Protein–RNA interactions for Protein: Q16849

PTPRN, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase-like N, humanhuman

Predictions only

Length 979 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRNQ16849 UBAP1-201ENST00000297661 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PTPRNQ16849 MAPT-204ENST00000344290 6816 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PTPRNQ16849 KCNJ5-203ENST00000533599 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PTPRNQ16849 HSFX2-201ENST00000598963 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PTPRNQ16849 TMEM117-201ENST00000266534 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PTPRNQ16849 MED16-207ENST00000589119 2772 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
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PTPRNQ16849 PLEKHB2-207ENST00000438882 1460 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
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PTPRNQ16849 TMEM115-201ENST00000266025 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PTPRNQ16849 WIZ-207ENST00000599910 4609 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
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PTPRNQ16849 CDH16-207ENST00000568632 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PTPRNQ16849 MARS-233ENST00000628866 2583 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
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PTPRNQ16849 MAST1-201ENST00000251472 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PTPRNQ16849 LATS2-201ENST00000382592 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PTPRNQ16849 CARD10-201ENST00000251973 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PTPRNQ16849 SLC24A3-201ENST00000328041 3929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PTPRNQ16849 PITPNB-202ENST00000335272 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PTPRNQ16849 HIST3H3-201ENST00000366696 481 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PTPRNQ16849 PEX11B-201ENST00000369306 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PTPRNQ16849 LMO4-201ENST00000370542 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
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PTPRNQ16849 PAK4-205ENST00000593690 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
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PTPRNQ16849 TEX28-203ENST00000617225 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PTPRNQ16849 SHH-201ENST00000297261 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
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PTPRNQ16849 AL022323.1-201ENST00000366110 957 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
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PTPRNQ16849 BUD31-202ENST00000403633 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
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PTPRNQ16849 AC092634.5-202ENST00000587736 928 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PTPRNQ16849 AL358473.2-201ENST00000610411 556 ntTSL 4 BASIC15.29■□□□□ 0.04
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PTPRNQ16849 COPS7B-224ENST00000620578 2500 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
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