Protein–RNA interactions for Protein: Q13557

CAMK2D, Calcium/calmodulin-dependent protein kinase type II subunit delta, humanhuman

Predictions only

Length 499 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAMK2DQ13557 EIF5-202ENST00000392715 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CAMK2DQ13557 TSFM-201ENST00000323833 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CAMK2DQ13557 BEX2-202ENST00000372677 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CAMK2DQ13557 FAM159B-201ENST00000389074 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
CAMK2DQ13557 DSCR3-204ENST00000399001 821 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
CAMK2DQ13557 DHDDS-206ENST00000427245 868 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
CAMK2DQ13557 PSEN2-206ENST00000472139 1163 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
CAMK2DQ13557 GLI4-203ENST00000517468 963 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
CAMK2DQ13557 AC136475.2-201ENST00000526612 392 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
CAMK2DQ13557 AC067930.5-201ENST00000531730 1173 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
CAMK2DQ13557 POLD4-211ENST00000539074 714 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
CAMK2DQ13557 WASH4P-201ENST00000564273 1246 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
CAMK2DQ13557 AC124283.3-201ENST00000570869 594 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
CAMK2DQ13557 AC140912.1-201ENST00000577171 1054 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
CAMK2DQ13557 SPDYE22P-201ENST00000582158 798 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
CAMK2DQ13557 CTBP2P3-201ENST00000585629 1255 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
CAMK2DQ13557 ZNF83-215ENST00000600714 810 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
CAMK2DQ13557 HDDC2-203ENST00000608284 538 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
CAMK2DQ13557 ALDH3B1-203ENST00000612297 1231 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
CAMK2DQ13557 APOBEC3H-206ENST00000613677 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
CAMK2DQ13557 BX539320.1-201ENST00000623759 877 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
CAMK2DQ13557 SNUPN-206ENST00000564675 1682 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
CAMK2DQ13557 AC027601.5-201ENST00000624065 2482 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
CAMK2DQ13557 RNF123-202ENST00000432042 2670 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CAMK2DQ13557 IMPDH1-201ENST00000338791 2881 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
CAMK2DQ13557 DDR1-271ENST00000513240 2882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
CAMK2DQ13557 IMPDH1-217ENST00000626419 2862 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
CAMK2DQ13557 ANK1-202ENST00000289734 8297 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CAMK2DQ13557 FZD5-201ENST00000295417 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CAMK2DQ13557 TBC1D8B-203ENST00000357242 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CAMK2DQ13557 PTPRU-205ENST00000460170 5337 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CAMK2DQ13557 KIAA1211L-201ENST00000397899 3907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CAMK2DQ13557 SEPT9-220ENST00000588690 2919 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
CAMK2DQ13557 PROSER3-202ENST00000396908 2149 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CAMK2DQ13557 RDM1-224ENST00000619262 1535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CAMK2DQ13557 APP-205ENST00000358918 2366 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
CAMK2DQ13557 TEX13C-201ENST00000632600 5095 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
CAMK2DQ13557 PML-208ENST00000436891 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
CAMK2DQ13557 FXYD6-207ENST00000527717 1799 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
CAMK2DQ13557 TC2N-206ENST00000556018 1770 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
CAMK2DQ13557 PRR34-201ENST00000396008 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CAMK2DQ13557 ARFIP1-204ENST00000429148 1599 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
CAMK2DQ13557 LILRP1-201ENST00000444199 1370 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
CAMK2DQ13557 DEPTOR-203ENST00000523492 1397 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
CAMK2DQ13557 ZNF575-202ENST00000458714 2285 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
CAMK2DQ13557 PLEKHO2-202ENST00000616065 3569 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CAMK2DQ13557 NCKAP5L-201ENST00000335999 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
CAMK2DQ13557 GLG1-203ENST00000447066 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
CAMK2DQ13557 C15orf59-204ENST00000569673 6573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
CAMK2DQ13557 PRODH2-201ENST00000301175 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CAMK2DQ13557 HIF3A-218ENST00000600383 2101 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
CAMK2DQ13557 SBF1-202ENST00000380817 8008 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CAMK2DQ13557 CPSF7-205ENST00000439958 3524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CAMK2DQ13557 ARL10-201ENST00000310389 10845 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
CAMK2DQ13557 PRDM4-201ENST00000228437 4210 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
CAMK2DQ13557 RAPGEF4-201ENST00000397081 4299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CAMK2DQ13557 SYNRG-217ENST00000612223 8229 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CAMK2DQ13557 C9orf41-AS1-201ENST00000455609 719 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CAMK2DQ13557 LINC01089-209ENST00000542933 1220 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
CAMK2DQ13557 AC007569.1-201ENST00000550306 600 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
CAMK2DQ13557 C14orf178-204ENST00000557011 474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CAMK2DQ13557 GCHFR-203ENST00000558670 412 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
CAMK2DQ13557 AC005262.2-201ENST00000587701 452 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
CAMK2DQ13557 KISS1-202ENST00000625357 435 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
CAMK2DQ13557 AC010507.1-202ENST00000633286 381 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
CAMK2DQ13557 LINC01107-201ENST00000446979 1975 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
CAMK2DQ13557 ARMC5-202ENST00000408912 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
CAMK2DQ13557 STARD8-202ENST00000374597 4820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CAMK2DQ13557 ARPC4-TTLL3-201ENST00000397256 2466 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
CAMK2DQ13557 FOXL1-201ENST00000320241 3655 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
CAMK2DQ13557 GLUL-203ENST00000339526 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CAMK2DQ13557 NOX3-201ENST00000159060 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CAMK2DQ13557 SEMA3F-202ENST00000413852 3212 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CAMK2DQ13557 IL20RA-201ENST00000316649 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CAMK2DQ13557 TM4SF19-AS1-203ENST00000452051 1829 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
CAMK2DQ13557 VARS2-211ENST00000541562 3566 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
CAMK2DQ13557 CAMKK2-202ENST00000337174 5304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CAMK2DQ13557 SEC13-201ENST00000337354 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CAMK2DQ13557 TOM1L1-201ENST00000348161 1895 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
CAMK2DQ13557 RNF8-202ENST00000373479 5631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CAMK2DQ13557 ZNF890P-201ENST00000422060 1352 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
CAMK2DQ13557 NXPH1-201ENST00000405863 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CAMK2DQ13557 MAEL-202ENST00000367872 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CAMK2DQ13557 SIPA1-203ENST00000527525 3235 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
CAMK2DQ13557 NUTM2A-202ENST00000381707 3290 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CAMK2DQ13557 NUTM2B-203ENST00000429828 3292 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
CAMK2DQ13557 NUTM2E-201ENST00000429984 3292 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
CAMK2DQ13557 TMEM198B-201ENST00000471276 1958 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CAMK2DQ13557 HDAC2-206ENST00000519108 2000 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
CAMK2DQ13557 AC058822.1-201ENST00000507166 2550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
CAMK2DQ13557 INTS4P1-203ENST00000641008 3683 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
CAMK2DQ13557 PORCN-201ENST00000326194 1755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CAMK2DQ13557 TGFB1I1-201ENST00000361773 1773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CAMK2DQ13557 VEZF1-202ENST00000581208 2321 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CAMK2DQ13557 SLC26A11-201ENST00000361193 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CAMK2DQ13557 FBXL16-201ENST00000324361 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CAMK2DQ13557 POLL-205ENST00000370169 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CAMK2DQ13557 AGAP4-208ENST00000618171 2387 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
CAMK2DQ13557 TMEM91-202ENST00000356385 944 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CAMK2DQ13557 FAM104B-202ENST00000358460 1179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.3 ms