Protein–RNA interactions for Protein: Q16822

PCK2, Phosphoenolpyruvate carboxykinase [GTP], mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 640 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCK2Q16822 FAM104B-202ENST00000358460 1179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
PCK2Q16822 SLC18B1-202ENST00000367918 472 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
PCK2Q16822 MORN4-202ENST00000370635 419 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
PCK2Q16822 MAP9-202ENST00000379248 1165 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
PCK2Q16822 PGGT1BP2-201ENST00000398621 1028 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
PCK2Q16822 ZDHHC20-IT1-201ENST00000417513 440 ntTSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
PCK2Q16822 CHCHD7-211ENST00000521831 573 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
PCK2Q16822 AC136475.2-201ENST00000526612 392 ntTSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
PCK2Q16822 ARL2-204ENST00000529384 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
PCK2Q16822 AP002008.1-201ENST00000530283 1155 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
PCK2Q16822 AC084125.2-203ENST00000532766 821 ntTSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
PCK2Q16822 AP006333.1-201ENST00000543817 575 ntTSL 4 BASIC13.21□□□□□ -0.29
PCK2Q16822 FKBP11-208ENST00000550765 1030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
PCK2Q16822 LINC02109-201ENST00000565798 869 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
PCK2Q16822 TPTE2P2-205ENST00000606711 505 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
PCK2Q16822 FOLR3-204ENST00000611028 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
PCK2Q16822 AJ011932.1-201ENST00000621707 465 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
PCK2Q16822 AC005252.2-201ENST00000624630 1141 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
PCK2Q16822 ZNF846-201ENST00000397902 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
PCK2Q16822 KCNN2-201ENST00000264773 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
PCK2Q16822 PPIL6-202ENST00000424445 4031 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
PCK2Q16822 CASP2-207ENST00000619992 4006 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
PCK2Q16822 KCNC1-201ENST00000265969 4295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
PCK2Q16822 ZNF664-202ENST00000392404 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
PCK2Q16822 PNPLA6-202ENST00000414982 4522 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
PCK2Q16822 USP4-203ENST00000415188 1454 ntTSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.3
PCK2Q16822 AC003102.2-201ENST00000589195 1469 ntBASIC13.21□□□□□ -0.3
PCK2Q16822 RET-201ENST00000340058 4149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
PCK2Q16822 ABR-205ENST00000544583 5595 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.3
PCK2Q16822 KIF3C-201ENST00000264712 5344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
PCK2Q16822 ILF2-205ENST00000615950 1906 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.3
PCK2Q16822 FLII-201ENST00000327031 4338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
PCK2Q16822 ERLIN2-205ENST00000518586 2623 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.3
PCK2Q16822 GATA3-202ENST00000379328 3078 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
PCK2Q16822 MTMR6-201ENST00000381801 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
PCK2Q16822 SELPLG-202ENST00000388962 1613 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
PCK2Q16822 CEP295NL-201ENST00000322630 2090 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
PCK2Q16822 PDE3B-202ENST00000455098 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
PCK2Q16822 TDH-201ENST00000525246 1357 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
PCK2Q16822 PPFIA3-203ENST00000602351 4341 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
PCK2Q16822 GTF2IRD1-205ENST00000476977 5868 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
PCK2Q16822 POU6F1-208ENST00000550824 2664 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
PCK2Q16822 HSD17B6-205ENST00000554643 1751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
PCK2Q16822 PHLDB2-203ENST00000412622 5996 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
PCK2Q16822 EIF3J-AS1-201ENST00000313807 2863 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
PCK2Q16822 SLC35G5-201ENST00000382435 1321 ntAPPRIS P1 BASIC13.2□□□□□ -0.3
PCK2Q16822 TMEM132E-203ENST00000631683 4379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
PCK2Q16822 NMUR1-201ENST00000305141 3298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
PCK2Q16822 SEZ6-203ENST00000360295 4306 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
PCK2Q16822 PDHX-201ENST00000227868 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
PCK2Q16822 DMTN-201ENST00000265800 2554 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
PCK2Q16822 DMTN-207ENST00000517305 2551 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
PCK2Q16822 PHF14-215ENST00000634607 3407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
PCK2Q16822 LDHA-203ENST00000379412 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
PCK2Q16822 UMODL1-AS1-201ENST00000329015 2141 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
PCK2Q16822 AC087499.6-201ENST00000411576 835 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
PCK2Q16822 AC007319.1-202ENST00000412276 829 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
PCK2Q16822 BAX-206ENST00000415969 540 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
PCK2Q16822 THPO-202ENST00000421442 1132 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
PCK2Q16822 PRAP1-201ENST00000433452 971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
PCK2Q16822 CR589904.1-201ENST00000437830 732 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
PCK2Q16822 AC087294.1-202ENST00000439136 487 ntTSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
PCK2Q16822 GALT-202ENST00000450095 1280 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
PCK2Q16822 CXorf40A-211ENST00000450602 1204 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
PCK2Q16822 TIMM17B-208ENST00000495490 939 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
PCK2Q16822 AC026774.1-201ENST00000503652 691 ntTSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
PCK2Q16822 LINC01336-202ENST00000506086 479 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
PCK2Q16822 SERBP1P5-201ENST00000510079 1181 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
PCK2Q16822 HNRNPA1P13-201ENST00000510646 963 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
PCK2Q16822 AC012531.3-201ENST00000513209 777 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
PCK2Q16822 NUBP2-208ENST00000565987 1049 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
PCK2Q16822 HCFC1R1-203ENST00000572355 610 ntTSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
PCK2Q16822 AC087294.1-201ENST00000580291 1152 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
PCK2Q16822 INO80C-206ENST00000586489 594 ntTSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
PCK2Q16822 AC133539.2-201ENST00000604757 467 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
PCK2Q16822 HIPK3-203ENST00000456517 7399 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
PCK2Q16822 MTA1-202ENST00000405646 2709 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
PCK2Q16822 SLC6A20-202ENST00000358525 5423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
PCK2Q16822 ATP6AP2-213ENST00000636251 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
PCK2Q16822 AC104452.1-203ENST00000636166 2266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
PCK2Q16822 ZFYVE28-201ENST00000290974 4131 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
PCK2Q16822 C12orf73-207ENST00000549478 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
PCK2Q16822 NEU3-206ENST00000532963 1643 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
PCK2Q16822 SAFB-201ENST00000292123 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
PCK2Q16822 CUX1-215ENST00000556210 4044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
PCK2Q16822 MAOB-201ENST00000378069 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
PCK2Q16822 YIPF3-202ENST00000372422 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
PCK2Q16822 PSMD13-203ENST00000431206 1591 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
PCK2Q16822 TDG-209ENST00000544861 1387 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
PCK2Q16822 SLC25A3-217ENST00000552981 1351 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
PCK2Q16822 NUP50-201ENST00000347635 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
PCK2Q16822 R3HDM2P2-201ENST00000401880 2116 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
PCK2Q16822 CALD1-206ENST00000424922 2124 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
PCK2Q16822 CYP1A1-207ENST00000567032 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
PCK2Q16822 PIK3CG-201ENST00000359195 5377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
PCK2Q16822 SELPLG-201ENST00000228463 1704 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
PCK2Q16822 INSC-208ENST00000530161 1702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
PCK2Q16822 BRD1-205ENST00000457780 4997 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
PCK2Q16822 ZDHHC11B-204ENST00000622126 1301 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
PCK2Q16822 PPM1B-205ENST00000409432 3025 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
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