Protein–RNA interactions for Protein: Q499Y3

Putative uncharacterized protein C10orf88-like, humanhuman

Predictions only

Length 187 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q499Y3 EPHB4-210ENST00000616502 3737 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Q499Y3 VSIG10L-201ENST00000335624 3397 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Q499Y3 C15orf59-204ENST00000569673 6573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Q499Y3 THY1-206ENST00000528522 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Q499Y3 CCDC43-203ENST00000588210 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Q499Y3 ST7L-207ENST00000369669 1743 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Q499Y3 TNK2-202ENST00000381916 4223 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Q499Y3 P2RY1-201ENST00000305097 6747 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Q499Y3 LBH-201ENST00000395323 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Q499Y3 GOLGA6L2-201ENST00000312015 1379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Q499Y3 PTPN20-206ENST00000395722 1995 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Q499Y3 TMEM198B-201ENST00000471276 1958 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Q499Y3 SMYD5-202ENST00000389501 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Q499Y3 EXO5-201ENST00000296380 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Q499Y3 G3BP2-202ENST00000359707 4883 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Q499Y3 MAPRE2-201ENST00000300249 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Q499Y3 CPSF7-201ENST00000340437 3695 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Q499Y3 ROPN1L-201ENST00000274134 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Q499Y3 CTRB2-201ENST00000303037 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Q499Y3 HIST3H2A-201ENST00000366695 895 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Q499Y3 TNNC2-201ENST00000372555 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Q499Y3 LRRC37A5P-201ENST00000374304 1103 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Q499Y3 CIB3-202ENST00000379859 467 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Q499Y3 MPV17-203ENST00000380044 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Q499Y3 MPV17-208ENST00000405076 603 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Q499Y3 LINC01067-201ENST00000432575 664 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Q499Y3 TMEM198B-204ENST00000484016 896 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Q499Y3 SLBP-205ENST00000488267 987 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Q499Y3 ATP6V1C1-202ENST00000518738 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Q499Y3 PLXNB3-209ENST00000538966 6377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Q499Y3 TAPBPL-205ENST00000544021 772 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Q499Y3 AP005233.2-201ENST00000561588 372 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Q499Y3 ZPBP2-204ENST00000584588 1277 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Q499Y3 AC007193.2-201ENST00000596807 472 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Q499Y3 SUGP2-215ENST00000601879 5546 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Q499Y3 ANKMY1-210ENST00000406958 2396 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Q499Y3 CICP17-201ENST00000418553 2377 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Q499Y3 ZC2HC1C-202ENST00000439583 1509 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Q499Y3 SORCS1-201ENST00000263054 7272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Q499Y3 SPPL3-201ENST00000353487 4148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Q499Y3 LONP1-202ENST00000540670 3002 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Q499Y3 RASGEF1A-202ENST00000374459 3264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Q499Y3 KRT8P14-201ENST00000414254 1442 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Q499Y3 IMPDH1-204ENST00000419067 2431 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Q499Y3 AC009133.1-201ENST00000569981 2449 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Q499Y3 BANP-217ENST00000479780 1551 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Q499Y3 PRR12-203ENST00000615927 4479 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Q499Y3 ITGB4-203ENST00000450894 5645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Q499Y3 CHPF2-204ENST00000495645 2709 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Q499Y3 ELAC2-201ENST00000338034 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Q499Y3 SUCO-201ENST00000263688 5556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Q499Y3 AC020910.6-201ENST00000623084 1459 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Q499Y3 BPI-201ENST00000262865 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Q499Y3 TYK2-210ENST00000529370 3176 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Q499Y3 CDC37-201ENST00000222005 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Q499Y3 OPRL1-201ENST00000336866 3321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Q499Y3 LAMB2-202ENST00000418109 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Q499Y3 SLC37A4-216ENST00000538950 2032 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Q499Y3 LDOC1-201ENST00000370526 1381 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Q499Y3 INHBE-201ENST00000266646 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Q499Y3 HNRNPR-204ENST00000427764 1788 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Q499Y3 CAMKK2-209ENST00000446440 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Q499Y3 AC012617.1-204ENST00000586340 2305 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Q499Y3 CMTR2-201ENST00000338099 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Q499Y3 ACTL8-202ENST00000617065 1670 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Q499Y3 NUP210-201ENST00000254508 7193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Q499Y3 C2orf40-201ENST00000238044 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Q499Y3 C11orf52-201ENST00000278601 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Q499Y3 KDM1B-201ENST00000297792 3811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Q499Y3 MRPL58-201ENST00000301585 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Q499Y3 SLC19A1-201ENST00000311124 3811 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Q499Y3 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Q499Y3 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Q499Y3 RETN-202ENST00000381324 249 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Q499Y3 TAS2R41-201ENST00000408916 924 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Q499Y3 AL356441.1-201ENST00000452618 492 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Q499Y3 C11orf98-202ENST00000525675 405 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Q499Y3 ZNF890P-202ENST00000530367 1156 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Q499Y3 PXN-AS1-202ENST00000538804 508 ntTSL 4 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Q499Y3 RIMS4-202ENST00000541604 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Q499Y3 AC044860.1-202ENST00000559481 777 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Q499Y3 AC092337.1-201ENST00000568699 1129 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Q499Y3 AC107896.1-201ENST00000593212 548 ntTSL 4 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Q499Y3 UPK1A-204ENST00000617999 1268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Q499Y3 AL158212.4-201ENST00000624062 1286 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Q499Y3 RAB34-223ENST00000636154 730 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Q499Y3 MED15-203ENST00000382974 2235 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Q499Y3 PITRM1-206ENST00000451104 3183 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Q499Y3 AC005899.8-201ENST00000625127 3153 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Q499Y3 CLASRP-204ENST00000544944 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Q499Y3 CELF1-201ENST00000310513 4583 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Q499Y3 SLFNL1-204ENST00000372613 2654 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Q499Y3 PBXIP1-202ENST00000368463 3212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Q499Y3 LIMS1-215ENST00000544547 4461 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Q499Y3 AGAP1-201ENST00000304032 10832 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Q499Y3 TMEM47-201ENST00000275954 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Q499Y3 ARMC5-205ENST00000563544 3549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Q499Y3 ZNF362-205ENST00000539719 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Q499Y3 KRT4-204ENST00000551956 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Q499Y3 GLYCTK-207ENST00000477382 1304 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.6 ms