Protein–RNA interactions for Protein: Q53H82

LACTB2, Endoribonuclease LACTB2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 288 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LACTB2Q53H82 ACTA1-201ENST00000366683 1122 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
LACTB2Q53H82 NDUFA3-204ENST00000391764 267 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
LACTB2Q53H82 DGCR5-201ENST00000399539 862 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
LACTB2Q53H82 CYTH4-203ENST00000405206 636 ntTSL 4 BASIC15.18■□□□□ 0.02
LACTB2Q53H82 RPL37AP1-201ENST00000412502 279 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
LACTB2Q53H82 AL645941.1-201ENST00000415875 338 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
LACTB2Q53H82 TGFA-205ENST00000444975 985 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LACTB2Q53H82 AC078942.1-201ENST00000448698 589 ntTSL 4 BASIC15.18■□□□□ 0.02
LACTB2Q53H82 CHMP2B-205ENST00000494980 1175 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
LACTB2Q53H82 AC040162.1-202ENST00000573493 573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
LACTB2Q53H82 LINC01775-201ENST00000587826 371 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LACTB2Q53H82 RN7SL828P-201ENST00000607615 303 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
LACTB2Q53H82 HIST1H2AB-201ENST00000615868 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
LACTB2Q53H82 AL162274.1-201ENST00000617191 1098 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
LACTB2Q53H82 AC092811.2-201ENST00000632561 559 ntTSL 4 BASIC15.18■□□□□ 0.02
LACTB2Q53H82 AC004840.1-201ENST00000636359 365 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
LACTB2Q53H82 GAK-201ENST00000314167 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LACTB2Q53H82 ZDHHC4-203ENST00000396707 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LACTB2Q53H82 BEND6-203ENST00000370748 3497 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LACTB2Q53H82 MAGED4B-207ENST00000485287 2618 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LACTB2Q53H82 ITGB2-208ENST00000397857 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
LACTB2Q53H82 AC019294.4-201ENST00000561777 2905 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
LACTB2Q53H82 UBXN2B-201ENST00000399598 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LACTB2Q53H82 PDE8A-203ENST00000394553 3912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LACTB2Q53H82 TCP1-201ENST00000321394 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LACTB2Q53H82 FFAR4-202ENST00000371483 3653 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LACTB2Q53H82 EP400NL-206ENST00000446190 3697 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
LACTB2Q53H82 IDH3G-212ENST00000619865 1339 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
LACTB2Q53H82 FLI1-201ENST00000281428 4151 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LACTB2Q53H82 HFE2-205ENST00000497365 1419 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LACTB2Q53H82 SIX5-204ENST00000622857 1401 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
LACTB2Q53H82 AC098591.1-201ENST00000381811 1613 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
LACTB2Q53H82 AC068075.1-201ENST00000519714 1832 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LACTB2Q53H82 ZNF32-AS3-201ENST00000458063 1932 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LACTB2Q53H82 PATL2-207ENST00000560775 1913 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
LACTB2Q53H82 SPATA21-201ENST00000335496 2015 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LACTB2Q53H82 AMT-221ENST00000538581 2038 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
LACTB2Q53H82 MOGAT3-201ENST00000223114 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LACTB2Q53H82 XKRX-202ENST00000468904 2249 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
LACTB2Q53H82 MAP7-204ENST00000454590 3119 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
LACTB2Q53H82 FRMD8-202ENST00000355991 3514 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
LACTB2Q53H82 XRRA1-202ENST00000340360 5681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
LACTB2Q53H82 TAP2-205ENST00000620123 5676 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
LACTB2Q53H82 MX1-202ENST00000398598 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LACTB2Q53H82 SDR16C5-202ENST00000396721 2399 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LACTB2Q53H82 AC023794.5-201ENST00000564380 2157 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
LACTB2Q53H82 PATL2-208ENST00000560780 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
LACTB2Q53H82 KRT8-215ENST00000552150 1687 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LACTB2Q53H82 LCN15-201ENST00000316144 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LACTB2Q53H82 SLC18B1-202ENST00000367918 472 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
LACTB2Q53H82 FAM220BP-201ENST00000377689 816 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
LACTB2Q53H82 FAM166B-201ENST00000399742 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LACTB2Q53H82 MAGEC1-202ENST00000406005 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LACTB2Q53H82 CENPM-206ENST00000407253 818 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
LACTB2Q53H82 CC2D2B-203ENST00000423344 1241 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
LACTB2Q53H82 AC062015.1-201ENST00000423838 1134 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LACTB2Q53H82 RPS2P32-201ENST00000439199 892 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
LACTB2Q53H82 LINC01160-201ENST00000441004 768 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
LACTB2Q53H82 ACA64.2-201ENST00000459014 129 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
LACTB2Q53H82 PTPRG-AS1-205ENST00000475371 733 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
LACTB2Q53H82 LINC01605-204ENST00000522718 1093 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
LACTB2Q53H82 ZFPL1-207ENST00000526791 384 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
LACTB2Q53H82 IFITM2-204ENST00000533141 588 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
LACTB2Q53H82 LINC00473-203ENST00000581850 929 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
LACTB2Q53H82 PRF1-203ENST00000638674 1080 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
LACTB2Q53H82 C18orf25-206ENST00000619301 5264 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LACTB2Q53H82 ZNF641-201ENST00000301042 4544 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
LACTB2Q53H82 RCAN3-202ENST00000374395 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LACTB2Q53H82 ATG5-201ENST00000343245 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LACTB2Q53H82 TACR2-202ENST00000373307 1740 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
LACTB2Q53H82 ARHGEF6-202ENST00000370620 4764 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
LACTB2Q53H82 GNAS-215ENST00000371102 3438 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
LACTB2Q53H82 SPIB-201ENST00000270632 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LACTB2Q53H82 TNS2-201ENST00000314250 5010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LACTB2Q53H82 UPB1-201ENST00000326010 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LACTB2Q53H82 AC026790.1-201ENST00000399760 2941 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
LACTB2Q53H82 PGAP2-201ENST00000278243 2062 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LACTB2Q53H82 TTC8-203ENST00000346301 2058 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LACTB2Q53H82 ALK-201ENST00000389048 6220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LACTB2Q53H82 TGFBRAP1-201ENST00000258449 2827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
LACTB2Q53H82 C7orf57-202ENST00000420324 1957 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
LACTB2Q53H82 PABPC1-201ENST00000318607 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LACTB2Q53H82 INF2-203ENST00000392634 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
LACTB2Q53H82 AP003555.1-202ENST00000511013 1755 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LACTB2Q53H82 MARK4-202ENST00000300843 5209 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LACTB2Q53H82 ANP32A-203ENST00000465139 2440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LACTB2Q53H82 TBC1D24-207ENST00000627285 4382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
LACTB2Q53H82 MCHR1-201ENST00000249016 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LACTB2Q53H82 TEKT4P2-201ENST00000416067 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LACTB2Q53H82 NUCKS1-201ENST00000367142 6496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LACTB2Q53H82 PAK4-208ENST00000599386 5735 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LACTB2Q53H82 BTBD7P1-201ENST00000447253 1453 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
LACTB2Q53H82 VASH1-203ENST00000554237 1462 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LACTB2Q53H82 KIFC3-204ENST00000465878 3225 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LACTB2Q53H82 MANBA-202ENST00000505239 2577 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
LACTB2Q53H82 BRAP-201ENST00000327551 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LACTB2Q53H82 PLEKHB2-205ENST00000409279 2488 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
LACTB2Q53H82 TDH-201ENST00000525246 1357 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LACTB2Q53H82 KIAA0907-201ENST00000368319 1155 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LACTB2Q53H82 C1orf68-201ENST00000368775 949 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.5 ms