Protein–RNA interactions for Protein: Q15929

ZNF56, Putative zinc finger protein 56, humanhuman

Predictions only

Length 161 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF56Q15929 GPRC5C-202ENST00000392627 2988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
ZNF56Q15929 GPR37-201ENST00000303921 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
ZNF56Q15929 POMT1-204ENST00000402686 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
ZNF56Q15929 CEP131-202ENST00000374782 3505 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
ZNF56Q15929 USP31-203ENST00000567975 2142 ntTSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
ZNF56Q15929 PTK7-205ENST00000352931 4023 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
ZNF56Q15929 EHMT2-201ENST00000375528 4047 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
ZNF56Q15929 CYP26A1-202ENST00000371531 2245 ntTSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
ZNF56Q15929 ARID3B-206ENST00000622429 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
ZNF56Q15929 DNER-201ENST00000341772 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
ZNF56Q15929 ACRV1-201ENST00000315608 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
ZNF56Q15929 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
ZNF56Q15929 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
ZNF56Q15929 YIF1B-201ENST00000329420 964 ntTSL 3 BASIC10.99□□□□□ -0.65
ZNF56Q15929 AC004461.1-201ENST00000412461 403 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
ZNF56Q15929 AC074338.1-201ENST00000416825 156 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
ZNF56Q15929 AL162231.1-204ENST00000423809 477 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.99□□□□□ -0.65
ZNF56Q15929 AL121753.1-201ENST00000444717 529 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.99□□□□□ -0.65
ZNF56Q15929 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
ZNF56Q15929 AC091133.3-201ENST00000504865 432 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
ZNF56Q15929 SEC24B-AS1-203ENST00000505895 800 ntTSL 4 BASIC10.99□□□□□ -0.65
ZNF56Q15929 AP000344.2-201ENST00000512987 629 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
ZNF56Q15929 AP006621.2-201ENST00000533938 284 ntTSL 3 BASIC10.99□□□□□ -0.65
ZNF56Q15929 RHBDL2-203ENST00000540558 697 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
ZNF56Q15929 DRAM1-202ENST00000544152 1048 ntTSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
ZNF56Q15929 COX5A-203ENST00000564811 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
ZNF56Q15929 AC087741.1-202ENST00000573346 801 ntTSL 3 BASIC10.99□□□□□ -0.65
ZNF56Q15929 MIR4469-201ENST00000583919 79 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
ZNF56Q15929 AL513210.1-201ENST00000629608 234 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
ZNF56Q15929 LINC00592-202ENST00000640420 768 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
ZNF56Q15929 AL645728.2-202ENST00000641679 227 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
ZNF56Q15929 SEPT9-228ENST00000590294 2816 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
ZNF56Q15929 MEFV-201ENST00000219596 3499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
ZNF56Q15929 CBX3-202ENST00000396386 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
ZNF56Q15929 GCM2-201ENST00000379491 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
ZNF56Q15929 ZMYND15-204ENST00000573751 2409 ntTSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
ZNF56Q15929 MSI1-201ENST00000257552 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
ZNF56Q15929 LINC00869-206ENST00000610578 5734 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
ZNF56Q15929 ZNF654-204ENST00000636215 6446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
ZNF56Q15929 LRRC20-204ENST00000373224 3095 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
ZNF56Q15929 SFXN3-202ENST00000393459 3098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
ZNF56Q15929 POTEI-201ENST00000451531 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
ZNF56Q15929 CRY2-202ENST00000443527 4203 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
ZNF56Q15929 PES1-201ENST00000335214 1988 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
ZNF56Q15929 TBXAS1-208ENST00000448866 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
ZNF56Q15929 SLC4A7-207ENST00000437179 3667 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
ZNF56Q15929 AHSA1-201ENST00000216479 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
ZNF56Q15929 ACTL9-201ENST00000324436 1426 ntAPPRIS P1 BASIC10.99□□□□□ -0.65
ZNF56Q15929 FLNA-203ENST00000369850 8382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
ZNF56Q15929 SHMT2-202ENST00000414700 2006 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
ZNF56Q15929 MAGED4B-207ENST00000485287 2618 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
ZNF56Q15929 CYP2AB1P-202ENST00000454440 1456 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
ZNF56Q15929 AL365205.1-204ENST00000359201 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
ZNF56Q15929 LINC00924-202ENST00000556053 2682 ntTSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
ZNF56Q15929 GALNT3-201ENST00000392701 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
ZNF56Q15929 MOG-215ENST00000376888 1529 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
ZNF56Q15929 LRRC8D-201ENST00000337338 3950 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
ZNF56Q15929 VILL-202ENST00000383759 2787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
ZNF56Q15929 BCAT2-201ENST00000316273 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
ZNF56Q15929 KCNJ9-201ENST00000368088 4170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
ZNF56Q15929 PIKFYVE-202ENST00000308862 1640 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
ZNF56Q15929 C21orf58-202ENST00000397679 2900 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
ZNF56Q15929 Z97205.2-201ENST00000564697 1639 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
ZNF56Q15929 MFRP-201ENST00000360167 1663 ntTSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
ZNF56Q15929 GRAMD4P3-201ENST00000621665 1669 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
ZNF56Q15929 ITPK1-207ENST00000555495 3035 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
ZNF56Q15929 POLR2E-211ENST00000612655 1749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.98□□□□□ -0.65
ZNF56Q15929 MORC4-202ENST00000355610 3834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
ZNF56Q15929 MGMT-201ENST00000306010 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
ZNF56Q15929 MRC2-202ENST00000446119 3201 ntTSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
ZNF56Q15929 NPRL3-212ENST00000620134 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
ZNF56Q15929 BMF-201ENST00000354670 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
ZNF56Q15929 SCYL1-208ENST00000527009 2586 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
ZNF56Q15929 ZCCHC8-207ENST00000543897 5663 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
ZNF56Q15929 ACVR2A-201ENST00000241416 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
ZNF56Q15929 ZNF318-201ENST00000361428 8006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
ZNF56Q15929 EDEM2-202ENST00000374492 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
ZNF56Q15929 TRIP10-208ENST00000596758 1920 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
ZNF56Q15929 ZSCAN32-215ENST00000618425 2788 ntTSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
ZNF56Q15929 ETNPPL-201ENST00000296486 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
ZNF56Q15929 ADAMTSL1-205ENST00000380548 8030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
ZNF56Q15929 PSMB6-201ENST00000270586 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
ZNF56Q15929 RBPMS-201ENST00000287771 2974 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
ZNF56Q15929 FIGLA-201ENST00000332372 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
ZNF56Q15929 C9orf116-202ENST00000371789 1278 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
ZNF56Q15929 MRPS18A-202ENST00000372133 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
ZNF56Q15929 RPL30-202ENST00000396070 440 ntTSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
ZNF56Q15929 PES1-204ENST00000402284 2144 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
ZNF56Q15929 RNF43-201ENST00000407977 5516 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
ZNF56Q15929 TWIST2-201ENST00000448943 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
ZNF56Q15929 IQSEC2-204ENST00000485377 835 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
ZNF56Q15929 PTPRVP-202ENST00000490575 953 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
ZNF56Q15929 AC106872.10-201ENST00000503778 747 ntTSL 3 BASIC10.98□□□□□ -0.65
ZNF56Q15929 PGAM5P1-201ENST00000518923 814 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
ZNF56Q15929 FAM92A-214ENST00000522324 1072 ntTSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
ZNF56Q15929 WASHC3-213ENST00000545679 865 ntTSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
ZNF56Q15929 TBCB-211ENST00000589996 724 ntTSL 3 BASIC10.98□□□□□ -0.65
ZNF56Q15929 KLK15-203ENST00000596931 692 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
ZNF56Q15929 GMFG-207ENST00000598034 1028 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
ZNF56Q15929 PSMB6-205ENST00000614486 871 ntTSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.9 ms