Protein–RNA interactions for Protein: Q4ZHG4

FNDC1, Fibronectin type III domain-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,894 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FNDC1Q4ZHG4 TMEM177-202ENST00000401466 1346 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
FNDC1Q4ZHG4 MAGED4B-207ENST00000485287 2618 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
FNDC1Q4ZHG4 PPA2-204ENST00000354147 667 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
FNDC1Q4ZHG4 SPIN2B-203ENST00000374910 725 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
FNDC1Q4ZHG4 ADARB2-AS1-201ENST00000381301 625 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
FNDC1Q4ZHG4 Z97652.1-201ENST00000415176 329 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
FNDC1Q4ZHG4 AC005392.1-201ENST00000419624 500 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
FNDC1Q4ZHG4 PPA2-205ENST00000432483 859 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
FNDC1Q4ZHG4 RN7SL277P-201ENST00000481521 288 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
FNDC1Q4ZHG4 AC137723.1-201ENST00000584705 709 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
FNDC1Q4ZHG4 ZNF350-AS1-202ENST00000600253 577 ntTSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
FNDC1Q4ZHG4 AC103810.10-201ENST00000606504 343 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
FNDC1Q4ZHG4 AL161773.1-201ENST00000624845 863 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
FNDC1Q4ZHG4 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
FNDC1Q4ZHG4 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
FNDC1Q4ZHG4 ACTL7B-201ENST00000374667 2379 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
FNDC1Q4ZHG4 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
FNDC1Q4ZHG4 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
FNDC1Q4ZHG4 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
FNDC1Q4ZHG4 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
FNDC1Q4ZHG4 GOLGA8R-201ENST00000327271 1896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
FNDC1Q4ZHG4 MTFMT-201ENST00000220058 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
FNDC1Q4ZHG4 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
FNDC1Q4ZHG4 CLCN2-201ENST00000265593 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
FNDC1Q4ZHG4 ARPC1A-201ENST00000262942 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
FNDC1Q4ZHG4 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
FNDC1Q4ZHG4 MEGF10-202ENST00000418761 2238 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
FNDC1Q4ZHG4 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
FNDC1Q4ZHG4 UGT8-201ENST00000310836 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
FNDC1Q4ZHG4 MAGOH-202ENST00000371470 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
FNDC1Q4ZHG4 SMIM29-202ENST00000394990 792 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
FNDC1Q4ZHG4 OR8T1P-201ENST00000421347 918 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
FNDC1Q4ZHG4 LINC01563-201ENST00000456235 750 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
FNDC1Q4ZHG4 AL392046.1-202ENST00000457255 521 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
FNDC1Q4ZHG4 SCARNA12-201ENST00000459155 270 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
FNDC1Q4ZHG4 LINC01598-205ENST00000508763 719 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
FNDC1Q4ZHG4 AC073573.1-201ENST00000550908 481 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
FNDC1Q4ZHG4 CR383656.3-201ENST00000551315 183 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
FNDC1Q4ZHG4 SNHG25-202ENST00000582965 278 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
FNDC1Q4ZHG4 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
FNDC1Q4ZHG4 AC100803.3-201ENST00000606664 2961 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
FNDC1Q4ZHG4 CDCP2-201ENST00000371330 2723 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
FNDC1Q4ZHG4 NDRG2-226ENST00000554104 2146 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
FNDC1Q4ZHG4 ATP2A3-206ENST00000397043 3197 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
FNDC1Q4ZHG4 CSAD-202ENST00000379843 2086 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
FNDC1Q4ZHG4 PI16-203ENST00000611814 2083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
FNDC1Q4ZHG4 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
FNDC1Q4ZHG4 HLA-DQB1-202ENST00000399079 1501 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
FNDC1Q4ZHG4 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
FNDC1Q4ZHG4 PHF10-205ENST00000612128 4395 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
FNDC1Q4ZHG4 KRT85-201ENST00000257901 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
FNDC1Q4ZHG4 ADD1-204ENST00000398123 2361 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
FNDC1Q4ZHG4 LINC00905-203ENST00000588838 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
FNDC1Q4ZHG4 POLR1E-202ENST00000377798 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
FNDC1Q4ZHG4 SRPX-205ENST00000538295 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
FNDC1Q4ZHG4 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
FNDC1Q4ZHG4 MARS-233ENST00000628866 2583 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
FNDC1Q4ZHG4 PIP5K1A-202ENST00000368888 2134 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
FNDC1Q4ZHG4 AC012362.1-201ENST00000434906 739 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
FNDC1Q4ZHG4 PTGES3-203ENST00000436399 941 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
FNDC1Q4ZHG4 SMIM6-201ENST00000556126 866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
FNDC1Q4ZHG4 AL132780.4-201ENST00000624870 1135 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
FNDC1Q4ZHG4 EFHC1-227ENST00000637089 2133 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
FNDC1Q4ZHG4 ZNF79-201ENST00000342483 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
FNDC1Q4ZHG4 DIO3OS-208ENST00000556120 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
FNDC1Q4ZHG4 AL390755.1-201ENST00000623716 2027 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
FNDC1Q4ZHG4 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
FNDC1Q4ZHG4 AC138761.4-201ENST00000578881 1514 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.09
FNDC1Q4ZHG4 ZNF174-201ENST00000268655 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
FNDC1Q4ZHG4 GABARAPL1-218ENST00000546017 2294 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
FNDC1Q4ZHG4 RPH3AL-202ENST00000331302 2606 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
FNDC1Q4ZHG4 RTKN-202ENST00000272430 2142 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
FNDC1Q4ZHG4 TMED7-TICAM2-202ENST00000333314 3453 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
FNDC1Q4ZHG4 INHBE-201ENST00000266646 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
FNDC1Q4ZHG4 MIR22HG-201ENST00000334146 1383 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
FNDC1Q4ZHG4 FHL2-206ENST00000408995 1367 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
FNDC1Q4ZHG4 SLC38A6-201ENST00000267488 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
FNDC1Q4ZHG4 KRT82-201ENST00000257974 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
FNDC1Q4ZHG4 FDFT1-224ENST00000618539 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
FNDC1Q4ZHG4 ZNF586-202ENST00000396150 1977 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
FNDC1Q4ZHG4 LINC01107-201ENST00000446979 1975 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
FNDC1Q4ZHG4 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
FNDC1Q4ZHG4 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
FNDC1Q4ZHG4 AC099063.4-201ENST00000641099 1602 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
FNDC1Q4ZHG4 ALDH4A1-205ENST00000538309 1940 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
FNDC1Q4ZHG4 QRICH1-202ENST00000395443 3549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
FNDC1Q4ZHG4 VEGFB-202ENST00000426086 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
FNDC1Q4ZHG4 AC034231.1-201ENST00000507251 537 ntTSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
FNDC1Q4ZHG4 MIR3180-2-201ENST00000581748 88 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
FNDC1Q4ZHG4 RPL18A-204ENST00000599898 491 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
FNDC1Q4ZHG4 MIR6858-201ENST00000620733 67 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
FNDC1Q4ZHG4 FAM103A1-201ENST00000304191 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
FNDC1Q4ZHG4 SGCE-202ENST00000415788 1871 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
FNDC1Q4ZHG4 ST3GAL3-209ENST00000361400 2195 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
FNDC1Q4ZHG4 PDYN-AS1-201ENST00000446562 1802 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
FNDC1Q4ZHG4 TRA2A-202ENST00000392502 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
FNDC1Q4ZHG4 XKRX-202ENST00000468904 2249 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
FNDC1Q4ZHG4 CALD1-222ENST00000495522 2199 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
FNDC1Q4ZHG4 NPHP3-AS1-201ENST00000489343 2957 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
FNDC1Q4ZHG4 RHOXF1P3-203ENST00000640298 2668 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.8 ms