Protein–RNA interactions for Protein: Q14790

CASP8, Caspase-8, humanhuman

Predictions only

Length 479 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP8Q14790 AL158071.2-201ENST00000423380 815 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CASP8Q14790 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CASP8Q14790 AC098831.1-202ENST00000438821 336 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CASP8Q14790 USP40-206ENST00000443711 628 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CASP8Q14790 MRNIP-220ENST00000523084 1096 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CASP8Q14790 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CASP8Q14790 C14orf178-204ENST00000557011 474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CASP8Q14790 UBE2Q2P1-205ENST00000559871 534 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CASP8Q14790 CUEDC1-207ENST00000577840 875 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CASP8Q14790 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CASP8Q14790 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CASP8Q14790 ALKBH7-203ENST00000599849 556 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CASP8Q14790 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CASP8Q14790 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CASP8Q14790 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CASP8Q14790 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CASP8Q14790 ANGPTL8-204ENST00000616433 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CASP8Q14790 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CASP8Q14790 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CASP8Q14790 UBE3D-208ENST00000626828 114 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CASP8Q14790 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CASP8Q14790 MTMR6-201ENST00000381801 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CASP8Q14790 SNHG18-201ENST00000508179 1799 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CASP8Q14790 INPPL1-213ENST00000541756 4649 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CASP8Q14790 ITGB4-203ENST00000450894 5645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CASP8Q14790 DEK-201ENST00000244776 1441 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CASP8Q14790 TPGS2-220ENST00000610723 1426 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CASP8Q14790 RNF167-201ENST00000262482 1915 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CASP8Q14790 SLC45A1-201ENST00000289877 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CASP8Q14790 JARID2-202ENST00000397311 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CASP8Q14790 SYT1-204ENST00000457153 4592 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CASP8Q14790 HSPA8P5-201ENST00000456928 2069 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CASP8Q14790 NR2C1-219ENST00000622476 1561 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CASP8Q14790 HPS1-215ENST00000613394 3714 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CASP8Q14790 MKRN1-201ENST00000255977 3151 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CASP8Q14790 ARAP3-201ENST00000239440 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CASP8Q14790 SH3PXD2B-203ENST00000519643 1394 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CASP8Q14790 WDR74-206ENST00000529106 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CASP8Q14790 RAB5B-202ENST00000448789 1530 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CASP8Q14790 TRMT2B-206ENST00000545398 3106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CASP8Q14790 IGF2-203ENST00000381395 4527 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CASP8Q14790 EVA1A-202ENST00000393913 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CASP8Q14790 PTPN13-203ENST00000427191 8487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CASP8Q14790 NCLP1-201ENST00000445357 1963 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CASP8Q14790 SRA1-201ENST00000336283 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CASP8Q14790 ZNF501-205ENST00000620116 3382 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CASP8Q14790 SUPT7L-203ENST00000405491 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CASP8Q14790 FDPS-201ENST00000356657 1478 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CASP8Q14790 SPAG9-222ENST00000618113 8246 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CASP8Q14790 FUT1-201ENST00000310160 4246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CASP8Q14790 XRRA1-207ENST00000527087 2505 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CASP8Q14790 CFAP43-201ENST00000278064 2963 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CASP8Q14790 POU2AF1-201ENST00000393067 3295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CASP8Q14790 AC239799.1-201ENST00000612520 3411 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CASP8Q14790 TUBBP5-201ENST00000290377 1563 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CASP8Q14790 SUOX-202ENST00000356124 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CASP8Q14790 CIART-203ENST00000369095 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CASP8Q14790 TMEM189-202ENST00000371652 7714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CASP8Q14790 GJB1-203ENST00000374029 1587 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CASP8Q14790 C1QA-201ENST00000374642 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CASP8Q14790 COPS7B-207ENST00000410024 1103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CASP8Q14790 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CASP8Q14790 BSCL2-210ENST00000421906 1440 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CASP8Q14790 AC139149.1-202ENST00000442532 783 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CASP8Q14790 SS18L2-202ENST00000447630 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CASP8Q14790 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CASP8Q14790 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CASP8Q14790 LINC02396-202ENST00000550636 2324 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CASP8Q14790 KRT19P2-202ENST00000557173 1012 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CASP8Q14790 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CASP8Q14790 AP002472.1-201ENST00000577490 586 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CASP8Q14790 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CASP8Q14790 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CASP8Q14790 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CASP8Q14790 AC068137.2-201ENST00000605408 478 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CASP8Q14790 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CASP8Q14790 LRRC41-208ENST00000617760 2158 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CASP8Q14790 SLC26A1-205ENST00000622731 1057 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CASP8Q14790 CKMT1A-208ENST00000626814 1073 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CASP8Q14790 DBI-212ENST00000627305 620 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CASP8Q14790 CKMT1B-215ENST00000627381 1074 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CASP8Q14790 LRRC32-201ENST00000260061 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CASP8Q14790 EML1-203ENST00000334192 4064 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CASP8Q14790 ELP1-201ENST00000374647 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CASP8Q14790 AFAP1-201ENST00000358461 7516 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CASP8Q14790 CKMT2-201ENST00000254035 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CASP8Q14790 ABR-205ENST00000544583 5595 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CASP8Q14790 MLF1-201ENST00000355893 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CASP8Q14790 AC016245.1-201ENST00000570335 3204 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CASP8Q14790 SGMS1-203ENST00000429490 3634 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CASP8Q14790 KHSRPP1-201ENST00000427983 1768 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CASP8Q14790 MAPK4-206ENST00000592595 4330 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CASP8Q14790 PPP4R3B-205ENST00000616288 4310 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CASP8Q14790 MAGED4B-211ENST00000497164 2482 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CASP8Q14790 NME1-209ENST00000511355 1645 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CASP8Q14790 PPP3R1-201ENST00000234310 3023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CASP8Q14790 TRIT1-214ENST00000537440 2026 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CASP8Q14790 AKAP8P1-201ENST00000434743 1349 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
CASP8Q14790 ANKS1B-208ENST00000547010 2595 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CASP8Q14790 TRIM45-202ENST00000369461 2415 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.7 ms