Protein–RNA interactions for Protein: Q2WGJ6

KLHL38, Kelch-like protein 38, humanhuman

Predictions only

Length 581 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL38Q2WGJ6 MSH5-201ENST00000375703 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
KLHL38Q2WGJ6 ZNF133-203ENST00000377671 2701 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
KLHL38Q2WGJ6 VPS9D1-201ENST00000389386 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
KLHL38Q2WGJ6 BTBD10-208ENST00000528120 1662 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
KLHL38Q2WGJ6 GCFC2-211ENST00000541687 4318 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
KLHL38Q2WGJ6 IGHA1-202ENST00000641837 1310 ntAPPRIS P5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
KLHL38Q2WGJ6 AL589740.1-203ENST00000433637 1984 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
KLHL38Q2WGJ6 TRIM13-201ENST00000356017 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
KLHL38Q2WGJ6 SRSF2-203ENST00000392485 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
KLHL38Q2WGJ6 COX6A1-201ENST00000229379 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
KLHL38Q2WGJ6 C6orf99-202ENST00000367073 769 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
KLHL38Q2WGJ6 SUN1-204ENST00000403868 978 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
KLHL38Q2WGJ6 AC139149.1-202ENST00000442532 783 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
KLHL38Q2WGJ6 BX322559.1-201ENST00000456613 319 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
KLHL38Q2WGJ6 RCHY1-210ENST00000513257 759 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
KLHL38Q2WGJ6 REEP4-207ENST00000523293 913 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
KLHL38Q2WGJ6 C11orf98-202ENST00000525675 405 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
KLHL38Q2WGJ6 ARL16-202ENST00000570561 768 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
KLHL38Q2WGJ6 AC129507.1-201ENST00000570711 1013 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
KLHL38Q2WGJ6 AC011491.2-201ENST00000599584 447 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
KLHL38Q2WGJ6 RNA5-8SN1-201ENST00000610460 153 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
KLHL38Q2WGJ6 RNA5-8SN5-202ENST00000612463 153 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
KLHL38Q2WGJ6 RNA5-8SN4-201ENST00000613359 153 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
KLHL38Q2WGJ6 RNA5-8SN5-201ENST00000619471 153 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
KLHL38Q2WGJ6 AL158212.4-201ENST00000624062 1286 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
KLHL38Q2WGJ6 RPARP-AS1-202ENST00000492465 1556 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
KLHL38Q2WGJ6 CDH16-202ENST00000394055 2821 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
KLHL38Q2WGJ6 CNOT9-201ENST00000273064 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
KLHL38Q2WGJ6 AL137783.1-201ENST00000623494 1896 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
KLHL38Q2WGJ6 ANKRD18A-201ENST00000399703 4041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
KLHL38Q2WGJ6 P2RX5-208ENST00000552050 1536 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
KLHL38Q2WGJ6 YTHDF3-205ENST00000539294 5163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
KLHL38Q2WGJ6 TDRD12-202ENST00000444215 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
KLHL38Q2WGJ6 PLA2G16-201ENST00000323646 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
KLHL38Q2WGJ6 XRCC3-211ENST00000555055 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
KLHL38Q2WGJ6 GOLGA2P7-207ENST00000559668 4253 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
KLHL38Q2WGJ6 LDHA-203ENST00000379412 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
KLHL38Q2WGJ6 SH3PXD2B-203ENST00000519643 1394 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
KLHL38Q2WGJ6 RPS9-205ENST00000402367 1617 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
KLHL38Q2WGJ6 ATP6AP2-213ENST00000636251 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
KLHL38Q2WGJ6 SLC38A9-202ENST00000396865 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
KLHL38Q2WGJ6 AC090099.1-203ENST00000527059 2945 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
KLHL38Q2WGJ6 FRZB-201ENST00000295113 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
KLHL38Q2WGJ6 CHRNB4-201ENST00000261751 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
KLHL38Q2WGJ6 STAC3-206ENST00000554578 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
KLHL38Q2WGJ6 FP565260.2-201ENST00000623476 1599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
KLHL38Q2WGJ6 SEMA4D-204ENST00000420101 1837 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
KLHL38Q2WGJ6 YWHAE-208ENST00000571732 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
KLHL38Q2WGJ6 PNPLA3-201ENST00000216180 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
KLHL38Q2WGJ6 RPS5-201ENST00000196551 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
KLHL38Q2WGJ6 FTH1-201ENST00000273550 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
KLHL38Q2WGJ6 EIF5A-201ENST00000336452 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
KLHL38Q2WGJ6 CKS1B-202ENST00000368436 820 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
KLHL38Q2WGJ6 ATP1A1-AS1-202ENST00000369492 1011 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
KLHL38Q2WGJ6 LINC00229-201ENST00000443783 500 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
KLHL38Q2WGJ6 UGT1A2P-201ENST00000454886 866 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
KLHL38Q2WGJ6 FTH1-202ENST00000526640 786 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
KLHL38Q2WGJ6 PXN-AS1-204ENST00000542265 854 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
KLHL38Q2WGJ6 LITAF-218ENST00000576036 603 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.25■□□□□ 0.03
KLHL38Q2WGJ6 AC092070.4-201ENST00000599803 507 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
KLHL38Q2WGJ6 GRIA3-205ENST00000611689 936 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
KLHL38Q2WGJ6 AC004790.1-201ENST00000612686 536 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
KLHL38Q2WGJ6 LINC01002-214ENST00000632102 561 ntTSL 4 BASIC15.25■□□□□ 0.03
KLHL38Q2WGJ6 HNRNPLL-205ENST00000409636 3980 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
KLHL38Q2WGJ6 DDN-201ENST00000421952 3749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
KLHL38Q2WGJ6 CASC2-202ENST00000426021 3232 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
KLHL38Q2WGJ6 GPN2-202ENST00000374135 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
KLHL38Q2WGJ6 PLCB3-202ENST00000325234 3946 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
KLHL38Q2WGJ6 BRAT1-201ENST00000340611 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
KLHL38Q2WGJ6 KIAA1257-204ENST00000511438 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
KLHL38Q2WGJ6 SMAD2-202ENST00000356825 10445 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
KLHL38Q2WGJ6 ZNF79-202ENST00000543471 2194 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
KLHL38Q2WGJ6 ZNF79-203ENST00000612342 2192 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
KLHL38Q2WGJ6 SMTN-202ENST00000347557 3130 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
KLHL38Q2WGJ6 PRSS30P-201ENST00000390681 2881 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
KLHL38Q2WGJ6 ASB10-204ENST00000420175 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
KLHL38Q2WGJ6 LMAN2L-201ENST00000264963 2397 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
KLHL38Q2WGJ6 LOXL3-202ENST00000393937 2398 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
KLHL38Q2WGJ6 TDP2-201ENST00000341060 2120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
KLHL38Q2WGJ6 GFRA1-201ENST00000355422 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
KLHL38Q2WGJ6 SELPLG-202ENST00000388962 1613 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
KLHL38Q2WGJ6 FGFR1-202ENST00000335922 4157 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
KLHL38Q2WGJ6 TMPRSS2-202ENST00000398585 3240 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
KLHL38Q2WGJ6 NRDC-201ENST00000352171 3691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
KLHL38Q2WGJ6 FAM219A-209ENST00000445726 3644 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
KLHL38Q2WGJ6 SLC27A3-201ENST00000271857 3351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
KLHL38Q2WGJ6 CLEC16A-202ENST00000409552 3365 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
KLHL38Q2WGJ6 NSUN5P1-204ENST00000428392 1562 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
KLHL38Q2WGJ6 KYAT1-205ENST00000436267 2487 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
KLHL38Q2WGJ6 WSCD1-202ENST00000539421 2665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
KLHL38Q2WGJ6 ACY3-201ENST00000255082 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
KLHL38Q2WGJ6 WWC2-201ENST00000403733 8826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
KLHL38Q2WGJ6 SPATA33-210ENST00000611218 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
KLHL38Q2WGJ6 ZNF618-201ENST00000288466 9109 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
KLHL38Q2WGJ6 MKS1-202ENST00000393119 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
KLHL38Q2WGJ6 VWCE-202ENST00000335613 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
KLHL38Q2WGJ6 PNKD-201ENST00000248451 758 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
KLHL38Q2WGJ6 KRTAP19-7-201ENST00000334849 440 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
KLHL38Q2WGJ6 TSPAN4-201ENST00000346501 882 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
KLHL38Q2WGJ6 ABCG1-205ENST00000398449 2998 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.4 ms