Protein–RNA interactions for Protein: Q16478

GRIK5, Glutamate receptor ionotropic, kainate 5, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK5Q16478 TRA2A-202ENST00000392502 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
GRIK5Q16478 ARF6-201ENST00000298316 3865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
GRIK5Q16478 LINGO1-201ENST00000355300 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
GRIK5Q16478 AC018529.2-202ENST00000611482 3087 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
GRIK5Q16478 C7orf31-201ENST00000283905 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
GRIK5Q16478 PTPN5-202ENST00000396166 2299 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
GRIK5Q16478 CDK5RAP3-201ENST00000338399 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
GRIK5Q16478 EGLN3-201ENST00000250457 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
GRIK5Q16478 SYN1-202ENST00000340666 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
GRIK5Q16478 STK40-204ENST00000373132 3621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
GRIK5Q16478 NFYC-215ENST00000456393 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
GRIK5Q16478 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
GRIK5Q16478 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
GRIK5Q16478 CASK-202ENST00000378158 3848 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
GRIK5Q16478 TLE3-215ENST00000559048 2918 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
GRIK5Q16478 CNN1-201ENST00000252456 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
GRIK5Q16478 CTNNBIP1-203ENST00000377263 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
GRIK5Q16478 CCHCR1-208ENST00000451521 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
GRIK5Q16478 MYEF2-215ENST00000610570 2591 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
GRIK5Q16478 FBXO45-202ENST00000440469 3689 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
GRIK5Q16478 RASGEF1B-202ENST00000335927 1756 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
GRIK5Q16478 ARMCX6-207ENST00000538627 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
GRIK5Q16478 BEX2-201ENST00000372674 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
GRIK5Q16478 FKBP2-203ENST00000449942 613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
GRIK5Q16478 ARMCX3-AS1-201ENST00000454228 490 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
GRIK5Q16478 AC008267.1-201ENST00000474858 1069 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
GRIK5Q16478 ZNF124-204ENST00000491356 956 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
GRIK5Q16478 NAA40-206ENST00000542163 1035 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
GRIK5Q16478 LINC01475-201ENST00000548010 766 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
GRIK5Q16478 AC007376.2-201ENST00000556271 540 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
GRIK5Q16478 AC092171.5-201ENST00000608012 942 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
GRIK5Q16478 BX537318.1-201ENST00000608290 1207 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
GRIK5Q16478 RECQL4-209ENST00000617875 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
GRIK5Q16478 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
GRIK5Q16478 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
GRIK5Q16478 C1QTNF9-201ENST00000332018 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
GRIK5Q16478 ACTL8-201ENST00000375406 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
GRIK5Q16478 SYNCRIP-202ENST00000369622 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
GRIK5Q16478 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
GRIK5Q16478 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
GRIK5Q16478 SLC32A1-201ENST00000217420 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
GRIK5Q16478 BAG1-210ENST00000634734 3786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
GRIK5Q16478 TRIM13-204ENST00000420995 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
GRIK5Q16478 SEPT11-203ENST00000502584 2615 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
GRIK5Q16478 EXOG-201ENST00000287675 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
GRIK5Q16478 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC17.62■□□□□ 0.41
GRIK5Q16478 SNRPN-203ENST00000400097 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
GRIK5Q16478 NOP14-AS1-201ENST00000503709 1616 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
GRIK5Q16478 RPTOR-203ENST00000570891 2286 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
GRIK5Q16478 FARS2-202ENST00000324331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
GRIK5Q16478 NFYA-202ENST00000353205 1660 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
GRIK5Q16478 AC022532.1-201ENST00000624563 1728 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
GRIK5Q16478 RAI2-206ENST00000545871 2421 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.61■□□□□ 0.41
GRIK5Q16478 ORAOV1-201ENST00000279147 2478 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
GRIK5Q16478 ZNF425-201ENST00000378061 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
GRIK5Q16478 KCNN2-201ENST00000264773 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
GRIK5Q16478 THUMPD3-AS1-212ENST00000520447 1809 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
GRIK5Q16478 SCYL1-214ENST00000533862 2570 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
GRIK5Q16478 NEK2-201ENST00000366998 1865 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
GRIK5Q16478 NAA60-203ENST00000414063 2619 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
GRIK5Q16478 MX1-218ENST00000619682 1980 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
GRIK5Q16478 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
GRIK5Q16478 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
GRIK5Q16478 AHCY-201ENST00000217426 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
GRIK5Q16478 CAPZB-201ENST00000264202 858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
GRIK5Q16478 RNA5SP359-201ENST00000364838 113 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
GRIK5Q16478 PFDN6-204ENST00000395131 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
GRIK5Q16478 ARL16-201ENST00000397498 1227 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
GRIK5Q16478 STAG3L2-201ENST00000426587 2130 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
GRIK5Q16478 CSTF3-202ENST00000431742 715 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
GRIK5Q16478 AC253536.4-201ENST00000440539 267 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
GRIK5Q16478 RN7SL181P-201ENST00000462921 277 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
GRIK5Q16478 AC011773.1-201ENST00000520129 468 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
GRIK5Q16478 PCMTD1-207ENST00000522514 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
GRIK5Q16478 RBM4B-202ENST00000524637 867 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
GRIK5Q16478 UBXN1-214ENST00000533000 367 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
GRIK5Q16478 ZIM2-AS1-201ENST00000595954 2129 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
GRIK5Q16478 ARL16-214ENST00000621051 1181 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
GRIK5Q16478 TMEM25-206ENST00000442938 2228 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
GRIK5Q16478 ARVCF-201ENST00000263207 4041 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
GRIK5Q16478 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
GRIK5Q16478 RPL13-204ENST00000452368 1455 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
GRIK5Q16478 PAK1-201ENST00000278568 2543 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
GRIK5Q16478 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
GRIK5Q16478 CECR7-202ENST00000441006 2726 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
GRIK5Q16478 DUSP11-201ENST00000272444 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
GRIK5Q16478 TNFRSF10C-201ENST00000356864 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
GRIK5Q16478 ARHGAP25-216ENST00000497079 1843 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
GRIK5Q16478 CLCN2-202ENST00000344937 3187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
GRIK5Q16478 CRHBP-201ENST00000274368 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
GRIK5Q16478 ABHD14B-201ENST00000315877 2236 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
GRIK5Q16478 SEMA7A-201ENST00000261918 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
GRIK5Q16478 TPPP-201ENST00000360578 6022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
GRIK5Q16478 ASCC2-201ENST00000307790 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
GRIK5Q16478 KCNC2-207ENST00000548513 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
GRIK5Q16478 CRYBB1-201ENST00000215939 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
GRIK5Q16478 AC211486.1-201ENST00000275590 980 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
GRIK5Q16478 PBDC1-201ENST00000373357 977 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
GRIK5Q16478 KAZN-204ENST00000400797 1295 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
GRIK5Q16478 TSPY25P-201ENST00000429463 745 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
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