Protein–RNA interactions for Protein: Q15834

CCDC85B, Coiled-coil domain-containing protein 85B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 202 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC85BQ15834 GNE-202ENST00000396594 5298 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCDC85BQ15834 SYDE1-204ENST00000600440 3058 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCDC85BQ15834 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCDC85BQ15834 SYT1-201ENST00000261205 4808 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCDC85BQ15834 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCDC85BQ15834 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCDC85BQ15834 STMN1-203ENST00000399728 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCDC85BQ15834 PLPPR2-201ENST00000251473 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCDC85BQ15834 LINC02199-201ENST00000506655 2702 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
CCDC85BQ15834 SCYL1-214ENST00000533862 2570 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCDC85BQ15834 PAX3-206ENST00000392070 2258 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCDC85BQ15834 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCDC85BQ15834 OBSCN-AS1-201ENST00000295012 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCDC85BQ15834 PRIMA1-201ENST00000316227 1080 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCDC85BQ15834 RBM38-204ENST00000371219 760 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCDC85BQ15834 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCDC85BQ15834 GCSHP3-201ENST00000431120 391 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
CCDC85BQ15834 SERBP1P2-201ENST00000436888 1164 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
CCDC85BQ15834 DUTP3-201ENST00000450025 415 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
CCDC85BQ15834 RN7SL81P-201ENST00000493781 261 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
CCDC85BQ15834 AC105362.1-201ENST00000511234 564 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCDC85BQ15834 NR2C2AP-207ENST00000544883 899 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCDC85BQ15834 AC008050.1-201ENST00000554926 632 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCDC85BQ15834 AC020659.1-202ENST00000564432 531 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCDC85BQ15834 AC040162.4-201ENST00000574912 1185 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCDC85BQ15834 AC103808.3-201ENST00000579714 598 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCDC85BQ15834 GMIP-204ENST00000587238 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCDC85BQ15834 LINC02081-203ENST00000591384 867 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCDC85BQ15834 AL139339.2-201ENST00000608063 657 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
CCDC85BQ15834 HMGB1P24-201ENST00000611897 328 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
CCDC85BQ15834 AP001184.1-201ENST00000637936 376 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
CCDC85BQ15834 ALG12-201ENST00000330817 5350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCDC85BQ15834 CASP2-201ENST00000310447 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCDC85BQ15834 AC092171.3-201ENST00000610122 2651 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
CCDC85BQ15834 CD93-201ENST00000246006 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCDC85BQ15834 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCDC85BQ15834 CXorf38-202ENST00000378421 2380 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCDC85BQ15834 GFRA2-204ENST00000518077 1503 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCDC85BQ15834 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCDC85BQ15834 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCDC85BQ15834 HIPK3-201ENST00000303296 7408 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCDC85BQ15834 WDR6-222ENST00000615452 1949 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCDC85BQ15834 SLC2A6-201ENST00000371897 2301 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCDC85BQ15834 FH-201ENST00000366560 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCDC85BQ15834 CCAR2-201ENST00000308511 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCDC85BQ15834 PHLDA1-201ENST00000266671 8069 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCDC85BQ15834 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCDC85BQ15834 C9orf139-202ENST00000623196 4990 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCDC85BQ15834 PLEKHB2-207ENST00000438882 1460 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CCDC85BQ15834 AC109460.1-201ENST00000567209 1478 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CCDC85BQ15834 AMHR2-201ENST00000257863 1863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CCDC85BQ15834 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CCDC85BQ15834 RAB40B-206ENST00000571995 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CCDC85BQ15834 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CCDC85BQ15834 CPSF1-213ENST00000620219 4462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CCDC85BQ15834 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CCDC85BQ15834 AC026412.1-202ENST00000512335 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CCDC85BQ15834 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CCDC85BQ15834 NIPA2-204ENST00000398014 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CCDC85BQ15834 ST6GAL2-204ENST00000409382 7275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CCDC85BQ15834 ZCCHC3-201ENST00000500893 3354 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CCDC85BQ15834 CCNE1-203ENST00000444983 1680 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CCDC85BQ15834 ANKRD33-201ENST00000301190 1935 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CCDC85BQ15834 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CCDC85BQ15834 CERK-201ENST00000216264 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CCDC85BQ15834 C12orf49-201ENST00000261318 8404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CCDC85BQ15834 VAMP1-202ENST00000396308 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CCDC85BQ15834 HNRNPA1P58-201ENST00000403629 610 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
CCDC85BQ15834 BANF1P3-201ENST00000412556 261 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
CCDC85BQ15834 NDUFS7-203ENST00000414651 841 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CCDC85BQ15834 LINC00431-201ENST00000440735 1189 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CCDC85BQ15834 RPSAP15-201ENST00000448168 861 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
CCDC85BQ15834 KLHDC8A-203ENST00000460687 1022 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CCDC85BQ15834 PAQR9-AS1-203ENST00000497652 516 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CCDC85BQ15834 CHTF8-204ENST00000518041 567 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CCDC85BQ15834 AC109479.3-201ENST00000520163 360 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CCDC85BQ15834 CYB561D1-207ENST00000527072 892 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CCDC85BQ15834 RAP1B-216ENST00000537460 1072 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CCDC85BQ15834 DUX4L47-201ENST00000566374 394 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
CCDC85BQ15834 MAFTRR-203ENST00000567993 685 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CCDC85BQ15834 SHBG-210ENST00000572262 984 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CCDC85BQ15834 AC055811.3-201ENST00000584952 686 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
CCDC85BQ15834 PEBP1P2-201ENST00000603980 558 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
CCDC85BQ15834 AC011471.3-201ENST00000623576 402 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
CCDC85BQ15834 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CCDC85BQ15834 EFEMP1-202ENST00000394555 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CCDC85BQ15834 MAPK13-203ENST00000373766 6196 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CCDC85BQ15834 CANX-201ENST00000247461 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CCDC85BQ15834 FGFR4-201ENST00000292408 3122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CCDC85BQ15834 NDUFB6-203ENST00000379847 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CCDC85BQ15834 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CCDC85BQ15834 SMTNL1-202ENST00000527972 1649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CCDC85BQ15834 BCAR1-206ENST00000535626 2894 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CCDC85BQ15834 FP565260.6-204ENST00000620528 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CCDC85BQ15834 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
CCDC85BQ15834 ABR-203ENST00000536794 2213 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
CCDC85BQ15834 ANTXRL-205ENST00000620264 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
CCDC85BQ15834 ELOA-204ENST00000613537 4924 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
CCDC85BQ15834 CA12-203ENST00000422263 2556 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
CCDC85BQ15834 AP003680.1-201ENST00000598970 3660 ntBASIC15.71■□□□□ 0.1
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