Protein–RNA interactions for Protein: Q13772

NCOA4, Nuclear receptor coactivator 4, humanhuman

Predictions only

Length 614 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCOA4Q13772 AHCYL2-202ENST00000446544 5026 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NCOA4Q13772 DEPDC7-201ENST00000241051 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NCOA4Q13772 FOXB1-201ENST00000396057 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NCOA4Q13772 RNF157-AS1-204ENST00000590137 1812 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NCOA4Q13772 CTTN-202ENST00000346329 3272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NCOA4Q13772 TRIM3-215ENST00000639856 2137 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NCOA4Q13772 FAM219A-206ENST00000379087 3573 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NCOA4Q13772 LDLR-202ENST00000455727 2333 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NCOA4Q13772 MCHR2-201ENST00000281806 2368 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NCOA4Q13772 STUM-202ENST00000366789 4093 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NCOA4Q13772 MAOB-201ENST00000378069 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NCOA4Q13772 GPER1-201ENST00000297469 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NCOA4Q13772 NR4A3-201ENST00000330847 4982 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NCOA4Q13772 BCAR1-207ENST00000538440 3192 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NCOA4Q13772 DMPK-202ENST00000343373 3227 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NCOA4Q13772 UBC-205ENST00000536769 3745 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NCOA4Q13772 GBGT1-202ENST00000372038 847 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NCOA4Q13772 NCR3-204ENST00000376073 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NCOA4Q13772 IFT20-203ENST00000395418 825 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NCOA4Q13772 LINC02158-201ENST00000432377 897 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NCOA4Q13772 ATP5G2P4-201ENST00000442175 420 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
NCOA4Q13772 LLPH-AS1-201ENST00000510317 623 ntTSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NCOA4Q13772 AP001453.3-201ENST00000545800 853 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NCOA4Q13772 GCHFR-204ENST00000559445 626 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NCOA4Q13772 CX3CL1-203ENST00000564948 563 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NCOA4Q13772 IFT20-216ENST00000588477 774 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NCOA4Q13772 AC073413.1-201ENST00000603927 732 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
NCOA4Q13772 AC133552.6-201ENST00000613406 534 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
NCOA4Q13772 FAM180B-201ENST00000538490 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NCOA4Q13772 SELENOS-201ENST00000398226 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NCOA4Q13772 FKBP6-201ENST00000252037 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NCOA4Q13772 WIZ-207ENST00000599910 4609 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NCOA4Q13772 FAM103A1-201ENST00000304191 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NCOA4Q13772 CDC37-201ENST00000222005 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NCOA4Q13772 CYB561D1-201ENST00000310611 5009 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NCOA4Q13772 TMEM258-207ENST00000543510 1692 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NCOA4Q13772 NOS2P2-202ENST00000639528 1659 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NCOA4Q13772 AC007292.2-201ENST00000593524 1812 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
NCOA4Q13772 ROBO1-209ENST00000495273 5600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NCOA4Q13772 MX1-218ENST00000619682 1980 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NCOA4Q13772 WBP2-215ENST00000591399 2225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NCOA4Q13772 MAPT-204ENST00000344290 6816 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NCOA4Q13772 INHBE-201ENST00000266646 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NCOA4Q13772 SCAMP2-201ENST00000268099 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NCOA4Q13772 LIMK2-203ENST00000340552 2789 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NCOA4Q13772 PBX3-203ENST00000373487 2902 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NCOA4Q13772 NBEAL2-205ENST00000450053 8827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NCOA4Q13772 INTS4P1-203ENST00000641008 3683 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
NCOA4Q13772 TTC28-AS1-219ENST00000454741 5064 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NCOA4Q13772 DUOX1-201ENST00000321429 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NCOA4Q13772 SLC38A10-202ENST00000374759 4300 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NCOA4Q13772 TBCD-202ENST00000539345 3975 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NCOA4Q13772 MAPKAP1-201ENST00000265960 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NCOA4Q13772 ADAM15-201ENST00000271836 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NCOA4Q13772 UBE2D1-201ENST00000373910 2659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NCOA4Q13772 PYGM-202ENST00000377432 2611 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NCOA4Q13772 PRF1-201ENST00000373209 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NCOA4Q13772 AC123912.2-201ENST00000594927 2409 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NCOA4Q13772 LINC01285-201ENST00000412422 2289 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NCOA4Q13772 SLC35C2-204ENST00000372230 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NCOA4Q13772 RUBCNL-212ENST00000631139 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NCOA4Q13772 AP001627.1-201ENST00000437426 1754 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NCOA4Q13772 FANCA-213ENST00000563673 1694 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NCOA4Q13772 SUMO1-203ENST00000392246 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NCOA4Q13772 GPBAR1-203ENST00000521462 1465 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NCOA4Q13772 HS2ST1-201ENST00000370550 6736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NCOA4Q13772 AC099850.1-201ENST00000451775 1338 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NCOA4Q13772 LCN9-201ENST00000277526 531 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NCOA4Q13772 STX1A-203ENST00000395155 783 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NCOA4Q13772 MCFD2-204ENST00000409207 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NCOA4Q13772 AC004945.1-201ENST00000416738 983 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
NCOA4Q13772 AC099336.1-201ENST00000417053 1171 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
NCOA4Q13772 CSF2RBP1-201ENST00000447905 391 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
NCOA4Q13772 KRT223P-202ENST00000449164 1292 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
NCOA4Q13772 MAATS1-203ENST00000463700 939 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NCOA4Q13772 TMEM14B-210ENST00000473276 730 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NCOA4Q13772 GCOM2-201ENST00000509133 1104 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
NCOA4Q13772 AC023310.1-201ENST00000554836 735 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
NCOA4Q13772 IFI27L1-210ENST00000556381 804 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NCOA4Q13772 C2orf69P2-201ENST00000562032 1123 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
NCOA4Q13772 LINC00621-201ENST00000577004 1177 ntTSL 4 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NCOA4Q13772 MIR4259-201ENST00000584466 101 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
NCOA4Q13772 TMEM14B-220ENST00000612333 888 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NCOA4Q13772 LCN9-204ENST00000619315 528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NCOA4Q13772 AL391650.2-201ENST00000640097 941 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NCOA4Q13772 SAFB2-201ENST00000252542 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NCOA4Q13772 ZNF777-201ENST00000247930 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NCOA4Q13772 ZNF324-201ENST00000196482 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NCOA4Q13772 KCNQ4-201ENST00000347132 4099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NCOA4Q13772 TAP2-201ENST00000374897 5684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NCOA4Q13772 EXOC7-213ENST00000467929 2260 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NCOA4Q13772 PRKRIP1-201ENST00000397912 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NCOA4Q13772 AL353997.2-201ENST00000579352 4955 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NCOA4Q13772 PRMT7-203ENST00000449359 2091 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NCOA4Q13772 HCFC1-201ENST00000310441 8869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NCOA4Q13772 TBK1-201ENST00000331710 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NCOA4Q13772 PRPSAP2-216ENST00000536323 1872 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
NCOA4Q13772 ALDH1B1-201ENST00000377698 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NCOA4Q13772 VCAN-211ENST00000513984 1825 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NCOA4Q13772 SFRP4-201ENST00000436072 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.5 ms