Protein–RNA interactions for Protein: Q14574

DSC3, Desmocollin-3, humanhuman

Predictions only

Length 896 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DSC3Q14574 SRPX-206ENST00000544439 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
DSC3Q14574 ACOX3-202ENST00000413009 2374 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
DSC3Q14574 ITGB1BP1-204ENST00000360635 4859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
DSC3Q14574 TAOK2-203ENST00000416441 4780 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
DSC3Q14574 POLL-204ENST00000370168 1536 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
DSC3Q14574 SMPDL3B-201ENST00000373888 1548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
DSC3Q14574 NEO1-202ENST00000339362 7342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
DSC3Q14574 ELMO1-209ENST00000448602 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
DSC3Q14574 SVOPL-201ENST00000288513 1413 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
DSC3Q14574 ACTR2-205ENST00000542850 1429 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
DSC3Q14574 MCM7-202ENST00000343023 1968 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
DSC3Q14574 LINC01107-201ENST00000446979 1975 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
DSC3Q14574 AC100803.3-201ENST00000606664 2961 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
DSC3Q14574 ADPRHL1-201ENST00000356501 1877 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
DSC3Q14574 FRMPD2B-201ENST00000431305 1347 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
DSC3Q14574 C7orf31-201ENST00000283905 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
DSC3Q14574 DUSP11-201ENST00000272444 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
DSC3Q14574 EIF4G1-204ENST00000352767 5484 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
DSC3Q14574 LDLRAD4-205ENST00000585931 2118 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
DSC3Q14574 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
DSC3Q14574 RPL13-204ENST00000452368 1455 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
DSC3Q14574 JAKMIP1-205ENST00000410077 1835 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
DSC3Q14574 C3orf33-205ENST00000534941 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
DSC3Q14574 PLXND1-201ENST00000324093 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
DSC3Q14574 MAGI3-203ENST00000369615 6508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
DSC3Q14574 ERGIC3-203ENST00000357394 1357 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
DSC3Q14574 ANKK1-201ENST00000303941 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
DSC3Q14574 ARNTL2-208ENST00000544915 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
DSC3Q14574 CARD11-203ENST00000396946 4366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
DSC3Q14574 BRD3-201ENST00000303407 5652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
DSC3Q14574 RANBP1-201ENST00000331821 837 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
DSC3Q14574 DGKZ-202ENST00000343674 3816 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
DSC3Q14574 AC131097.2-203ENST00000401641 507 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
DSC3Q14574 AC026320.2-201ENST00000434379 478 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
DSC3Q14574 OR2R1P-201ENST00000441404 914 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
DSC3Q14574 FKBP11-202ENST00000444214 630 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
DSC3Q14574 FGFR3P1-201ENST00000449999 601 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
DSC3Q14574 LINC00322-201ENST00000450205 699 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
DSC3Q14574 MSC-AS1-204ENST00000518916 864 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
DSC3Q14574 NEU3-205ENST00000531619 582 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
DSC3Q14574 SHBG-207ENST00000570547 801 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
DSC3Q14574 PHBP15-201ENST00000574228 665 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
DSC3Q14574 MIR3147-201ENST00000577811 66 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
DSC3Q14574 IMPA2-207ENST00000588927 787 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
DSC3Q14574 ALKBH7-202ENST00000596657 603 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
DSC3Q14574 MIR6769A-201ENST00000617340 73 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
DSC3Q14574 HIST1H4A-201ENST00000617569 312 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
DSC3Q14574 AC007718.1-201ENST00000621078 280 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
DSC3Q14574 MEX3C-204ENST00000616921 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
DSC3Q14574 AC139712.1-201ENST00000378256 1875 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
DSC3Q14574 NDRG1-202ENST00000414097 3755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
DSC3Q14574 ENO3-202ENST00000518175 1448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
DSC3Q14574 VWCE-205ENST00000535710 1437 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
DSC3Q14574 SLC39A6-202ENST00000440549 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
DSC3Q14574 TMEM143-203ENST00000435956 2272 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
DSC3Q14574 ZNF384-202ENST00000355772 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
DSC3Q14574 ZEB1-AS1-208ENST00000607166 2503 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
DSC3Q14574 VIPR1-217ENST00000543411 2681 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
DSC3Q14574 AL391244.1-206ENST00000447725 1843 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
DSC3Q14574 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
DSC3Q14574 DNM1-208ENST00000486160 3181 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
DSC3Q14574 POP4-201ENST00000221770 2321 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
DSC3Q14574 SCYL1-214ENST00000533862 2570 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
DSC3Q14574 CRHBP-201ENST00000274368 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
DSC3Q14574 ANXA6-215ENST00000523714 2451 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
DSC3Q14574 AL953897.1-201ENST00000376620 1868 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
DSC3Q14574 PARN-202ENST00000420015 2360 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
DSC3Q14574 FAM90A2P-201ENST00000511144 1395 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
DSC3Q14574 FAM90A25P-201ENST00000528404 1395 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
DSC3Q14574 TRPC3-202ENST00000379645 3548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
DSC3Q14574 F2-201ENST00000311907 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
DSC3Q14574 RPAIN-201ENST00000327154 815 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
DSC3Q14574 ZDHHC4-201ENST00000335965 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
DSC3Q14574 TSPO2-201ENST00000373158 718 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
DSC3Q14574 PBDC1-201ENST00000373357 977 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
DSC3Q14574 FBXO44-203ENST00000376760 822 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
DSC3Q14574 RPP25L-202ENST00000378959 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
DSC3Q14574 AL627231.1-201ENST00000394467 1125 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
DSC3Q14574 LINC01006-202ENST00000418309 640 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
DSC3Q14574 HDAC2-AS2-213ENST00000520891 603 ntTSL 4 BASIC15.91■□□□□ 0.14
DSC3Q14574 CYB5D1-202ENST00000570446 570 ntTSL 4 BASIC15.91■□□□□ 0.14
DSC3Q14574 AL031282.1-201ENST00000577672 409 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
DSC3Q14574 MIR3677-201ENST00000578964 60 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
DSC3Q14574 AC010754.1-201ENST00000582300 1061 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
DSC3Q14574 COX10-AS1-206ENST00000602743 576 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
DSC3Q14574 AC022001.2-201ENST00000607849 580 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
DSC3Q14574 AC073352.2-201ENST00000609385 439 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
DSC3Q14574 ALKBH2-208ENST00000619381 895 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
DSC3Q14574 AC012183.1-201ENST00000625197 499 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
DSC3Q14574 TRIM39-201ENST00000376656 3338 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
DSC3Q14574 AP000552.1-203ENST00000416615 1930 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
DSC3Q14574 ADAMTSL1-207ENST00000380566 2321 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
DSC3Q14574 TYSND1-202ENST00000335494 3397 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
DSC3Q14574 CDK16-202ENST00000357227 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
DSC3Q14574 P2RX3-201ENST00000263314 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
DSC3Q14574 RAB31-207ENST00000578921 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
DSC3Q14574 ZNF586-202ENST00000396150 1977 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
DSC3Q14574 WASHC2C-204ENST00000374362 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
DSC3Q14574 AGK-211ENST00000629555 2765 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
DSC3Q14574 DLK1-201ENST00000331224 1324 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.9 ms