012 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ASPRV1Q53RT3 WASH3P-204ENST00000558784 1644 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ASPRV1Q53RT3 CAMKK2-211ENST00000538733 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ASPRV1Q53RT3 KITLG-202ENST00000347404 1948 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ASPRV1Q53RT3 HYAL1-209ENST00000618175 2225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ASPRV1Q53RT3 ASIC1-202ENST00000447966 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ASPRV1Q53RT3 ARHGAP9-201ENST00000393791 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ASPRV1Q53RT3 HNRNPDL-208ENST00000621267 4139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ASPRV1Q53RT3 TP53I11-208ENST00000525680 2647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ASPRV1Q53RT3 ZNF846-201ENST00000397902 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ASPRV1Q53RT3 NUCKS1-201ENST00000367142 6496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ASPRV1Q53RT3 BRF1-205ENST00000440513 2368 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ASPRV1Q53RT3 CICP14-201ENST00000629111 2732 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
ASPRV1Q53RT3 CC2D1B-202ENST00000371586 5642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ASPRV1Q53RT3 TRIM3-215ENST00000639856 2137 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ASPRV1Q53RT3 VCAN-211ENST00000513984 1825 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ASPRV1Q53RT3 RGS3-201ENST00000317613 2542 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ASPRV1Q53RT3 PDHB-206ENST00000474765 1503 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ASPRV1Q53RT3 C14orf180-203ENST00000557649 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ASPRV1Q53RT3 AC138517.2-201ENST00000637503 2594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ASPRV1Q53RT3 NF2-202ENST00000338641 6025 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ASPRV1Q53RT3 MX1-218ENST00000619682 1980 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ASPRV1Q53RT3 SLC38A5-213ENST00000620913 1993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ASPRV1Q53RT3 PDE1B-201ENST00000243052 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ASPRV1Q53RT3 TPRKB-202ENST00000318190 819 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ASPRV1Q53RT3 AGER-203ENST00000375065 665 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ASPRV1Q53RT3 ATP6V1E1-202ENST00000399796 1208 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ASPRV1Q53RT3 AL157407.1-201ENST00000435784 904 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
ASPRV1Q53RT3 AC044849.1-201ENST00000519737 1188 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
ASPRV1Q53RT3 CCDC86-203ENST00000545580 697 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ASPRV1Q53RT3 ACYP1-206ENST00000555694 565 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ASPRV1Q53RT3 NAT9-222ENST00000583476 583 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ASPRV1Q53RT3 AC009884.2-201ENST00000603110 324 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
ASPRV1Q53RT3 CYP1B1-AS1-221ENST00000627172 995 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ASPRV1Q53RT3 AC244452.3-201ENST00000636814 210 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
ASPRV1Q53RT3 LRRC57-202ENST00000397130 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ASPRV1Q53RT3 SCAMP4-202ENST00000409472 2394 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ASPRV1Q53RT3 PTGES3L-AARSD1-202ENST00000409103 1670 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ASPRV1Q53RT3 PRMT7-203ENST00000449359 2091 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ASPRV1Q53RT3 PCMTD2-207ENST00000609372 1321 ntTSL 4 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ASPRV1Q53RT3 AC004899.1-201ENST00000424687 1714 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
ASPRV1Q53RT3 AL139423.1-201ENST00000606802 7923 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ASPRV1Q53RT3 GPC1-201ENST00000264039 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ASPRV1Q53RT3 KRT8P28-201ENST00000433288 1390 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
ASPRV1Q53RT3 IQSEC3-203ENST00000538872 7094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ASPRV1Q53RT3 KLHL42-201ENST00000381271 6703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ASPRV1Q53RT3 ELAVL1-205ENST00000596459 1473 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ASPRV1Q53RT3 ZBTB7C-204ENST00000586438 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ASPRV1Q53RT3 BBS1-225ENST00000630659 1934 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ASPRV1Q53RT3 RPS19-206ENST00000598742 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ASPRV1Q53RT3 TMEM9-204ENST00000367334 1529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ASPRV1Q53RT3 TMEM230-202ENST00000342308 1562 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ASPRV1Q53RT3 HOGA1-202ENST00000370646 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ASPRV1Q53RT3 NACAD-202ENST00000490531 4780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ASPRV1Q53RT3 SLC8B1-201ENST00000202831 2975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ASPRV1Q53RT3 P3H1-201ENST00000236040 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ASPRV1Q53RT3 GSTCD-206ENST00000507281 2091 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ASPRV1Q53RT3 CCDC47-201ENST00000225726 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ASPRV1Q53RT3 RUFY1-204ENST00000437570 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ASPRV1Q53RT3 PIANP-202ENST00000534837 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ASPRV1Q53RT3 BMP4-206ENST00000559087 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ASPRV1Q53RT3 PCDHA10-201ENST00000307360 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ASPRV1Q53RT3 RCAN3-202ENST00000374395 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ASPRV1Q53RT3 TBL3-205ENST00000568546 6803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ASPRV1Q53RT3 KIF3A-202ENST00000378746 6325 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ASPRV1Q53RT3 TPM3-205ENST00000328159 1771 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ASPRV1Q53RT3 CD68-202ENST00000380498 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ASPRV1Q53RT3 ZFP36-203ENST00000597629 1786 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ASPRV1Q53RT3 MAP7-207ENST00000616617 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ASPRV1Q53RT3 RPL35-201ENST00000348462 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ASPRV1Q53RT3 SF3B5-201ENST00000367569 693 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ASPRV1Q53RT3 DPM3-202ENST00000368399 517 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
ASPRV1Q53RT3 ETV2-201ENST00000379023 926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ASPRV1Q53RT3 LINC00278-201ENST00000425031 528 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ASPRV1Q53RT3 AL645933.1-201ENST00000440087 609 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.1 ms