Protein–RNA interactions for Protein: Q53GT1

KLHL22, Kelch-like protein 22, humanhuman

Predictions only

Length 634 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL22Q53GT1 C9orf152-201ENST00000400613 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
KLHL22Q53GT1 CD6-201ENST00000313421 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
KLHL22Q53GT1 ZMYND10-202ENST00000360165 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
KLHL22Q53GT1 CENPM-201ENST00000215980 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
KLHL22Q53GT1 ZNF593-201ENST00000270812 698 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
KLHL22Q53GT1 C11orf71-201ENST00000325636 652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
KLHL22Q53GT1 TNFAIP8L1-201ENST00000327473 3814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
KLHL22Q53GT1 YIF1B-201ENST00000329420 964 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
KLHL22Q53GT1 GLIPR1L1-202ENST00000378695 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
KLHL22Q53GT1 RFXANK-202ENST00000392324 1059 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
KLHL22Q53GT1 NUDT1-205ENST00000397048 783 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
KLHL22Q53GT1 AC023274.1-201ENST00000418278 595 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
KLHL22Q53GT1 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC13.54□□□□□ -0.24
KLHL22Q53GT1 MKNK2P1-201ENST00000437526 628 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
KLHL22Q53GT1 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
KLHL22Q53GT1 TNFAIP8L1-202ENST00000536716 3845 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
KLHL22Q53GT1 AC092865.5-201ENST00000545435 363 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
KLHL22Q53GT1 DCTPP1-203ENST00000567983 801 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
KLHL22Q53GT1 KLK15-203ENST00000596931 692 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
KLHL22Q53GT1 PCDHGC3-204ENST00000617222 731 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
KLHL22Q53GT1 RAB9A-203ENST00000618931 737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
KLHL22Q53GT1 C20orf181-201ENST00000623918 480 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
KLHL22Q53GT1 XPO7-201ENST00000252512 4861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
KLHL22Q53GT1 KRT75-201ENST00000252245 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
KLHL22Q53GT1 ITGB3-201ENST00000559488 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
KLHL22Q53GT1 TMEM231-207ENST00000568377 2920 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
KLHL22Q53GT1 GOLGA8R-201ENST00000327271 1896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
KLHL22Q53GT1 SLC35D1-201ENST00000235345 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
KLHL22Q53GT1 PRSS16-203ENST00000421826 1949 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
KLHL22Q53GT1 ZNF890P-201ENST00000422060 1352 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
KLHL22Q53GT1 SH3PXD2B-203ENST00000519643 1394 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
KLHL22Q53GT1 ZBED8-202ENST00000523213 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
KLHL22Q53GT1 AC130686.1-201ENST00000622936 2466 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
KLHL22Q53GT1 AL157414.3-201ENST00000624276 1954 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
KLHL22Q53GT1 AC007240.1-201ENST00000641498 1996 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
KLHL22Q53GT1 CABP4-201ENST00000325656 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
KLHL22Q53GT1 KRT4-204ENST00000551956 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
KLHL22Q53GT1 C4B-AS1-205ENST00000415626 2095 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
KLHL22Q53GT1 C4A-AS1-204ENST00000458633 2095 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
KLHL22Q53GT1 ABCA2-203ENST00000371605 8151 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
KLHL22Q53GT1 TGM6-202ENST00000381423 2158 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
KLHL22Q53GT1 KIAA0141-201ENST00000194118 2203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
KLHL22Q53GT1 NPR1-202ENST00000368680 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
KLHL22Q53GT1 FAM219A-203ENST00000379080 3591 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
KLHL22Q53GT1 HEPACAM-201ENST00000298251 3602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
KLHL22Q53GT1 FAAP100-201ENST00000327787 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
KLHL22Q53GT1 OLA1-202ENST00000344357 1656 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
KLHL22Q53GT1 TBC1D22A-201ENST00000337137 3787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
KLHL22Q53GT1 DOK1-202ENST00000340004 1722 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
KLHL22Q53GT1 MSTO1-201ENST00000245564 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
KLHL22Q53GT1 CHRNA3-201ENST00000326828 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
KLHL22Q53GT1 LSS-211ENST00000522411 2523 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
KLHL22Q53GT1 P2RX3-201ENST00000263314 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
KLHL22Q53GT1 CLCN6-201ENST00000312413 5631 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
KLHL22Q53GT1 SLC38A4-201ENST00000266579 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
KLHL22Q53GT1 ZNF747-202ENST00000395094 3504 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
KLHL22Q53GT1 TARS2-203ENST00000369054 1998 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
KLHL22Q53GT1 KIAA0895L-201ENST00000290881 3550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
KLHL22Q53GT1 TMEM200A-204ENST00000617887 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
KLHL22Q53GT1 RRAGB-202ENST00000374941 2061 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
KLHL22Q53GT1 PROM2-203ENST00000403131 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
KLHL22Q53GT1 VCX-201ENST00000341408 677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
KLHL22Q53GT1 AKIRIN1-203ENST00000446189 1243 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
KLHL22Q53GT1 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
KLHL22Q53GT1 AC108047.1-201ENST00000457407 404 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
KLHL22Q53GT1 LINC02123-201ENST00000514869 885 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
KLHL22Q53GT1 CDK2AP2-205ENST00000531506 634 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
KLHL22Q53GT1 AC026150.2-201ENST00000564693 1156 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
KLHL22Q53GT1 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
KLHL22Q53GT1 AC026803.2-201ENST00000599784 819 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
KLHL22Q53GT1 RPL23AP53-203ENST00000606975 736 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
KLHL22Q53GT1 AL589739.1-201ENST00000607720 493 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
KLHL22Q53GT1 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
KLHL22Q53GT1 IL11RA-215ENST00000602473 1388 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
KLHL22Q53GT1 MSRB3-202ENST00000355192 4289 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
KLHL22Q53GT1 AC020910.6-201ENST00000623084 1459 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
KLHL22Q53GT1 DXO-203ENST00000375356 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
KLHL22Q53GT1 ALDH3A2-226ENST00000631291 3822 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
KLHL22Q53GT1 SATB2-211ENST00000614512 4972 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
KLHL22Q53GT1 TRPV6-201ENST00000359396 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
KLHL22Q53GT1 AXIN2-201ENST00000307078 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
KLHL22Q53GT1 HES2-201ENST00000377834 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
KLHL22Q53GT1 NOTCH1-201ENST00000277541 9371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
KLHL22Q53GT1 ADK-205ENST00000539909 1866 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
KLHL22Q53GT1 TCHH-202ENST00000614923 6995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
KLHL22Q53GT1 KLHL9-201ENST00000359039 5710 ntAPPRIS P1 BASIC13.53□□□□□ -0.24
KLHL22Q53GT1 APLP2-203ENST00000338167 3270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
KLHL22Q53GT1 FXR1-214ENST00000480918 1996 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.24
KLHL22Q53GT1 SETD6-203ENST00000394266 3423 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
KLHL22Q53GT1 CETN4P-206ENST00000642099 2168 ntBASIC13.52□□□□□ -0.24
KLHL22Q53GT1 HNRNPH1-204ENST00000442819 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
KLHL22Q53GT1 RSPO1-202ENST00000401068 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
KLHL22Q53GT1 MED22-209ENST00000610888 3867 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
KLHL22Q53GT1 HBP1-212ENST00000485846 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.24
KLHL22Q53GT1 ARID3B-206ENST00000622429 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
KLHL22Q53GT1 GET4-202ENST00000407192 4356 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
KLHL22Q53GT1 MRVI1-204ENST00000527509 2686 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
KLHL22Q53GT1 PGLYRP2-201ENST00000292609 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
KLHL22Q53GT1 KBTBD7-201ENST00000379483 4734 ntAPPRIS P1 BASIC13.52□□□□□ -0.24
KLHL22Q53GT1 KCNG4-201ENST00000308251 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.1 ms