Protein–RNA interactions for Protein: Q17RM4

CCDC142, Coiled-coil domain-containing protein 142, humanhuman

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Length 750 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC142Q17RM4 AC011447.3-204ENST00000585498 883 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCDC142Q17RM4 AC004637.1-201ENST00000586675 482 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCDC142Q17RM4 AL354740.1-203ENST00000593917 424 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCDC142Q17RM4 KLK3-211ENST00000597483 810 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCDC142Q17RM4 AL096828.3-201ENST00000615354 462 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
CCDC142Q17RM4 TAF11-201ENST00000361288 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCDC142Q17RM4 C15orf52-202ENST00000397536 4717 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCDC142Q17RM4 KRT15-201ENST00000254043 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCDC142Q17RM4 ADCYAP1R1-204ENST00000409489 1761 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCDC142Q17RM4 MBD1-217ENST00000588937 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCDC142Q17RM4 AGAP4-208ENST00000618171 2387 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCDC142Q17RM4 CCHCR1-208ENST00000451521 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCDC142Q17RM4 LIMK2-204ENST00000406516 2657 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCDC142Q17RM4 ELAVL3-201ENST00000359227 4729 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCDC142Q17RM4 STAT1-203ENST00000392323 2723 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCDC142Q17RM4 MSTO1-201ENST00000245564 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCDC142Q17RM4 SF1-209ENST00000433274 2317 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCDC142Q17RM4 DNAH14-204ENST00000366849 2215 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCDC142Q17RM4 KCTD1-203ENST00000417602 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCDC142Q17RM4 AL109910.1-201ENST00000452071 1330 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCDC142Q17RM4 PIDD1-202ENST00000411829 2886 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCDC142Q17RM4 SATB2-205ENST00000443023 6194 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCDC142Q17RM4 TNXB-208ENST00000611016 6083 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCDC142Q17RM4 SLC32A1-201ENST00000217420 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCDC142Q17RM4 CUX1-211ENST00000546411 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCDC142Q17RM4 XRRA1-202ENST00000340360 5681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCDC142Q17RM4 ACSF2-202ENST00000427954 2251 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCDC142Q17RM4 MTCL1-203ENST00000400050 6042 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCDC142Q17RM4 TDRD10-201ENST00000368480 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCDC142Q17RM4 SCLY-202ENST00000409736 1774 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCDC142Q17RM4 UBTF-204ENST00000436088 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCDC142Q17RM4 BICD2-202ENST00000375512 4636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCDC142Q17RM4 RPP40-202ENST00000380051 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCDC142Q17RM4 CARNMT1-202ENST00000376834 4130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCDC142Q17RM4 NBPF9-207ENST00000615421 5835 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCDC142Q17RM4 FAM149A-202ENST00000356371 2997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCDC142Q17RM4 C9orf116-205ENST00000429260 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCDC142Q17RM4 Z93015.1-201ENST00000451718 390 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
CCDC142Q17RM4 FAM25G-201ENST00000452267 345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCDC142Q17RM4 ANAPC15-208ENST00000538393 867 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCDC142Q17RM4 NDUFC1-210ENST00000539387 725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCDC142Q17RM4 AL031600.1-201ENST00000563610 570 ntTSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCDC142Q17RM4 EEF1DP1-201ENST00000585891 896 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
CCDC142Q17RM4 AC138696.2-201ENST00000607376 223 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
CCDC142Q17RM4 PRKN-211ENST00000615065 261 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCDC142Q17RM4 MIR6869-201ENST00000619434 62 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
CCDC142Q17RM4 CACNA2D2-203ENST00000423994 5329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCDC142Q17RM4 ZBTB17-201ENST00000375733 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCDC142Q17RM4 CNTFR-204ENST00000610543 1926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCDC142Q17RM4 RASGRF2-206ENST00000638442 2842 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCDC142Q17RM4 SF3B4-201ENST00000271628 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCDC142Q17RM4 TBC1D3G-201ENST00000569055 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCDC142Q17RM4 TBC1D3H-201ENST00000610350 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCDC142Q17RM4 TBC1D3L-202ENST00000617678 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCDC142Q17RM4 PKN2-201ENST00000316005 2632 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCDC142Q17RM4 PSD-201ENST00000020673 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCDC142Q17RM4 TSPY26P-202ENST00000565928 3884 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
CCDC142Q17RM4 MSH5-203ENST00000375750 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCDC142Q17RM4 BCAR1-202ENST00000393420 2667 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCDC142Q17RM4 SLC4A2-214ENST00000485713 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCDC142Q17RM4 AL928970.1-201ENST00000422679 2923 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCDC142Q17RM4 HOXA-AS2-202ENST00000517635 2455 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCDC142Q17RM4 MKS1-202ENST00000393119 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCDC142Q17RM4 SCAMP4-202ENST00000409472 2394 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCDC142Q17RM4 AC009053.1-204ENST00000429810 2355 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCDC142Q17RM4 NORAD-201ENST00000565493 5339 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
CCDC142Q17RM4 LINC01205-202ENST00000497996 1493 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCDC142Q17RM4 MRPS17-201ENST00000285298 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCDC142Q17RM4 AP4M1-201ENST00000359593 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCDC142Q17RM4 AP4M1-206ENST00000429084 1836 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCDC142Q17RM4 GINS3-203ENST00000426538 1728 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCDC142Q17RM4 SEPT8-212ENST00000458488 1726 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCDC142Q17RM4 GCNT7-201ENST00000243913 2064 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCDC142Q17RM4 RN7SKP175-201ENST00000408472 289 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
CCDC142Q17RM4 TAF8-204ENST00000456846 1293 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCDC142Q17RM4 FTLP10-202ENST00000505798 471 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
CCDC142Q17RM4 DERL2-202ENST00000570848 657 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCDC142Q17RM4 DHRS7C-202ENST00000571134 984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCDC142Q17RM4 MIR4525-201ENST00000580000 75 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
CCDC142Q17RM4 AC091271.1-201ENST00000611877 1162 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
CCDC142Q17RM4 LINC00595-217ENST00000635545 549 ntTSL 4 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCDC142Q17RM4 LRRTM1-201ENST00000295057 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCDC142Q17RM4 SLC22A7-202ENST00000372585 2555 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCDC142Q17RM4 TMEM40-204ENST00000435218 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCDC142Q17RM4 P2RX5-208ENST00000552050 1536 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCDC142Q17RM4 ZNF750-202ENST00000572562 1513 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCDC142Q17RM4 MUM1-201ENST00000415183 2837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCDC142Q17RM4 ACSL1-208ENST00000507295 2490 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCDC142Q17RM4 HTR3E-202ENST00000415389 2139 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCDC142Q17RM4 A1BG-AS1-204ENST00000595302 2130 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCDC142Q17RM4 FUCA2-201ENST00000002165 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCDC142Q17RM4 API5-203ENST00000455725 2257 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCDC142Q17RM4 ADORA1-201ENST00000309502 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCDC142Q17RM4 TRIM14-201ENST00000341469 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCDC142Q17RM4 CYP1A1-203ENST00000395049 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCDC142Q17RM4 MAU2-201ENST00000262815 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCDC142Q17RM4 TOM1L2-205ENST00000478943 2098 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCDC142Q17RM4 AC140479.7-201ENST00000636301 2332 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
CCDC142Q17RM4 MARCH4-201ENST00000273067 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCDC142Q17RM4 EHF-210ENST00000531794 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
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