Protein–RNA interactions for Protein: Q16740

CLPP, ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit, mitochondrial, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 277 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLPPQ16740 IGHA2-202ENST00000497872 1320 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CLPPQ16740 FRA10AC1-201ENST00000359204 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CLPPQ16740 PPP5D1-201ENST00000414155 1882 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CLPPQ16740 MCM4-201ENST00000262105 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CLPPQ16740 SUPT20HL2-201ENST00000486479 2409 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
CLPPQ16740 AC012485.3-201ENST00000637634 2424 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CLPPQ16740 NDRG2-202ENST00000298687 2122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CLPPQ16740 VSIG2-201ENST00000326621 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CLPPQ16740 PSME1-202ENST00000382708 1136 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CLPPQ16740 TXNRD3NB-202ENST00000383572 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CLPPQ16740 SEPT12-202ENST00000396693 1156 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CLPPQ16740 FNTAP2-201ENST00000430308 634 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
CLPPQ16740 NME2-204ENST00000503064 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CLPPQ16740 ORAOV1-211ENST00000542341 775 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CLPPQ16740 RNF41-210ENST00000552244 716 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CLPPQ16740 AL163636.1-201ENST00000554286 915 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CLPPQ16740 C15orf40-211ENST00000565712 559 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CLPPQ16740 MIR3619-201ENST00000579667 83 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
CLPPQ16740 AC008825.2-201ENST00000603374 718 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
CLPPQ16740 LRWD1-209ENST00000626402 138 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CLPPQ16740 AC100757.4-201ENST00000626934 759 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
CLPPQ16740 AC018735.1-201ENST00000437208 1502 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
CLPPQ16740 GFAP-225ENST00000638281 2099 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CLPPQ16740 RBPMS-202ENST00000320203 3110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CLPPQ16740 RPH3AL-201ENST00000323434 2809 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CLPPQ16740 ARHGAP9-213ENST00000550288 2818 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CLPPQ16740 NFYC-205ENST00000372654 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CLPPQ16740 SLAIN1-216ENST00000488699 1461 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CLPPQ16740 SLC1A6-201ENST00000221742 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CLPPQ16740 TSC22D3-201ENST00000315660 2213 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CLPPQ16740 C21orf33-201ENST00000291577 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CLPPQ16740 ACRBP-201ENST00000229243 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CLPPQ16740 IL9R-201ENST00000244174 1944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CLPPQ16740 MPPE1-211ENST00000588072 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CLPPQ16740 RAB37-206ENST00000392615 2655 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CLPPQ16740 SAFB-202ENST00000454510 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CLPPQ16740 C21orf58-204ENST00000397682 2941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CLPPQ16740 ARHGEF40-201ENST00000298694 5919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
CLPPQ16740 TATDN3-202ENST00000366974 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CLPPQ16740 MYADM-205ENST00000391771 3111 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
CLPPQ16740 AC010327.3-201ENST00000591665 1643 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
CLPPQ16740 ARHGAP5-205ENST00000433497 3047 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CLPPQ16740 RHD-204ENST00000417538 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CLPPQ16740 FKBP4P6-201ENST00000457486 1332 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
CLPPQ16740 RPA3-201ENST00000223129 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CLPPQ16740 CYP1B1-AS1-201ENST00000413828 1781 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
CLPPQ16740 AL390038.1-201ENST00000419814 2481 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CLPPQ16740 AL359258.1-201ENST00000438965 2481 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CLPPQ16740 PGA5-201ENST00000312403 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CLPPQ16740 UGGT2-204ENST00000397618 1547 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CLPPQ16740 CDC42BPG-201ENST00000342711 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CLPPQ16740 C11orf52-201ENST00000278601 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CLPPQ16740 YIPF7-201ENST00000332990 937 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
CLPPQ16740 WDR54-201ENST00000348227 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CLPPQ16740 AC011450.1-202ENST00000358234 573 ntTSL 4 BASIC14.48□□□□□ -0.09
CLPPQ16740 VCX3B-201ENST00000381029 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
CLPPQ16740 RPL13A-201ENST00000391857 1181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CLPPQ16740 AC010745.3-201ENST00000439745 415 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
CLPPQ16740 TNFRSF14-AS1-206ENST00000452793 569 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
CLPPQ16740 EIF4HP1-201ENST00000453115 687 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
CLPPQ16740 AC100850.1-201ENST00000506768 649 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
CLPPQ16740 CDKN2AIP-205ENST00000510928 860 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
CLPPQ16740 ADM-202ENST00000524948 584 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
CLPPQ16740 RERG-205ENST00000537647 935 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
CLPPQ16740 AC025154.1-201ENST00000552806 560 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
CLPPQ16740 LGALS3BP-202ENST00000585407 936 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
CLPPQ16740 RPS15-202ENST00000585665 467 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
CLPPQ16740 RPS5-209ENST00000601521 1203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
CLPPQ16740 STPG3-204ENST00000611378 1015 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CLPPQ16740 OR4C6-202ENST00000641251 1058 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
CLPPQ16740 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CLPPQ16740 PML-215ENST00000565898 5393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CLPPQ16740 THAP10-201ENST00000249861 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CLPPQ16740 ALOX15B-204ENST00000572022 2396 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
CLPPQ16740 RER1-203ENST00000378513 3000 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
CLPPQ16740 C1orf228-219ENST00000535358 1685 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
CLPPQ16740 ICMT-201ENST00000343813 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CLPPQ16740 PKD2L2-205ENST00000508638 2333 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CLPPQ16740 LIMS1-202ENST00000338045 1876 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CLPPQ16740 MUTYH-206ENST00000372115 1888 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CLPPQ16740 NFATC2-203ENST00000414705 2974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CLPPQ16740 KCTD15-201ENST00000284006 4918 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CLPPQ16740 SEPT11-206ENST00000505788 2079 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
CLPPQ16740 ASAH1-221ENST00000636128 1608 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
CLPPQ16740 RHOXF1P3-203ENST00000640298 2668 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
CLPPQ16740 HNRNPH1-204ENST00000442819 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
CLPPQ16740 SLC9A7-201ENST00000328306 3838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
CLPPQ16740 EGR2-201ENST00000242480 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
CLPPQ16740 CTSD-201ENST00000236671 2123 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
CLPPQ16740 ZNF519-206ENST00000589498 2117 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
CLPPQ16740 CASC3-201ENST00000264645 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
CLPPQ16740 LUC7L3-202ENST00000393227 2284 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
CLPPQ16740 BTBD10-208ENST00000528120 1662 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
CLPPQ16740 FIS1-201ENST00000223136 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
CLPPQ16740 TMEM254-204ENST00000372277 366 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
CLPPQ16740 PPIE-203ENST00000372830 1198 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
CLPPQ16740 BLCAP-204ENST00000397135 685 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.47□□□□□ -0.09
CLPPQ16740 RN7SKP175-201ENST00000408472 289 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
CLPPQ16740 SUMO1-204ENST00000409181 784 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
CLPPQ16740 SUMO1-207ENST00000409498 779 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
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