Protein–RNA interactions for Protein: Q3LI83

KRTAP24-1, Keratin-associated protein 24-1, humanhuman

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP24-1Q3LI83 HCG27-201ENST00000383331 1720 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
KRTAP24-1Q3LI83 GHDC-207ENST00000587427 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
KRTAP24-1Q3LI83 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
KRTAP24-1Q3LI83 NOP14-AS1-201ENST00000503709 1616 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
KRTAP24-1Q3LI83 MS4A15-201ENST00000337911 1536 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
KRTAP24-1Q3LI83 SMPDL3B-201ENST00000373888 1548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
KRTAP24-1Q3LI83 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
KRTAP24-1Q3LI83 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
KRTAP24-1Q3LI83 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
KRTAP24-1Q3LI83 ZNF586-202ENST00000396150 1977 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
KRTAP24-1Q3LI83 PAPLN-202ENST00000340738 5834 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
KRTAP24-1Q3LI83 CASQ1-201ENST00000368078 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
KRTAP24-1Q3LI83 FBN2-205ENST00000508989 4987 ntTSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
KRTAP24-1Q3LI83 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
KRTAP24-1Q3LI83 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.59
KRTAP24-1Q3LI83 ZNF346-202ENST00000503039 2774 ntTSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.59
KRTAP24-1Q3LI83 RFK-201ENST00000376736 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.59
KRTAP24-1Q3LI83 SVOPL-203ENST00000421622 1653 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
KRTAP24-1Q3LI83 TNF-208ENST00000449264 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
KRTAP24-1Q3LI83 RAB37-216ENST00000613645 1653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
KRTAP24-1Q3LI83 LATS1-202ENST00000392273 2567 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
KRTAP24-1Q3LI83 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
KRTAP24-1Q3LI83 ACIN1-205ENST00000457657 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
KRTAP24-1Q3LI83 IKBKE-204ENST00000584998 2487 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
KRTAP24-1Q3LI83 RAB31-207ENST00000578921 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
KRTAP24-1Q3LI83 F10-203ENST00000409306 1450 ntTSL 3 BASIC11.33□□□□□ -0.6
KRTAP24-1Q3LI83 PAIP2-202ENST00000394795 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
KRTAP24-1Q3LI83 AL121757.1-201ENST00000430097 1836 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
KRTAP24-1Q3LI83 KRT8P28-201ENST00000433288 1390 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
KRTAP24-1Q3LI83 COL4A1-204ENST00000543140 2547 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
KRTAP24-1Q3LI83 CSNK1A1L-201ENST00000379800 2406 ntAPPRIS P1 BASIC11.33□□□□□ -0.6
KRTAP24-1Q3LI83 C16orf58-211ENST00000570164 2783 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
KRTAP24-1Q3LI83 SHISA6-203ENST00000432116 7518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
KRTAP24-1Q3LI83 PCBD1-201ENST00000299299 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
KRTAP24-1Q3LI83 JTB-202ENST00000356648 1040 ntTSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
KRTAP24-1Q3LI83 DYNLT1-201ENST00000367085 774 ntTSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
KRTAP24-1Q3LI83 TREM2-202ENST00000373113 1044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
KRTAP24-1Q3LI83 GEMIN8P4-201ENST00000380526 729 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
KRTAP24-1Q3LI83 S100A13-203ENST00000392623 579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
KRTAP24-1Q3LI83 SIX3-AS1-201ENST00000419364 844 ntTSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
KRTAP24-1Q3LI83 KRT18P4-201ENST00000422599 1288 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
KRTAP24-1Q3LI83 BX248123.1-201ENST00000429070 606 ntTSL 3 BASIC11.33□□□□□ -0.6
KRTAP24-1Q3LI83 ASS1P2-201ENST00000439895 1223 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
KRTAP24-1Q3LI83 AL157392.3-204ENST00000440878 397 ntTSL 3 BASIC11.33□□□□□ -0.6
KRTAP24-1Q3LI83 RHOQP2-201ENST00000449922 579 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
KRTAP24-1Q3LI83 Z82249.1-201ENST00000453866 568 ntTSL 4 BASIC11.33□□□□□ -0.6
KRTAP24-1Q3LI83 RN7SL767P-201ENST00000493013 295 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
KRTAP24-1Q3LI83 URB1-AS1-201ENST00000534991 831 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
KRTAP24-1Q3LI83 RPL18-205ENST00000549273 1036 ntTSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
KRTAP24-1Q3LI83 KRT8P2-201ENST00000556193 944 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
KRTAP24-1Q3LI83 PLA2G15-209ENST00000566188 1203 ntTSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
KRTAP24-1Q3LI83 COX5A-205ENST00000568517 582 ntTSL 3 BASIC11.33□□□□□ -0.6
KRTAP24-1Q3LI83 GAS7-216ENST00000583882 553 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
KRTAP24-1Q3LI83 CTSH-218ENST00000615999 972 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
KRTAP24-1Q3LI83 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC11.33□□□□□ -0.6
KRTAP24-1Q3LI83 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
KRTAP24-1Q3LI83 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
KRTAP24-1Q3LI83 ADGRB2-203ENST00000398538 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
KRTAP24-1Q3LI83 AL591122.2-201ENST00000624125 1853 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
KRTAP24-1Q3LI83 KIR3DL2-201ENST00000270442 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
KRTAP24-1Q3LI83 NIT1-204ENST00000392190 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC11.33□□□□□ -0.6
KRTAP24-1Q3LI83 RAB5B-202ENST00000448789 1530 ntTSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
KRTAP24-1Q3LI83 PGBD2-201ENST00000329291 2136 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
KRTAP24-1Q3LI83 FOXN1-203ENST00000579795 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
KRTAP24-1Q3LI83 TOMM40-207ENST00000592434 3415 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
KRTAP24-1Q3LI83 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
KRTAP24-1Q3LI83 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
KRTAP24-1Q3LI83 CT55-201ENST00000276241 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
KRTAP24-1Q3LI83 BFAR-203ENST00000562442 1414 ntTSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
KRTAP24-1Q3LI83 BMP1-201ENST00000306349 2626 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
KRTAP24-1Q3LI83 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
KRTAP24-1Q3LI83 C21orf33-201ENST00000291577 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
KRTAP24-1Q3LI83 DZIP1-203ENST00000361396 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
KRTAP24-1Q3LI83 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
KRTAP24-1Q3LI83 CBSL-201ENST00000398168 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
KRTAP24-1Q3LI83 PRMT2-216ENST00000621201 1301 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
KRTAP24-1Q3LI83 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
KRTAP24-1Q3LI83 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
KRTAP24-1Q3LI83 GINS2-201ENST00000253462 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
KRTAP24-1Q3LI83 PRAG1-202ENST00000622241 4639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
KRTAP24-1Q3LI83 ICMT-201ENST00000343813 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
KRTAP24-1Q3LI83 ZDHHC6-201ENST00000369404 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
KRTAP24-1Q3LI83 LRRC6-205ENST00000519595 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
KRTAP24-1Q3LI83 RSPO1-203ENST00000612451 2463 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
KRTAP24-1Q3LI83 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
KRTAP24-1Q3LI83 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
KRTAP24-1Q3LI83 MEG9-201ENST00000429368 2638 ntTSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
KRTAP24-1Q3LI83 SPG21-203ENST00000433215 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
KRTAP24-1Q3LI83 P2RX5-207ENST00000551178 1863 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
KRTAP24-1Q3LI83 FKBP4P8-201ENST00000610931 1369 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
KRTAP24-1Q3LI83 RTN1-209ENST00000611068 2647 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
KRTAP24-1Q3LI83 ATG9B-212ENST00000639579 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
KRTAP24-1Q3LI83 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
KRTAP24-1Q3LI83 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
KRTAP24-1Q3LI83 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
KRTAP24-1Q3LI83 VEGFA-201ENST00000230480 993 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
KRTAP24-1Q3LI83 TMEM216-202ENST00000398979 908 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
KRTAP24-1Q3LI83 EIF4E2-205ENST00000409394 604 ntTSL 3 BASIC11.32□□□□□ -0.6
KRTAP24-1Q3LI83 AC104961.1-201ENST00000427605 771 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
KRTAP24-1Q3LI83 EEF1DP5-201ENST00000431410 772 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 145.4 ms