Protein–RNA interactions for Protein: Q14957

GRIN2C, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 2C, humanhuman

Predictions only

Length 1,233 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIN2CQ14957 NFATC1-207ENST00000545796 3558 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
GRIN2CQ14957 POC1B-202ENST00000393179 3096 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
GRIN2CQ14957 GHR-201ENST00000230882 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
GRIN2CQ14957 GRIA4-203ENST00000393127 5621 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
GRIN2CQ14957 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
GRIN2CQ14957 ADAM15-228ENST00000531455 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
GRIN2CQ14957 C14orf93-207ENST00000397382 1986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
GRIN2CQ14957 FERD3L-201ENST00000275461 640 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
GRIN2CQ14957 CACNG7-202ENST00000391766 631 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
GRIN2CQ14957 CXCL12-205ENST00000395794 1052 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
GRIN2CQ14957 VCX3A-202ENST00000398729 808 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
GRIN2CQ14957 APCDD1L-AS1-206ENST00000445984 566 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
GRIN2CQ14957 APCDD1L-AS1-208ENST00000448374 546 ntTSL 4 BASIC15.7■□□□□ 0.1
GRIN2CQ14957 HMGB3-204ENST00000448905 812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
GRIN2CQ14957 ZSCAN2-208ENST00000485222 910 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
GRIN2CQ14957 AC093627.2-201ENST00000497017 568 ntTSL 4 BASIC15.7■□□□□ 0.1
GRIN2CQ14957 ZSCAN2-210ENST00000538076 1109 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
GRIN2CQ14957 AC007952.4-201ENST00000573866 637 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
GRIN2CQ14957 POLR2E-204ENST00000586746 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
GRIN2CQ14957 ZNF772-207ENST00000601768 482 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
GRIN2CQ14957 SIGLEC22P-202ENST00000602065 544 ntTSL 4 BASIC15.7■□□□□ 0.1
GRIN2CQ14957 AC004686.1-201ENST00000605113 538 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
GRIN2CQ14957 ADH5-213ENST00000626055 1299 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
GRIN2CQ14957 CSAG3-203ENST00000638835 793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
GRIN2CQ14957 CSAG2-204ENST00000640702 793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
GRIN2CQ14957 AC079325.2-202ENST00000641031 462 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
GRIN2CQ14957 AC079325.2-201ENST00000641710 606 ntAPPRIS P5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
GRIN2CQ14957 LFNG-204ENST00000402045 2058 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
GRIN2CQ14957 SHISA2-201ENST00000319420 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
GRIN2CQ14957 AL139130.1-201ENST00000451362 5586 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
GRIN2CQ14957 SPCS2-201ENST00000263672 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
GRIN2CQ14957 MAST3-201ENST00000262811 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
GRIN2CQ14957 SLC22A6-203ENST00000421062 1560 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
GRIN2CQ14957 PLAA-205ENST00000520884 2041 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
GRIN2CQ14957 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
GRIN2CQ14957 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
GRIN2CQ14957 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
GRIN2CQ14957 ZMYND12-201ENST00000372565 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
GRIN2CQ14957 AL138725.1-201ENST00000407347 1314 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
GRIN2CQ14957 AL137783.1-201ENST00000623494 1896 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
GRIN2CQ14957 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
GRIN2CQ14957 TNKS-211ENST00000520408 1964 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
GRIN2CQ14957 TKT-202ENST00000423516 2075 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
GRIN2CQ14957 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
GRIN2CQ14957 SUN2-203ENST00000406622 2725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
GRIN2CQ14957 NELFA-203ENST00000411638 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
GRIN2CQ14957 MDGA1-203ENST00000434837 10736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
GRIN2CQ14957 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
GRIN2CQ14957 PIK3IP1-203ENST00000441972 2374 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
GRIN2CQ14957 AC018629.1-201ENST00000623381 1736 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
GRIN2CQ14957 C2CD4C-201ENST00000332235 3129 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
GRIN2CQ14957 PPP1R3G-201ENST00000405617 4907 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
GRIN2CQ14957 MLLT3-210ENST00000630269 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
GRIN2CQ14957 CRAMP1-202ENST00000397412 7772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
GRIN2CQ14957 FIS1-201ENST00000223136 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
GRIN2CQ14957 MBD1-202ENST00000269471 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
GRIN2CQ14957 GTF3C6-201ENST00000329970 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
GRIN2CQ14957 SURF4-203ENST00000371991 715 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
GRIN2CQ14957 KRTAP2-4-201ENST00000394015 764 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
GRIN2CQ14957 MAPK3-204ENST00000395200 997 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
GRIN2CQ14957 AL391832.2-203ENST00000423175 554 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
GRIN2CQ14957 NAA60-205ENST00000424546 1149 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
GRIN2CQ14957 GLIS3-AS1-201ENST00000451340 734 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
GRIN2CQ14957 CISD2-202ENST00000503643 808 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
GRIN2CQ14957 AC011773.1-201ENST00000520129 468 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
GRIN2CQ14957 AC105219.2-201ENST00000527908 299 ntTSL 4 BASIC15.69■□□□□ 0.1
GRIN2CQ14957 AC138701.2-201ENST00000553634 226 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
GRIN2CQ14957 PAX4-207ENST00000611453 1235 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
GRIN2CQ14957 AC002044.2-201ENST00000624910 970 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
GRIN2CQ14957 CYP4B1-215ENST00000640628 969 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
GRIN2CQ14957 CD79B-201ENST00000006750 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
GRIN2CQ14957 LTBP2-205ENST00000556690 5614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
GRIN2CQ14957 REPS1-201ENST00000258062 3161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
GRIN2CQ14957 CORO6-201ENST00000345068 2603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
GRIN2CQ14957 RAPSN-201ENST00000298854 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
GRIN2CQ14957 SYNM-201ENST00000328642 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
GRIN2CQ14957 KDM5C-202ENST00000375379 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
GRIN2CQ14957 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
GRIN2CQ14957 TRIM27-202ENST00000377199 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
GRIN2CQ14957 PRSS50-201ENST00000460241 2960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
GRIN2CQ14957 TXNDC5-204ENST00000473453 1301 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
GRIN2CQ14957 SCGN-202ENST00000377961 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
GRIN2CQ14957 KIR2DS4-201ENST00000339924 1608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
GRIN2CQ14957 FAM156B-202ENST00000509613 1701 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
GRIN2CQ14957 CHRNB2-201ENST00000368476 5867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
GRIN2CQ14957 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
GRIN2CQ14957 POR-218ENST00000461988 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
GRIN2CQ14957 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
GRIN2CQ14957 BNC1-201ENST00000345382 4610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
GRIN2CQ14957 ARHGAP26-202ENST00000378004 9200 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
GRIN2CQ14957 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
GRIN2CQ14957 CORO2B-201ENST00000261861 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
GRIN2CQ14957 CORO2B-204ENST00000566799 3566 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
GRIN2CQ14957 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
GRIN2CQ14957 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
GRIN2CQ14957 C16orf58-211ENST00000570164 2783 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
GRIN2CQ14957 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
GRIN2CQ14957 ANKRD17-201ENST00000330838 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
GRIN2CQ14957 AL672207.1-201ENST00000328462 1570 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
GRIN2CQ14957 UCN2-201ENST00000273610 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
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