Protein–RNA interactions for Protein: Q15642

TRIP10, Cdc42-interacting protein 4, humanhuman

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Length 601 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIP10Q15642 FHOD3-201ENST00000257209 4967 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
TRIP10Q15642 L3MBTL1-206ENST00000427442 3157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
TRIP10Q15642 SLC22A2-202ENST00000366953 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
TRIP10Q15642 LSMEM2-201ENST00000316436 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
TRIP10Q15642 CLN3-203ENST00000357806 1469 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
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TRIP10Q15642 BEND5-201ENST00000371833 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
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TRIP10Q15642 TRAPPC10-201ENST00000291574 6976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
TRIP10Q15642 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
TRIP10Q15642 TIPARP-201ENST00000295924 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
TRIP10Q15642 PPIC-201ENST00000306442 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
TRIP10Q15642 SMARCA2-204ENST00000357248 5855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
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TRIP10Q15642 AP003555.1-202ENST00000511013 1755 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
TRIP10Q15642 AC011899.2-202ENST00000438047 4302 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
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TRIP10Q15642 GSTO1-202ENST00000369713 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
TRIP10Q15642 EXOSC8-202ENST00000389704 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
TRIP10Q15642 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
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TRIP10Q15642 MOG-221ENST00000376917 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
TRIP10Q15642 MFAP4-202ENST00000395592 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
TRIP10Q15642 FBLIM1-203ENST00000375771 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
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TRIP10Q15642 OTUD4-201ENST00000447906 3829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
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TRIP10Q15642 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC14.37□□□□□ -0.11
TRIP10Q15642 KRTAP5-9-201ENST00000528743 1136 ntAPPRIS P1 BASIC14.37□□□□□ -0.11
TRIP10Q15642 H3F3B-208ENST00000589599 576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.37□□□□□ -0.11
TRIP10Q15642 ZEB1-AS1-206ENST00000606250 573 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
TRIP10Q15642 AL590999.1-203ENST00000606829 542 ntTSL 4 BASIC14.37□□□□□ -0.11
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